MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 463

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010816	T	6	6	2206	2211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010816	A	6	6	3219	3224	100 %	0 %	0 %	0 %	189438867
3	NC_010816	A	6	6	4503	4508	100 %	0 %	0 %	0 %	189438869
4	NC_010816	C	6	6	15894	15899	0 %	0 %	0 %	100 %	189438876
5	NC_010816	A	6	6	21079	21084	100 %	0 %	0 %	0 %	189438880
6	NC_010816	A	6	6	31375	31380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010816	T	7	7	31845	31851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010816	A	7	7	34418	34424	100 %	0 %	0 %	0 %	189438892
9	NC_010816	T	6	6	39090	39095	0 %	100 %	0 %	0 %	189438897
10	NC_010816	A	6	6	39633	39638	100 %	0 %	0 %	0 %	189438897
11	NC_010816	A	6	6	40559	40564	100 %	0 %	0 %	0 %	189438898
12	NC_010816	A	6	6	40981	40986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010816	T	6	6	41069	41074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010816	G	6	6	41466	41471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010816	A	6	6	47200	47205	100 %	0 %	0 %	0 %	189438902
16	NC_010816	A	6	6	48324	48329	100 %	0 %	0 %	0 %	189438903
17	NC_010816	A	6	6	53382	53387	100 %	0 %	0 %	0 %	189438906
18	NC_010816	T	6	6	55182	55187	0 %	100 %	0 %	0 %	189438907
19	NC_010816	A	6	6	56139	56144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010816	A	6	6	60919	60924	100 %	0 %	0 %	0 %	189438911
21	NC_010816	G	8	8	72354	72361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010816	T	6	6	74242	74247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010816	G	6	6	87464	87469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010816	G	6	6	93499	93504	0 %	0 %	100 %	0 %	189438934
25	NC_010816	T	6	6	93640	93645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010816	A	6	6	102573	102578	100 %	0 %	0 %	0 %	189438946
27	NC_010816	G	9	9	116874	116882	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010816	G	6	6	118108	118113	0 %	0 %	100 %	0 %	189438958
29	NC_010816	G	6	6	118701	118706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010816	T	6	6	120556	120561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010816	G	6	6	140595	140600	0 %	0 %	100 %	0 %	189438981
32	NC_010816	A	6	6	141751	141756	100 %	0 %	0 %	0 %	189438983
33	NC_010816	A	7	7	144343	144349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010816	A	7	7	145296	145302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010816	A	6	6	158256	158261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010816	A	6	6	161597	161602	100 %	0 %	0 %	0 %	189438998
37	NC_010816	T	6	6	168938	168943	0 %	100 %	0 %	0 %	189439006
38	NC_010816	A	6	6	171135	171140	100 %	0 %	0 %	0 %	189439008
39	NC_010816	A	6	6	171598	171603	100 %	0 %	0 %	0 %	189439008
40	NC_010816	A	6	6	176973	176978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010816	T	7	7	176994	177000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010816	T	6	6	177237	177242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010816	T	6	6	177470	177475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010816	T	7	7	177551	177557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010816	G	6	6	179674	179679	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010816	G	6	6	180331	180336	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010816	T	6	6	183651	183656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010816	T	7	7	183732	183738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010816	G	6	6	185857	185862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010816	G	6	6	186514	186519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010816	T	7	7	190152	190158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010816	A	6	6	196757	196762	100 %	0 %	0 %	0 %	189439019
53	NC_010816	A	6	6	200700	200705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010816	A	6	6	209900	209905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010816	T	6	6	210000	210005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010816	T	6	6	210036	210041	0 %	100 %	0 %	0 %	189439029
57	NC_010816	T	6	6	232021	232026	0 %	100 %	0 %	0 %	189439047
58	NC_010816	G	6	6	248339	248344	0 %	0 %	100 %	0 %	189439059
59	NC_010816	T	6	6	248829	248834	0 %	100 %	0 %	0 %	189439059
60	NC_010816	T	6	6	253833	253838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010816	A	6	6	257858	257863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010816	T	6	6	258508	258513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010816	G	7	7	268086	268092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010816	A	7	7	286365	286371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010816	A	6	6	287489	287494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010816	C	6	6	319287	319292	0 %	0 %	0 %	100 %	189439117
67	NC_010816	A	7	7	354728	354734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010816	T	6	6	356327	356332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010816	A	6	6	359642	359647	100 %	0 %	0 %	0 %	189439151
70	NC_010816	G	6	6	361645	361650	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010816	T	6	6	362354	362359	0 %	100 %	0 %	0 %	189439155
72	NC_010816	T	6	6	364520	364525	0 %	100 %	0 %	0 %	189439157
73	NC_010816	T	6	6	367099	367104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010816	G	7	7	384096	384102	0 %	0 %	100 %	0 %	189439167
75	NC_010816	C	6	6	385689	385694	0 %	0 %	0 %	100 %	189439169
76	NC_010816	A	7	7	395428	395434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010816	T	6	6	398921	398926	0 %	100 %	0 %	0 %	189439185
78	NC_010816	T	6	6	400131	400136	0 %	100 %	0 %	0 %	189439187
79	NC_010816	A	6	6	415763	415768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010816	A	6	6	426700	426705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010816	A	7	7	429399	429405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010816	T	6	6	443186	443191	0 %	100 %	0 %	0 %	189439231
83	NC_010816	T	6	6	463692	463697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010816	A	7	7	463814	463820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010816	T	6	6	466986	466991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010816	A	6	6	467107	467112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010816	C	6	6	469223	469228	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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89	NC_010816	T	8	8	483540	483547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010816	T	6	6	488277	488282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010816	T	6	6	496200	496205	0 %	100 %	0 %	0 %	189439280
92	NC_010816	G	8	8	500043	500050	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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94	NC_010816	T	8	8	518404	518411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010816	T	6	6	527092	527097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010816	T	6	6	532997	533002	0 %	100 %	0 %	0 %	189439309
97	NC_010816	T	6	6	535561	535566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010816	A	6	6	538017	538022	100 %	0 %	0 %	0 %	189439312
99	NC_010816	A	6	6	554329	554334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010816	G	6	6	559294	559299	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010816	T	6	6	574659	574664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010816	G	6	6	577454	577459	0 %	0 %	100 %	0 %	189439354
103	NC_010816	A	6	6	577500	577505	100 %	0 %	0 %	0 %	189439354
104	NC_010816	T	6	6	581157	581162	0 %	100 %	0 %	0 %	189439360
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106	NC_010816	G	6	6	590564	590569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010816	G	6	6	590582	590587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010816	T	6	6	591291	591296	0 %	100 %	0 %	0 %	189439372
109	NC_010816	T	6	6	594551	594556	0 %	100 %	0 %	0 %	189439378
110	NC_010816	A	6	6	594758	594763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_010816	A	6	6	597508	597513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010816	C	6	6	597902	597907	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_010816	A	6	6	604861	604866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010816	C	6	6	616076	616081	0 %	0 %	0 %	100 %	189439400
116	NC_010816	C	12	12	638722	638733	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_010816	G	6	6	641178	641183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010816	G	9	9	645174	645182	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010816	T	7	7	653300	653306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010816	T	6	6	657319	657324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010816	C	7	7	661533	661539	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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123	NC_010816	A	6	6	669045	669050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_010816	A	7	7	671420	671426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010816	T	6	6	679127	679132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010816	T	7	7	685858	685864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010816	T	6	6	695305	695310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_010816	T	6	6	699504	699509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_010816	A	8	8	773415	773422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_010816	T	6	6	797790	797795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010816	T	6	6	806146	806151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010816	T	6	6	808284	808289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.