MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Geobacter lovleyi SZ plasmid pGLOV01

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010815	ATCAGG	2	12	6034	6045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189426696
2	NC_010815	ACCGGA	2	12	8927	8938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189426699
3	NC_010815	ATCGGC	2	12	9149	9160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189426699
4	NC_010815	TACCGG	2	12	9361	9372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189426699
5	NC_010815	CAGTTT	2	12	11993	12004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189426702
6	NC_010815	TTCTGC	2	12	25096	25107	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189426714
7	NC_010815	CGGTGT	2	12	28148	28159	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189426718
8	NC_010815	GGTGTA	2	12	28323	28334	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	189426718
9	NC_010815	GCCAGC	2	12	30133	30144	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189426718
10	NC_010815	CCCTGT	2	12	31423	31434	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	189426719
11	NC_010815	TCCCGC	2	12	31994	32005	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	189426720
12	NC_010815	GTCTGG	2	12	34316	34327	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189426721
13	NC_010815	ACCCCG	2	12	35024	35035	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	189426722
14	NC_010815	CAGGCC	2	12	36136	36147	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189426722
15	NC_010815	GGGGCT	2	12	37032	37043	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	189426722
16	NC_010815	TTGAGG	2	12	38280	38291	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	189426724
17	NC_010815	TGCTTC	2	12	40531	40542	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189426727
18	NC_010815	CCAAAA	2	12	42501	42512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189426729
19	NC_010815	TCAGAC	2	12	43808	43819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189426729
20	NC_010815	CCTTCC	2	12	43932	43943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189426729
21	NC_010815	ATTTGA	2	12	50313	50324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189426738
22	NC_010815	CGTAAT	2	12	62783	62794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189426753
23	NC_010815	TTTGTC	2	12	63571	63582	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189426754
24	NC_010815	GTCGGT	2	12	68299	68310	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189426759
25	NC_010815	TTTGCC	2	12	68953	68964	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189426760
26	NC_010815	TCCTTA	2	12	69463	69474	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189426761

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.