MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Geobacter lovleyi SZ plasmid pGLOV01

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010815	TATT	2	8	691	698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010815	TCAG	2	8	1258	1265	25 %	25 %	25 %	25 %	189426690
3	NC_010815	CTGG	2	8	1774	1781	0 %	25 %	50 %	25 %	189426691
4	NC_010815	CGGA	2	8	3353	3360	25 %	0 %	50 %	25 %	189426693
5	NC_010815	CAGC	2	8	3463	3470	25 %	0 %	25 %	50 %	189426693
6	NC_010815	GTCA	2	8	3678	3685	25 %	25 %	25 %	25 %	189426693
7	NC_010815	GGCT	2	8	4237	4244	0 %	25 %	50 %	25 %	189426694
8	NC_010815	CGTC	2	8	4280	4287	0 %	25 %	25 %	50 %	189426694
9	NC_010815	ATAC	2	8	4614	4621	50 %	25 %	0 %	25 %	189426694
10	NC_010815	CCAG	2	8	4752	4759	25 %	0 %	25 %	50 %	189426695
11	NC_010815	CAGC	2	8	5007	5014	25 %	0 %	25 %	50 %	189426695
12	NC_010815	ACCC	2	8	5479	5486	25 %	0 %	0 %	75 %	189426695
13	NC_010815	ACTC	2	8	5773	5780	25 %	25 %	0 %	50 %	189426695
14	NC_010815	CGAC	2	8	6212	6219	25 %	0 %	25 %	50 %	189426696
15	NC_010815	ACGG	2	8	6338	6345	25 %	0 %	50 %	25 %	189426696
16	NC_010815	AGCC	2	8	6586	6593	25 %	0 %	25 %	50 %	189426697
17	NC_010815	GCCA	2	8	6680	6687	25 %	0 %	25 %	50 %	189426697
18	NC_010815	TGGT	2	8	7278	7285	0 %	50 %	50 %	0 %	189426697
19	NC_010815	GATT	2	8	7654	7661	25 %	50 %	25 %	0 %	189426698
20	NC_010815	AGAT	2	8	8466	8473	50 %	25 %	25 %	0 %	189426699
21	NC_010815	GGCA	2	8	8490	8497	25 %	0 %	50 %	25 %	189426699
22	NC_010815	CTGC	2	8	8802	8809	0 %	25 %	25 %	50 %	189426699
23	NC_010815	CCAG	2	8	9058	9065	25 %	0 %	25 %	50 %	189426699
24	NC_010815	GCCA	2	8	9246	9253	25 %	0 %	25 %	50 %	189426699
25	NC_010815	CAGC	2	8	9630	9637	25 %	0 %	25 %	50 %	189426700
26	NC_010815	CAGC	2	8	9849	9856	25 %	0 %	25 %	50 %	189426700
27	NC_010815	TGCC	2	8	10188	10195	0 %	25 %	25 %	50 %	189426700
28	NC_010815	GGTC	2	8	10506	10513	0 %	25 %	50 %	25 %	189426700
29	NC_010815	TTGA	2	8	10558	10565	25 %	50 %	25 %	0 %	189426700
30	NC_010815	TGGC	2	8	10613	10620	0 %	25 %	50 %	25 %	189426700
31	NC_010815	CAGG	2	8	10765	10772	25 %	0 %	50 %	25 %	189426700
32	NC_010815	AACC	2	8	11297	11304	50 %	0 %	0 %	50 %	189426701
33	NC_010815	TGGC	2	8	11460	11467	0 %	25 %	50 %	25 %	189426701
34	NC_010815	CCAG	2	8	12273	12280	25 %	0 %	25 %	50 %	189426702
35	NC_010815	ATCA	2	8	12383	12390	50 %	25 %	0 %	25 %	189426702
36	NC_010815	AGCG	2	8	12776	12783	25 %	0 %	50 %	25 %	189426704
37	NC_010815	CAAC	2	8	14061	14068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010815	AACA	2	8	14195	14202	75 %	0 %	0 %	25 %	189426705
39	NC_010815	AAAC	2	8	14272	14279	75 %	0 %	0 %	25 %	189426705
40	NC_010815	CAAA	2	8	14779	14786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010815	CCGC	2	8	16275	16282	0 %	0 %	25 %	75 %	189426708
42	NC_010815	ATGG	2	8	16895	16902	25 %	25 %	50 %	0 %	189426708
43	NC_010815	AGAT	2	8	17903	17910	50 %	25 %	25 %	0 %	189426709
44	NC_010815	ACCA	2	8	18376	18383	50 %	0 %	0 %	50 %	189426709
45	NC_010815	CTTT	2	8	18678	18685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010815	GTCC	2	8	18730	18737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010815	TCTG	2	8	19285	19292	0 %	50 %	25 %	25 %	189426710
48	NC_010815	CCAA	2	8	19472	19479	50 %	0 %	0 %	50 %	189426710
49	NC_010815	CAAG	2	8	19810	19817	50 %	0 %	25 %	25 %	189426710
50	NC_010815	CCAG	2	8	20209	20216	25 %	0 %	25 %	50 %	189426710
51	NC_010815	ACTG	2	8	21074	21081	25 %	25 %	25 %	25 %	189426711
52	NC_010815	GTTG	2	8	21577	21584	0 %	50 %	50 %	0 %	189426712
53	NC_010815	AAGA	2	8	21591	21598	75 %	0 %	25 %	0 %	189426712
54	NC_010815	AGCC	2	8	21904	21911	25 %	0 %	25 %	50 %	189426713
55	NC_010815	TTTC	2	8	22361	22368	0 %	75 %	0 %	25 %	189426714
56	NC_010815	CTGA	2	8	22748	22755	25 %	25 %	25 %	25 %	189426714
57	NC_010815	CCTT	2	8	22933	22940	0 %	50 %	0 %	50 %	189426714
58	NC_010815	GAAA	2	8	23114	23121	75 %	0 %	25 %	0 %	189426714
59	NC_010815	CTGC	2	8	24161	24168	0 %	25 %	25 %	50 %	189426714
60	NC_010815	AACG	2	8	24686	24693	50 %	0 %	25 %	25 %	189426714
61	NC_010815	CGGG	2	8	25164	25171	0 %	0 %	75 %	25 %	189426714
62	NC_010815	AATC	2	8	25541	25548	50 %	25 %	0 %	25 %	189426714
63	NC_010815	AGAT	2	8	25684	25691	50 %	25 %	25 %	0 %	189426714
64	NC_010815	CCCT	2	8	25788	25795	0 %	25 %	0 %	75 %	189426714
65	NC_010815	CTGC	2	8	27022	27029	0 %	25 %	25 %	50 %	189426716
66	NC_010815	CAGA	2	8	27625	27632	50 %	0 %	25 %	25 %	189426717
67	NC_010815	CAGC	2	8	27697	27704	25 %	0 %	25 %	50 %	189426717
68	NC_010815	GCTG	2	8	28517	28524	0 %	25 %	50 %	25 %	189426718
69	NC_010815	CGGT	2	8	28873	28880	0 %	25 %	50 %	25 %	189426718
70	NC_010815	CCAC	2	8	28978	28985	25 %	0 %	0 %	75 %	189426718
71	NC_010815	AGGT	2	8	29299	29306	25 %	25 %	50 %	0 %	189426718
72	NC_010815	GGAA	2	8	29370	29377	50 %	0 %	50 %	0 %	189426718
73	NC_010815	CCAG	2	8	29481	29488	25 %	0 %	25 %	50 %	189426718
74	NC_010815	CTAC	2	8	30234	30241	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010815	TATT	2	8	32018	32025	25 %	75 %	0 %	0 %	189426720
76	NC_010815	GCGG	2	8	32143	32150	0 %	0 %	75 %	25 %	189426720
77	NC_010815	CAGC	2	8	32343	32350	25 %	0 %	25 %	50 %	189426720
78	NC_010815	GCCG	2	8	32992	32999	0 %	0 %	50 %	50 %	189426720
79	NC_010815	GCCC	2	8	33663	33670	0 %	0 %	25 %	75 %	189426721
80	NC_010815	TGAT	2	8	34498	34505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010815	CGTT	2	8	34705	34712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010815	CCGG	2	8	34913	34920	0 %	0 %	50 %	50 %	189426722
83	NC_010815	TTGA	2	8	34990	34997	25 %	50 %	25 %	0 %	189426722
84	NC_010815	GCCA	2	8	35374	35381	25 %	0 %	25 %	50 %	189426722
85	NC_010815	CAGC	2	8	35384	35391	25 %	0 %	25 %	50 %	189426722
86	NC_010815	GCCA	2	8	35431	35438	25 %	0 %	25 %	50 %	189426722
87	NC_010815	GGTC	2	8	35579	35586	0 %	25 %	50 %	25 %	189426722
88	NC_010815	GCGG	2	8	35613	35620	0 %	0 %	75 %	25 %	189426722
89	NC_010815	AACC	2	8	35924	35931	50 %	0 %	0 %	50 %	189426722
90	NC_010815	GGGC	2	8	36350	36357	0 %	0 %	75 %	25 %	189426722
91	NC_010815	TTAT	2	8	37656	37663	25 %	75 %	0 %	0 %	189426723
92	NC_010815	GCTC	2	8	37815	37822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010815	ATAA	2	8	38112	38119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010815	TAAA	2	8	38129	38136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010815	GTTT	2	8	38953	38960	0 %	75 %	25 %	0 %	189426724
96	NC_010815	TATT	2	8	39575	39582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010815	TATG	2	8	39816	39823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010815	GCAT	2	8	39859	39866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010815	GCCA	2	8	40672	40679	25 %	0 %	25 %	50 %	189426727
100	NC_010815	CGCC	2	8	40739	40746	0 %	0 %	25 %	75 %	189426727
101	NC_010815	CAGG	2	8	41456	41463	25 %	0 %	50 %	25 %	189426728
102	NC_010815	CAGG	2	8	42532	42539	25 %	0 %	50 %	25 %	189426729
103	NC_010815	CAGA	2	8	43156	43163	50 %	0 %	25 %	25 %	189426729
104	NC_010815	GCGA	2	8	43280	43287	25 %	0 %	50 %	25 %	189426729
105	NC_010815	CAAC	2	8	44080	44087	50 %	0 %	0 %	50 %	189426729
106	NC_010815	TGGC	2	8	44146	44153	0 %	25 %	50 %	25 %	189426729
107	NC_010815	CCTG	2	8	44161	44168	0 %	25 %	25 %	50 %	189426729
108	NC_010815	TCAG	2	8	44393	44400	25 %	25 %	25 %	25 %	189426730
109	NC_010815	GGCT	2	8	44583	44590	0 %	25 %	50 %	25 %	189426731
110	NC_010815	TGGC	2	8	44789	44796	0 %	25 %	50 %	25 %	189426731
111	NC_010815	TTGT	2	8	45172	45179	0 %	75 %	25 %	0 %	189426731
112	NC_010815	CTGC	2	8	45499	45506	0 %	25 %	25 %	50 %	189426731
113	NC_010815	GCTT	2	8	46070	46077	0 %	50 %	25 %	25 %	189426732
114	NC_010815	CCGG	2	8	47177	47184	0 %	0 %	50 %	50 %	189426733
115	NC_010815	TGGC	2	8	47365	47372	0 %	25 %	50 %	25 %	189426733
116	NC_010815	CCAG	2	8	47561	47568	25 %	0 %	25 %	50 %	189426734
117	NC_010815	TATC	2	8	48777	48784	25 %	50 %	0 %	25 %	189426736
118	NC_010815	TAAA	2	8	49315	49322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010815	CAAA	2	8	49364	49371	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010815	AAAT	2	8	49564	49571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010815	GTAT	2	8	49638	49645	25 %	50 %	25 %	0 %	189426738
122	NC_010815	CAGT	2	8	50077	50084	25 %	25 %	25 %	25 %	189426738
123	NC_010815	ATAA	2	8	50158	50165	75 %	25 %	0 %	0 %	189426738
124	NC_010815	TTCT	2	8	50297	50304	0 %	75 %	0 %	25 %	189426738
125	NC_010815	ACGA	2	8	50495	50502	50 %	0 %	25 %	25 %	189426738
126	NC_010815	CAAA	2	8	51900	51907	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010815	CATT	2	8	51953	51960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010815	GACA	2	8	52368	52375	50 %	0 %	25 %	25 %	189426741
129	NC_010815	ACAG	2	8	53126	53133	50 %	0 %	25 %	25 %	189426741
130	NC_010815	GCAA	2	8	53336	53343	50 %	0 %	25 %	25 %	189426741
131	NC_010815	GACA	2	8	53556	53563	50 %	0 %	25 %	25 %	189426741
132	NC_010815	CCCG	2	8	54449	54456	0 %	0 %	25 %	75 %	189426741
133	NC_010815	CAGC	2	8	54474	54481	25 %	0 %	25 %	50 %	189426741
134	NC_010815	AGTT	2	8	54974	54981	25 %	50 %	25 %	0 %	189426741
135	NC_010815	GGTT	2	8	55054	55061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010815	TGCG	2	8	55208	55215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010815	GATT	2	8	55297	55304	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010815	AGCT	2	8	55531	55538	25 %	25 %	25 %	25 %	189426742
139	NC_010815	TCAG	2	8	56355	56362	25 %	25 %	25 %	25 %	189426743
140	NC_010815	TGTC	2	8	56853	56860	0 %	50 %	25 %	25 %	189426744
141	NC_010815	GTCC	2	8	56957	56964	0 %	25 %	25 %	50 %	189426745
142	NC_010815	GAGG	2	8	57910	57917	25 %	0 %	75 %	0 %	189426746
143	NC_010815	CCGA	2	8	58079	58086	25 %	0 %	25 %	50 %	189426746
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.