MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Geobacter lovleyi SZ plasmid pGLOV01

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010815	AGCAC	2	10	1044	1053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010815	TTCCT	2	10	4714	4723	0 %	60 %	0 %	40 %	189426695
3	NC_010815	GGCAG	2	10	4961	4970	20 %	0 %	60 %	20 %	189426695
4	NC_010815	TCTGT	2	10	6125	6134	0 %	60 %	20 %	20 %	189426696
5	NC_010815	ACCTG	2	10	8190	8199	20 %	20 %	20 %	40 %	189426699
6	NC_010815	GGCAG	2	10	8283	8292	20 %	0 %	60 %	20 %	189426699
7	NC_010815	ATCAG	2	10	11982	11991	40 %	20 %	20 %	20 %	189426702
8	NC_010815	TGTTC	2	10	12402	12411	0 %	60 %	20 %	20 %	189426703
9	NC_010815	ACAAA	2	10	13229	13238	80 %	0 %	0 %	20 %	189426704
10	NC_010815	TGATT	2	10	13736	13745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010815	GTTTG	2	10	15953	15962	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010815	GTTGA	2	10	17248	17257	20 %	40 %	40 %	0 %	189426709
13	NC_010815	GATCA	2	10	20915	20924	40 %	20 %	20 %	20 %	189426711
14	NC_010815	GCAGC	2	10	21635	21644	20 %	0 %	40 %	40 %	189426712
15	NC_010815	GCCGC	2	10	22336	22345	0 %	0 %	40 %	60 %	189426714
16	NC_010815	GCCGC	2	10	22423	22432	0 %	0 %	40 %	60 %	189426714
17	NC_010815	CTGCG	2	10	22464	22473	0 %	20 %	40 %	40 %	189426714
18	NC_010815	GCCGC	2	10	24381	24390	0 %	0 %	40 %	60 %	189426714
19	NC_010815	CTGAC	2	10	27860	27869	20 %	20 %	20 %	40 %	189426717
20	NC_010815	TTCTG	2	10	28366	28375	0 %	60 %	20 %	20 %	189426718
21	NC_010815	GCCCG	2	10	29067	29076	0 %	0 %	40 %	60 %	189426718
22	NC_010815	GCGGA	2	10	31330	31339	20 %	0 %	60 %	20 %	189426719
23	NC_010815	CGTAT	2	10	32440	32449	20 %	40 %	20 %	20 %	189426720
24	NC_010815	GCCAT	2	10	32630	32639	20 %	20 %	20 %	40 %	189426720
25	NC_010815	TCAGC	2	10	33015	33024	20 %	20 %	20 %	40 %	189426720
26	NC_010815	GCAGC	2	10	33620	33629	20 %	0 %	40 %	40 %	189426721
27	NC_010815	GGCCG	2	10	33958	33967	0 %	0 %	60 %	40 %	189426721
28	NC_010815	CGAGC	2	10	34282	34291	20 %	0 %	40 %	40 %	189426721
29	NC_010815	TTTCA	2	10	34637	34646	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010815	CCCGG	2	10	35196	35205	0 %	0 %	40 %	60 %	189426722
31	NC_010815	GGGCC	2	10	36117	36126	0 %	0 %	60 %	40 %	189426722
32	NC_010815	CCTGG	2	10	36876	36885	0 %	20 %	40 %	40 %	189426722
33	NC_010815	CAGAA	2	10	37067	37076	60 %	0 %	20 %	20 %	189426722
34	NC_010815	ACAAT	2	10	38203	38212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010815	TATAT	2	10	39590	39599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010815	ATTGT	2	10	39925	39934	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010815	ACGGC	2	10	40439	40448	20 %	0 %	40 %	40 %	189426727
38	NC_010815	ACAAT	2	10	41060	41069	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010815	CATGG	2	10	42812	42821	20 %	20 %	40 %	20 %	189426729
40	NC_010815	AGGGC	2	10	43246	43255	20 %	0 %	60 %	20 %	189426729
41	NC_010815	CATGG	2	10	43878	43887	20 %	20 %	40 %	20 %	189426729
42	NC_010815	GCTGA	2	10	44045	44054	20 %	20 %	40 %	20 %	189426729
43	NC_010815	CGCTG	2	10	45354	45363	0 %	20 %	40 %	40 %	189426731
44	NC_010815	CCGTT	2	10	51105	51114	0 %	40 %	20 %	40 %	189426739
45	NC_010815	CCCCT	2	10	52232	52241	0 %	20 %	0 %	80 %	189426741
46	NC_010815	GCATT	2	10	52320	52329	20 %	40 %	20 %	20 %	189426741
47	NC_010815	ATGGG	2	10	53888	53897	20 %	20 %	60 %	0 %	189426741
48	NC_010815	AGAGA	2	10	57592	57601	60 %	0 %	40 %	0 %	189426746
49	NC_010815	AGTGA	2	10	57997	58006	40 %	20 %	40 %	0 %	189426746
50	NC_010815	GGCTT	2	10	58091	58100	0 %	40 %	40 %	20 %	189426746
51	NC_010815	GCTTG	2	10	61112	61121	0 %	40 %	40 %	20 %	189426751
52	NC_010815	CCCCA	2	10	62166	62175	20 %	0 %	0 %	80 %	189426752
53	NC_010815	CATCT	2	10	62280	62289	20 %	40 %	0 %	40 %	189426753
54	NC_010815	ATCCT	2	10	62815	62824	20 %	40 %	0 %	40 %	189426753
55	NC_010815	GGGGT	2	10	63771	63780	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010815	ATCGC	2	10	64377	64386	20 %	20 %	20 %	40 %	189426756
57	NC_010815	CCGCT	2	10	66092	66101	0 %	20 %	20 %	60 %	189426758
58	NC_010815	GTGCT	2	10	66181	66190	0 %	40 %	40 %	20 %	189426758
59	NC_010815	ATCGT	2	10	67228	67237	20 %	40 %	20 %	20 %	189426758
60	NC_010815	TCACA	2	10	67421	67430	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010815	GAATC	2	10	67460	67469	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010815	AAAGA	2	10	68056	68065	80 %	0 %	20 %	0 %	189426759
63	NC_010815	GCAGA	2	10	71137	71146	40 %	0 %	40 %	20 %	189426762
64	NC_010815	TCCAT	2	10	73611	73620	20 %	40 %	0 %	40 %	189426764
65	NC_010815	AGCAA	2	10	77040	77049	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.