MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010803	TAAATT	2	12	49505	49516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010803	TTGAGT	2	12	66377	66388	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010803	CTTTTT	2	12	100847	100858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010803	ATTAAA	2	12	101003	101014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010803	TCGTAA	2	12	181782	181793	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010803	CAAAGC	2	12	194959	194970	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010803	CATTAT	2	12	245112	245123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010803	TTGCGC	2	12	258470	258481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010803	ATAAAT	2	12	294306	294317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010803	AGCTCC	2	12	326837	326848	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010803	TTTTTG	2	12	355056	355067	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010803	CAATCT	2	12	391340	391351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010803	AATAAA	2	12	399794	399805	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010803	GCTCCT	2	12	413385	413396	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010803	AAAACG	2	12	419172	419183	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010803	TGCCGC	2	12	504630	504641	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010803	TTCCTT	2	12	505704	505715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010803	CGCTTC	2	12	505826	505837	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010803	AGTAGA	4	24	506149	506172	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010803	CCTGTA	2	12	506620	506631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010803	CCTGTA	2	12	506755	506766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010803	AGTAGA	4	24	507548	507571	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010803	CTGTAA	2	12	513877	513888	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010803	TTCCGG	2	12	540539	540550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010803	TTATTG	2	12	585268	585279	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010803	GGTTTC	2	12	680359	680370	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010803	AAAAGC	2	12	787416	787427	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010803	CTGAAG	2	12	797398	797409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010803	GATTTG	2	12	828007	828018	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010803	TGTAAT	2	12	927041	927052	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010803	ATTTCA	2	12	942443	942454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010803	ATCGGC	2	12	1008970	1008981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010803	ATGACA	2	12	1047938	1047949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010803	CGTGTT	2	12	1092015	1092026	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010803	GATCAG	2	12	1130795	1130806	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010803	CGATCT	2	12	1156954	1156965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010803	AGTGGG	2	12	1181519	1181530	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010803	AAAATA	2	12	1189487	1189498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010803	CGAAAA	2	12	1211698	1211709	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010803	CTTTGC	2	12	1229027	1229038	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010803	TTAATG	2	12	1229416	1229427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010803	TAAAAA	2	12	1235177	1235188	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010803	CTTTTG	2	12	1256618	1256629	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010803	TGCCAT	2	12	1256928	1256939	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010803	AACTTT	2	12	1268490	1268501	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010803	CGCTTT	2	12	1312397	1312408	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010803	GAAATC	2	12	1323035	1323046	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010803	GAAATG	2	12	1356505	1356516	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010803	TGGTTT	2	12	1364825	1364836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010803	GTTACG	2	12	1373514	1373525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010803	CCTTAC	2	12	1432346	1432357	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010803	AAGAAA	2	12	1472781	1472792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010803	GAAAAA	2	12	1530093	1530104	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010803	ATTATC	2	12	1579635	1579646	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010803	CTGTTT	2	12	1588221	1588232	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010803	TTTCAT	2	12	1588308	1588319	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010803	GTAGAT	2	12	1600158	1600169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010803	GCGCTC	2	12	1600497	1600508	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010803	TGGCCG	2	12	1601828	1601839	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010803	AGACTG	2	12	1637969	1637980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010803	GAAACA	2	12	1637987	1637998	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010803	TTCATC	2	12	1651459	1651470	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010803	GATTTT	2	12	1675967	1675978	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010803	AATTTA	2	12	1685363	1685374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010803	CACAAG	2	12	1691332	1691343	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010803	GATACC	2	12	1696230	1696241	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010803	ACTGTA	2	12	1696437	1696448	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010803	GGTATT	2	12	1698528	1698539	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010803	ATGAAT	2	12	1701799	1701810	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010803	AACAAA	2	12	1757836	1757847	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010803	CCAAAA	2	12	1785976	1785987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010803	AAAGTT	2	12	1831823	1831834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010803	TTAAAA	2	12	1936703	1936714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010803	ATTGAA	2	12	1946195	1946206	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010803	CCCGGA	2	12	2038528	2038539	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010803	AAAGAA	2	12	2041590	2041601	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010803	ATCCCC	2	12	2055293	2055304	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_010803	CAATCC	2	12	2055513	2055524	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010803	TACAAC	2	12	2058179	2058190	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010803	AAAACG	2	12	2098926	2098937	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010803	AAAAAC	2	12	2103816	2103827	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010803	TTCCTT	2	12	2105256	2105267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010803	TTAAAA	2	12	2105294	2105305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010803	GTAACC	2	12	2120948	2120959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010803	GCTGTC	2	12	2123947	2123958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010803	GCAACT	2	12	2136444	2136455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010803	AGTAAC	2	12	2213874	2213885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010803	CAGCAA	2	12	2316282	2316293	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010803	CCCTTA	2	12	2316351	2316362	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010803	CGGCCA	2	12	2316741	2316752	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010803	AGATTC	2	12	2334974	2334985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010803	AGAGAT	2	12	2337337	2337348	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010803	GTCAGT	2	12	2361480	2361491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010803	ACGACA	2	12	2368233	2368244	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010803	AAATTT	2	12	2410731	2410742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010803	TTCTTT	2	12	2461830	2461841	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010803	CAAAAA	2	12	2470421	2470432	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010803	TCAGGA	2	12	2493393	2493404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010803	CCGGAA	2	12	2595478	2595489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010803	AAAAAG	2	12	2662411	2662422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010803	CAACAG	2	12	2687707	2687718	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010803	TGTATC	2	12	2688875	2688886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010803	TGCCCG	2	12	2690455	2690466	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010803	AAGCGT	2	12	2730260	2730271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.