MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter lovleyi SZ chromosome

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010814	GGCTGA	2	12	62045	62056	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010814	CAATAT	2	12	114140	114151	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010814	TGAATA	2	12	114565	114576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010814	GGAATC	2	12	118001	118012	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010814	TATCGA	2	12	165271	165282	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010814	TTTTCA	2	12	166531	166542	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010814	TTCGCT	2	12	170083	170094	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010814	GCAAGT	2	12	179832	179843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010814	TGCGGG	2	12	213525	213536	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010814	ATCAAT	2	12	249864	249875	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010814	GAAAAA	2	12	445946	445957	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010814	GATGCC	2	12	525699	525710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010814	CGCCTC	2	12	575417	575428	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010814	GTTGTG	2	12	604782	604793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010814	AATTTC	2	12	605706	605717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010814	TCAGTT	2	12	616791	616802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010814	ATCTTG	2	12	626187	626198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010814	TATGTT	2	12	632225	632236	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010814	AAACAA	2	12	698007	698018	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010814	AAGCGA	2	12	771349	771360	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010814	TACGTC	2	12	918292	918303	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010814	GGGTGG	2	12	924537	924548	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010814	CCTCTG	2	12	946288	946299	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010814	CACTTC	2	12	1002254	1002265	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010814	ATTCCA	2	12	1051236	1051247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010814	GCTATG	2	12	1082831	1082842	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010814	ATTCCA	2	12	1135601	1135612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010814	AGTTGA	2	12	1148711	1148722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010814	AAGGTT	2	12	1258999	1259010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010814	GGCTGA	2	12	1270607	1270618	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010814	GCTACA	2	12	1271368	1271379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010814	GAAAAT	2	12	1309819	1309830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010814	GTACAA	2	12	1315718	1315729	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010814	CGATTG	2	12	1566113	1566124	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010814	TTTTGT	2	12	1584386	1584397	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010814	AAGGGC	2	12	1631486	1631497	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010814	AAGCGA	2	12	1715024	1715035	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010814	TTTAAC	2	12	1795003	1795014	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010814	GGACGT	2	12	1797075	1797086	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010814	GATTTT	2	12	1857864	1857875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010814	AGATAT	2	12	1879320	1879331	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010814	ATGGTG	2	12	1916892	1916903	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010814	AAGGTT	2	12	1952825	1952836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010814	CGGCAT	2	12	1990225	1990236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010814	AAAAGC	2	12	2057951	2057962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010814	TCAGTA	2	12	2093806	2093817	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010814	TGTAAA	2	12	2164230	2164241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010814	CAGCAT	2	12	2195118	2195129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010814	CAACCG	2	12	2321463	2321474	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010814	CAAATA	2	12	2411487	2411498	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010814	TGAAAT	2	12	2415599	2415610	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010814	ATACAA	2	12	2486868	2486879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010814	AAATTC	2	12	2488667	2488678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010814	ACCGGC	2	12	2560367	2560378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010814	TATCCC	2	12	2599050	2599061	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010814	GGTGCT	2	12	2638968	2638979	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010814	CAAAGA	2	12	2720045	2720056	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010814	TAAAAT	2	12	2840348	2840359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010814	GAGGCG	2	12	2840789	2840800	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010814	TATCCT	2	12	2857983	2857994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010814	ACAGCA	2	12	2858232	2858243	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010814	TTCGGA	2	12	2859848	2859859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010814	CAAAAG	2	12	2889210	2889221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010814	TGAACC	2	12	2965880	2965891	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010814	GTTCTG	2	12	3030854	3030865	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010814	CAGGGC	2	12	3030930	3030941	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010814	GAAGTG	2	12	3038591	3038602	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010814	TAGGGC	2	12	3055686	3055697	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010814	CCCTGG	2	12	3087933	3087944	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010814	CCAGAT	2	12	3090628	3090639	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010814	GGCCTG	2	12	3113178	3113189	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010814	CAGTAT	2	12	3192796	3192807	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010814	AGATAC	2	12	3193081	3193092	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010814	GCCGGT	2	12	3245518	3245529	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010814	GTGTTT	2	12	3265868	3265879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010814	GCAACA	2	12	3310183	3310194	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010814	CTTTTT	2	12	3330403	3330414	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010814	TTTTGA	2	12	3341172	3341183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010814	GTTTTC	2	12	3476076	3476087	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010814	AAAACG	2	12	3526636	3526647	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010814	CCCCTT	2	12	3581288	3581299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010814	TCCCGC	2	12	3652123	3652134	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010814	CAATAT	2	12	3684825	3684836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010814	TCAAGA	2	12	3710897	3710908	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010814	GCACCG	2	12	3730640	3730651	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010814	AAAAGG	2	12	3802386	3802397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.