MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 plasmid pET44827

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010813	CTGG	2	8	705	712	0 %	25 %	50 %	25 %	189458506
2	NC_010813	TAGC	2	8	800	807	25 %	25 %	25 %	25 %	189458506
3	NC_010813	CTTT	2	8	985	992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010813	CAAC	2	8	1280	1287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010813	AATC	2	8	2066	2073	50 %	25 %	0 %	25 %	189458508
6	NC_010813	GTTG	2	8	2534	2541	0 %	50 %	50 %	0 %	189458508
7	NC_010813	TGCG	2	8	2646	2653	0 %	25 %	50 %	25 %	189458508
8	NC_010813	GCCC	2	8	2974	2981	0 %	0 %	25 %	75 %	189458509
9	NC_010813	GCTC	2	8	3458	3465	0 %	25 %	25 %	50 %	189458509
10	NC_010813	GCCC	2	8	3517	3524	0 %	0 %	25 %	75 %	189458509
11	NC_010813	CCCG	2	8	4178	4185	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_010813	GGCG	2	8	4692	4699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010813	GGCA	2	8	5094	5101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010813	GCCG	2	8	5317	5324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010813	GGGC	2	8	5982	5989	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010813	TCCT	2	8	6563	6570	0 %	50 %	0 %	50 %	189458510
17	NC_010813	CTAG	2	8	7419	7426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010813	ACTT	2	8	7567	7574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010813	AGGT	2	8	7672	7679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010813	AGTG	2	8	7854	7861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010813	GCTC	2	8	8312	8319	0 %	25 %	25 %	50 %	189458512
22	NC_010813	AGCA	2	8	8826	8833	50 %	0 %	25 %	25 %	189458513
23	NC_010813	CTAA	2	8	9219	9226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010813	TTCT	2	8	9326	9333	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010813	GCCC	2	8	9536	9543	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_010813	CTGC	2	8	9727	9734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010813	AGAA	2	8	9773	9780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010813	TGCC	2	8	10396	10403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010813	TCCG	2	8	10642	10649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010813	ACAA	2	8	10732	10739	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010813	TTGG	2	8	11875	11882	0 %	50 %	50 %	0 %	189458515
32	NC_010813	ATTG	2	8	11929	11936	25 %	50 %	25 %	0 %	189458515
33	NC_010813	CCAC	2	8	12545	12552	25 %	0 %	0 %	75 %	189458516
34	NC_010813	GGAA	2	8	13025	13032	50 %	0 %	50 %	0 %	189458516
35	NC_010813	TCGA	2	8	14501	14508	25 %	25 %	25 %	25 %	189458518
36	NC_010813	CTGG	2	8	14595	14602	0 %	25 %	50 %	25 %	189458518
37	NC_010813	TCGG	2	8	15626	15633	0 %	25 %	50 %	25 %	189458518
38	NC_010813	CCAG	2	8	15698	15705	25 %	0 %	25 %	50 %	189458518
39	NC_010813	GAAG	2	8	15773	15780	50 %	0 %	50 %	0 %	189458518
40	NC_010813	GAAT	2	8	16242	16249	50 %	25 %	25 %	0 %	189458518
41	NC_010813	CACG	2	8	16284	16291	25 %	0 %	25 %	50 %	189458518
42	NC_010813	CTTT	2	8	16820	16827	0 %	75 %	0 %	25 %	189458518
43	NC_010813	CCAT	2	8	16856	16863	25 %	25 %	0 %	50 %	189458518
44	NC_010813	ATGG	2	8	16965	16972	25 %	25 %	50 %	0 %	189458518
45	NC_010813	TTGT	2	8	18166	18173	0 %	75 %	25 %	0 %	189458518
46	NC_010813	GAGT	2	8	18236	18243	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010813	ATCG	2	8	18269	18276	25 %	25 %	25 %	25 %	189458519
48	NC_010813	TCGA	2	8	18328	18335	25 %	25 %	25 %	25 %	189458519
49	NC_010813	ACTG	2	8	19598	19605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010813	ACAT	2	8	19632	19639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010813	ATAA	2	8	19700	19707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010813	TCGC	2	8	20475	20482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010813	AAGC	2	8	21003	21010	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010813	TGCC	2	8	21210	21217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010813	TCCG	2	8	21455	21462	0 %	25 %	25 %	50 %	189458522
56	NC_010813	GCAA	2	8	21865	21872	50 %	0 %	25 %	25 %	189458523
57	NC_010813	TGCT	2	8	22776	22783	0 %	50 %	25 %	25 %	189458525
58	NC_010813	AAGT	2	8	23038	23045	50 %	25 %	25 %	0 %	189458525
59	NC_010813	CGGG	2	8	23434	23441	0 %	0 %	75 %	25 %	189458525
60	NC_010813	GCGT	2	8	23680	23687	0 %	25 %	50 %	25 %	189458525
61	NC_010813	TCTG	2	8	23804	23811	0 %	50 %	25 %	25 %	189458525
62	NC_010813	GTTG	2	8	23829	23836	0 %	50 %	50 %	0 %	189458525
63	NC_010813	GCGG	2	8	24502	24509	0 %	0 %	75 %	25 %	189458525
64	NC_010813	TGCG	2	8	24822	24829	0 %	25 %	50 %	25 %	189458525
65	NC_010813	TGCC	2	8	25353	25360	0 %	25 %	25 %	50 %	189458525
66	NC_010813	GCGA	2	8	25715	25722	25 %	0 %	50 %	25 %	189458525
67	NC_010813	CAAC	2	8	26989	26996	50 %	0 %	0 %	50 %	189458525
68	NC_010813	AGTG	2	8	27650	27657	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010813	AGAA	2	8	27732	27739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010813	GGCG	2	8	27807	27814	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010813	TGGT	2	8	28030	28037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010813	TCCT	2	8	28070	28077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010813	CGGT	2	8	29000	29007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.