MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Geobacter lovleyi SZ plasmid pGLOV01

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010815	TCAG	2	8	1258	1265	25 %	25 %	25 %	25 %	189426690
2	NC_010815	CTGG	2	8	1774	1781	0 %	25 %	50 %	25 %	189426691
3	NC_010815	CGGA	2	8	3353	3360	25 %	0 %	50 %	25 %	189426693
4	NC_010815	CAGC	2	8	3463	3470	25 %	0 %	25 %	50 %	189426693
5	NC_010815	GTCA	2	8	3678	3685	25 %	25 %	25 %	25 %	189426693
6	NC_010815	GGCT	2	8	4237	4244	0 %	25 %	50 %	25 %	189426694
7	NC_010815	CGTC	2	8	4280	4287	0 %	25 %	25 %	50 %	189426694
8	NC_010815	ATAC	2	8	4614	4621	50 %	25 %	0 %	25 %	189426694
9	NC_010815	CCAG	2	8	4752	4759	25 %	0 %	25 %	50 %	189426695
10	NC_010815	CAGC	2	8	5007	5014	25 %	0 %	25 %	50 %	189426695
11	NC_010815	ACCC	2	8	5479	5486	25 %	0 %	0 %	75 %	189426695
12	NC_010815	ACTC	2	8	5773	5780	25 %	25 %	0 %	50 %	189426695
13	NC_010815	CGAC	2	8	6212	6219	25 %	0 %	25 %	50 %	189426696
14	NC_010815	ACGG	2	8	6338	6345	25 %	0 %	50 %	25 %	189426696
15	NC_010815	AGCC	2	8	6586	6593	25 %	0 %	25 %	50 %	189426697
16	NC_010815	GCCA	2	8	6680	6687	25 %	0 %	25 %	50 %	189426697
17	NC_010815	TGGT	2	8	7278	7285	0 %	50 %	50 %	0 %	189426697
18	NC_010815	GATT	2	8	7654	7661	25 %	50 %	25 %	0 %	189426698
19	NC_010815	AGAT	2	8	8466	8473	50 %	25 %	25 %	0 %	189426699
20	NC_010815	GGCA	2	8	8490	8497	25 %	0 %	50 %	25 %	189426699
21	NC_010815	CTGC	2	8	8802	8809	0 %	25 %	25 %	50 %	189426699
22	NC_010815	CCAG	2	8	9058	9065	25 %	0 %	25 %	50 %	189426699
23	NC_010815	GCCA	2	8	9246	9253	25 %	0 %	25 %	50 %	189426699
24	NC_010815	CAGC	2	8	9630	9637	25 %	0 %	25 %	50 %	189426700
25	NC_010815	CAGC	2	8	9849	9856	25 %	0 %	25 %	50 %	189426700
26	NC_010815	TGCC	2	8	10188	10195	0 %	25 %	25 %	50 %	189426700
27	NC_010815	GGTC	2	8	10506	10513	0 %	25 %	50 %	25 %	189426700
28	NC_010815	TTGA	2	8	10558	10565	25 %	50 %	25 %	0 %	189426700
29	NC_010815	TGGC	2	8	10613	10620	0 %	25 %	50 %	25 %	189426700
30	NC_010815	CAGG	2	8	10765	10772	25 %	0 %	50 %	25 %	189426700
31	NC_010815	AACC	2	8	11297	11304	50 %	0 %	0 %	50 %	189426701
32	NC_010815	TGGC	2	8	11460	11467	0 %	25 %	50 %	25 %	189426701
33	NC_010815	CCAG	2	8	12273	12280	25 %	0 %	25 %	50 %	189426702
34	NC_010815	ATCA	2	8	12383	12390	50 %	25 %	0 %	25 %	189426702
35	NC_010815	AGCG	2	8	12776	12783	25 %	0 %	50 %	25 %	189426704
36	NC_010815	AACA	2	8	14195	14202	75 %	0 %	0 %	25 %	189426705
37	NC_010815	AAAC	2	8	14272	14279	75 %	0 %	0 %	25 %	189426705
38	NC_010815	CCGC	2	8	16275	16282	0 %	0 %	25 %	75 %	189426708
39	NC_010815	ATGG	2	8	16895	16902	25 %	25 %	50 %	0 %	189426708
40	NC_010815	AGAT	2	8	17903	17910	50 %	25 %	25 %	0 %	189426709
41	NC_010815	ACCA	2	8	18376	18383	50 %	0 %	0 %	50 %	189426709
42	NC_010815	TCTG	2	8	19285	19292	0 %	50 %	25 %	25 %	189426710
43	NC_010815	CCAA	2	8	19472	19479	50 %	0 %	0 %	50 %	189426710
44	NC_010815	CAAG	2	8	19810	19817	50 %	0 %	25 %	25 %	189426710
45	NC_010815	CCAG	2	8	20209	20216	25 %	0 %	25 %	50 %	189426710
46	NC_010815	ACTG	2	8	21074	21081	25 %	25 %	25 %	25 %	189426711
47	NC_010815	GTTG	2	8	21577	21584	0 %	50 %	50 %	0 %	189426712
48	NC_010815	AAGA	2	8	21591	21598	75 %	0 %	25 %	0 %	189426712
49	NC_010815	AGCC	2	8	21904	21911	25 %	0 %	25 %	50 %	189426713
50	NC_010815	TTTC	2	8	22361	22368	0 %	75 %	0 %	25 %	189426714
51	NC_010815	CTGA	2	8	22748	22755	25 %	25 %	25 %	25 %	189426714
52	NC_010815	CCTT	2	8	22933	22940	0 %	50 %	0 %	50 %	189426714
53	NC_010815	GAAA	2	8	23114	23121	75 %	0 %	25 %	0 %	189426714
54	NC_010815	CTGC	2	8	24161	24168	0 %	25 %	25 %	50 %	189426714
55	NC_010815	AACG	2	8	24686	24693	50 %	0 %	25 %	25 %	189426714
56	NC_010815	CGGG	2	8	25164	25171	0 %	0 %	75 %	25 %	189426714
57	NC_010815	AATC	2	8	25541	25548	50 %	25 %	0 %	25 %	189426714
58	NC_010815	AGAT	2	8	25684	25691	50 %	25 %	25 %	0 %	189426714
59	NC_010815	CCCT	2	8	25788	25795	0 %	25 %	0 %	75 %	189426714
60	NC_010815	CTGC	2	8	27022	27029	0 %	25 %	25 %	50 %	189426716
61	NC_010815	CAGA	2	8	27625	27632	50 %	0 %	25 %	25 %	189426717
62	NC_010815	CAGC	2	8	27697	27704	25 %	0 %	25 %	50 %	189426717
63	NC_010815	GCTG	2	8	28517	28524	0 %	25 %	50 %	25 %	189426718
64	NC_010815	CGGT	2	8	28873	28880	0 %	25 %	50 %	25 %	189426718
65	NC_010815	CCAC	2	8	28978	28985	25 %	0 %	0 %	75 %	189426718
66	NC_010815	AGGT	2	8	29299	29306	25 %	25 %	50 %	0 %	189426718
67	NC_010815	GGAA	2	8	29370	29377	50 %	0 %	50 %	0 %	189426718
68	NC_010815	CCAG	2	8	29481	29488	25 %	0 %	25 %	50 %	189426718
69	NC_010815	TATT	2	8	32018	32025	25 %	75 %	0 %	0 %	189426720
70	NC_010815	GCGG	2	8	32143	32150	0 %	0 %	75 %	25 %	189426720
71	NC_010815	CAGC	2	8	32343	32350	25 %	0 %	25 %	50 %	189426720
72	NC_010815	GCCG	2	8	32992	32999	0 %	0 %	50 %	50 %	189426720
73	NC_010815	GCCC	2	8	33663	33670	0 %	0 %	25 %	75 %	189426721
74	NC_010815	CCGG	2	8	34913	34920	0 %	0 %	50 %	50 %	189426722
75	NC_010815	TTGA	2	8	34990	34997	25 %	50 %	25 %	0 %	189426722
76	NC_010815	GCCA	2	8	35374	35381	25 %	0 %	25 %	50 %	189426722
77	NC_010815	CAGC	2	8	35384	35391	25 %	0 %	25 %	50 %	189426722
78	NC_010815	GCCA	2	8	35431	35438	25 %	0 %	25 %	50 %	189426722
79	NC_010815	GGTC	2	8	35579	35586	0 %	25 %	50 %	25 %	189426722
80	NC_010815	GCGG	2	8	35613	35620	0 %	0 %	75 %	25 %	189426722
81	NC_010815	AACC	2	8	35924	35931	50 %	0 %	0 %	50 %	189426722
82	NC_010815	GGGC	2	8	36350	36357	0 %	0 %	75 %	25 %	189426722
83	NC_010815	TTAT	2	8	37656	37663	25 %	75 %	0 %	0 %	189426723
84	NC_010815	GTTT	2	8	38953	38960	0 %	75 %	25 %	0 %	189426724
85	NC_010815	GCCA	2	8	40672	40679	25 %	0 %	25 %	50 %	189426727
86	NC_010815	CGCC	2	8	40739	40746	0 %	0 %	25 %	75 %	189426727
87	NC_010815	CAGG	2	8	41456	41463	25 %	0 %	50 %	25 %	189426728
88	NC_010815	CAGG	2	8	42532	42539	25 %	0 %	50 %	25 %	189426729
89	NC_010815	CAGA	2	8	43156	43163	50 %	0 %	25 %	25 %	189426729
90	NC_010815	GCGA	2	8	43280	43287	25 %	0 %	50 %	25 %	189426729
91	NC_010815	CAAC	2	8	44080	44087	50 %	0 %	0 %	50 %	189426729
92	NC_010815	TGGC	2	8	44146	44153	0 %	25 %	50 %	25 %	189426729
93	NC_010815	CCTG	2	8	44161	44168	0 %	25 %	25 %	50 %	189426729
94	NC_010815	TCAG	2	8	44393	44400	25 %	25 %	25 %	25 %	189426730
95	NC_010815	GGCT	2	8	44583	44590	0 %	25 %	50 %	25 %	189426731
96	NC_010815	TGGC	2	8	44789	44796	0 %	25 %	50 %	25 %	189426731
97	NC_010815	TTGT	2	8	45172	45179	0 %	75 %	25 %	0 %	189426731
98	NC_010815	CTGC	2	8	45499	45506	0 %	25 %	25 %	50 %	189426731
99	NC_010815	GCTT	2	8	46070	46077	0 %	50 %	25 %	25 %	189426732
100	NC_010815	CCGG	2	8	47177	47184	0 %	0 %	50 %	50 %	189426733
101	NC_010815	TGGC	2	8	47365	47372	0 %	25 %	50 %	25 %	189426733
102	NC_010815	CCAG	2	8	47561	47568	25 %	0 %	25 %	50 %	189426734
103	NC_010815	TATC	2	8	48777	48784	25 %	50 %	0 %	25 %	189426736
104	NC_010815	GTAT	2	8	49638	49645	25 %	50 %	25 %	0 %	189426738
105	NC_010815	CAGT	2	8	50077	50084	25 %	25 %	25 %	25 %	189426738
106	NC_010815	ATAA	2	8	50158	50165	75 %	25 %	0 %	0 %	189426738
107	NC_010815	TTCT	2	8	50297	50304	0 %	75 %	0 %	25 %	189426738
108	NC_010815	ACGA	2	8	50495	50502	50 %	0 %	25 %	25 %	189426738
109	NC_010815	GACA	2	8	52368	52375	50 %	0 %	25 %	25 %	189426741
110	NC_010815	ACAG	2	8	53126	53133	50 %	0 %	25 %	25 %	189426741
111	NC_010815	GCAA	2	8	53336	53343	50 %	0 %	25 %	25 %	189426741
112	NC_010815	GACA	2	8	53556	53563	50 %	0 %	25 %	25 %	189426741
113	NC_010815	CCCG	2	8	54449	54456	0 %	0 %	25 %	75 %	189426741
114	NC_010815	CAGC	2	8	54474	54481	25 %	0 %	25 %	50 %	189426741
115	NC_010815	AGTT	2	8	54974	54981	25 %	50 %	25 %	0 %	189426741
116	NC_010815	AGCT	2	8	55531	55538	25 %	25 %	25 %	25 %	189426742
117	NC_010815	TCAG	2	8	56355	56362	25 %	25 %	25 %	25 %	189426743
118	NC_010815	TGTC	2	8	56853	56860	0 %	50 %	25 %	25 %	189426744
119	NC_010815	GTCC	2	8	56957	56964	0 %	25 %	25 %	50 %	189426745
120	NC_010815	GAGG	2	8	57910	57917	25 %	0 %	75 %	0 %	189426746
121	NC_010815	CCGA	2	8	58079	58086	25 %	0 %	25 %	50 %	189426746
122	NC_010815	GAAA	2	8	58475	58482	75 %	0 %	25 %	0 %	189426747
123	NC_010815	GGTT	2	8	58520	58527	0 %	50 %	50 %	0 %	189426747
124	NC_010815	CTGG	2	8	58879	58886	0 %	25 %	50 %	25 %	189426748
125	NC_010815	CCTG	2	8	59334	59341	0 %	25 %	25 %	50 %	189426749
126	NC_010815	TTGT	2	8	60546	60553	0 %	75 %	25 %	0 %	189426751
127	NC_010815	TCGG	2	8	60861	60868	0 %	25 %	50 %	25 %	189426751
128	NC_010815	GATG	2	8	61211	61218	25 %	25 %	50 %	0 %	189426751
129	NC_010815	GCTT	2	8	61616	61623	0 %	50 %	25 %	25 %	189426752
130	NC_010815	GTTT	2	8	61701	61708	0 %	75 %	25 %	0 %	189426752
131	NC_010815	AGCC	2	8	61757	61764	25 %	0 %	25 %	50 %	189426752
132	NC_010815	AGCC	2	8	62078	62085	25 %	0 %	25 %	50 %	189426752
133	NC_010815	AGGA	2	8	64059	64066	50 %	0 %	50 %	0 %	189426755
134	NC_010815	GTCG	2	8	64367	64374	0 %	25 %	50 %	25 %	189426756
135	NC_010815	GGCT	2	8	64559	64566	0 %	25 %	50 %	25 %	189426756
136	NC_010815	GGTT	2	8	65793	65800	0 %	50 %	50 %	0 %	189426757
137	NC_010815	GCCG	2	8	66406	66413	0 %	0 %	50 %	50 %	189426758
138	NC_010815	CGGG	2	8	66616	66623	0 %	0 %	75 %	25 %	189426758
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.