MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 chromosome 2

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010805	AGCCGG	2	12	34887	34898	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010805	CGGTGC	2	12	55747	55758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010805	CATCGT	2	12	77696	77707	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010805	ATTTGC	2	12	81252	81263	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010805	ACGGCG	2	12	99791	99802	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010805	GCCGGC	2	12	99886	99897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010805	CGTTTT	2	12	100246	100257	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010805	CGGCCG	2	12	119276	119287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010805	GCGGCA	2	12	127037	127048	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010805	ACGTTA	2	12	177013	177024	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010805	ACGCGC	2	12	197717	197728	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010805	ACGAAT	2	12	199725	199736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010805	ATCGTC	2	12	212238	212249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010805	CGTTCG	2	12	217381	217392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010805	ACGCGG	2	12	219390	219401	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010805	CGATAT	2	12	234596	234607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010805	CGCATG	3	18	251582	251599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010805	TCAGGA	2	12	260632	260643	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010805	GAACGC	2	12	274995	275006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010805	GCGTGC	2	12	320202	320213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010805	TGCCAG	2	12	320264	320275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010805	CGGTTG	2	12	358013	358024	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010805	TATGCA	2	12	373791	373802	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010805	GCCGTT	2	12	383623	383634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010805	ACGTCG	2	12	393940	393951	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010805	AACCGG	2	12	449731	449742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010805	GCAGGC	2	12	451652	451663	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010805	TTCGCT	2	12	455740	455751	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010805	CTCGCT	2	12	455752	455763	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010805	CGTAAT	2	12	469831	469842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010805	CGCGTG	2	12	475934	475945	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010805	TGCGGG	2	12	495477	495488	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010805	GATCGA	2	12	500603	500614	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010805	GCCTCC	2	12	512615	512626	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010805	CGCCGA	2	12	516576	516587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010805	GGGCAA	2	12	537975	537986	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010805	GGTCGG	2	12	545462	545473	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010805	ATCACC	2	12	557978	557989	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010805	ACTTCG	2	12	579589	579600	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010805	ATGGGA	2	12	603947	603958	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010805	CTTGAA	2	12	607541	607552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010805	CGATCA	2	12	628661	628672	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010805	CGGCGT	2	12	674989	675000	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010805	CATTCG	2	12	677256	677267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010805	AACGGA	2	12	678119	678130	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010805	GCCGAA	2	12	679712	679723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010805	GGCGCG	2	12	767195	767206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010805	AGCGCG	2	12	767291	767302	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010805	CGCAGT	4	24	772226	772249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010805	AGGAGA	2	12	794162	794173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010805	GAACCG	2	12	816376	816387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010805	CGCAGA	2	12	916560	916571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010805	ACCCGC	2	12	983571	983582	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010805	GGCGCG	2	12	993384	993395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010805	TTTCTG	2	12	994384	994395	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010805	GTTTCG	2	12	995179	995190	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010805	CGAGGT	2	12	1059789	1059800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010805	GCGCGT	2	12	1111177	1111188	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010805	TTCGCG	2	12	1130915	1130926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010805	GTGCGC	2	12	1150465	1150476	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010805	GTGGGG	2	12	1161008	1161019	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010805	CGCATA	2	12	1161151	1161162	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010805	AAAACG	2	12	1163522	1163533	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010805	GTCCGC	2	12	1184044	1184055	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010805	CGCGCA	2	12	1251474	1251485	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010805	ACGACA	2	12	1252336	1252347	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010805	CGATTC	2	12	1258673	1258684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010805	CCAACG	2	12	1263490	1263501	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010805	CGGCGC	2	12	1277782	1277793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010805	CGTATG	2	12	1280455	1280466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010805	CCGCGC	2	12	1286785	1286796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010805	CGCGAT	2	12	1288246	1288257	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010805	CGATTG	5	30	1290475	1290504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010805	CGAGCG	2	12	1297973	1297984	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010805	CCGTTC	2	12	1317805	1317816	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010805	CGCGCC	2	12	1322653	1322664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010805	CACGAC	2	12	1326648	1326659	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010805	ACGCGT	2	12	1333514	1333525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010805	TGTCGT	2	12	1341000	1341011	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010805	TCGTTC	2	12	1343007	1343018	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010805	CGAACG	2	12	1369447	1369458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010805	CGGCGC	2	12	1381633	1381644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010805	CTGCGC	2	12	1411362	1411373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010805	CCTCGA	2	12	1435958	1435969	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010805	CGTTCA	2	12	1437552	1437563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010805	CGAAGG	2	12	1439862	1439873	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010805	TGCCGT	2	12	1444742	1444753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010805	CGCCAG	2	12	1457479	1457490	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010805	CCGGCG	2	12	1469430	1469441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010805	TCATAT	2	12	1477252	1477263	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010805	TGCCGA	2	12	1499178	1499189	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010805	CGATAG	2	12	1499378	1499389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010805	ACCGGA	2	12	1499410	1499421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010805	TCGCGC	2	12	1518032	1518043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010805	ATCGGC	2	12	1523531	1523542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010805	GCGACC	2	12	1567634	1567645	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010805	TCGGCT	19	114	1578577	1578690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010805	TTGCTC	2	12	1655356	1655367	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010805	CTGCCT	2	12	1655968	1655979	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010805	TCGCGA	2	12	1665569	1665580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010805	CGACGT	2	12	1673720	1673731	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010805	TTCGCG	2	12	1684332	1684343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010805	CCGGCG	2	12	1688807	1688818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010805	GGCGCG	2	12	1710438	1710449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010805	CATTCG	2	12	1723056	1723067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010805	CTGTCG	2	12	1776571	1776582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010805	CGACGC	2	12	1797729	1797740	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010805	GCAGCG	2	12	1837163	1837174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010805	GTCCGC	2	12	1881809	1881820	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010805	CATCGC	2	12	1886350	1886361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010805	GCAATC	2	12	1887391	1887402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010805	TTCCAT	2	12	1890566	1890577	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010805	CGTGCG	2	12	1890660	1890671	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010805	GCACGC	2	12	1948920	1948931	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010805	ACCGGC	2	12	1956712	1956723	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010805	TGCTGA	2	12	1978448	1978459	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010805	GTCGAT	2	12	2012568	2012579	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010805	TCGCCG	2	12	2019170	2019181	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010805	GTTCAC	2	12	2019297	2019308	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010805	GCGCCG	2	12	2021045	2021056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010805	CCGTCG	2	12	2021160	2021171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010805	ACGTCG	2	12	2022537	2022548	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010805	ACGTCG	2	12	2022612	2022623	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010805	CGTCGA	2	12	2022688	2022699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010805	CGTCGA	2	12	2022763	2022774	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010805	ACGTCG	2	12	2022870	2022881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010805	CGAGCG	2	12	2023719	2023730	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010805	CGATGG	2	12	2024277	2024288	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010805	CGGTCG	2	12	2024466	2024477	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010805	ACCGCG	2	12	2024531	2024542	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010805	GTGTTG	2	12	2024750	2024761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010805	GCGATG	2	12	2029855	2029866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_010805	GTTCGC	2	12	2029950	2029961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010805	GCTACA	2	12	2050574	2050585	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010805	ACGATA	2	12	2066562	2066573	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_010805	GAATCC	2	12	2086411	2086422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010805	ACGAGC	2	12	2106525	2106536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010805	GCAGCG	2	12	2114292	2114303	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010805	CGCGGC	2	12	2125027	2125038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010805	GCACGC	2	12	2126329	2126340	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010805	ACTGCG	2	12	2144836	2144847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010805	GTGGGG	2	12	2175862	2175873	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010805	CGGCGA	2	12	2177265	2177276	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_010805	TTGCTC	2	12	2202997	2203008	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010805	CGATCG	2	12	2261667	2261678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_010805	GAAGGA	2	12	2261730	2261741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010805	CGCGGC	2	12	2274328	2274339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010805	ACCGCC	2	12	2274380	2274391	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_010805	ACGGAA	2	12	2280066	2280077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_010805	ATGCAA	2	12	2326782	2326793	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_010805	CGCCGG	2	12	2341638	2341649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010805	CGGCGC	2	12	2347035	2347046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010805	CCTGCA	2	12	2352371	2352382	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
154	NC_010805	GCATTC	2	12	2442070	2442081	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_010805	CGCCTG	2	12	2447315	2447326	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
156	NC_010805	CGTAGC	2	12	2448520	2448531	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_010805	GACGTT	2	12	2449607	2449618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_010805	TCGAAA	2	12	2450622	2450633	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_010805	GCGAGC	2	12	2467723	2467734	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_010805	AAATAT	2	12	2468098	2468109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.