MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 1859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010803	GGAAA	2	10	948	957	60 %	0 %	40 %	0 %	189345559
2	NC_010803	GAGAG	2	10	3053	3062	40 %	0 %	60 %	0 %	189345560
3	NC_010803	TTTTA	2	10	5569	5578	20 %	80 %	0 %	0 %	189345563
4	NC_010803	TGCAT	2	10	6936	6945	20 %	40 %	20 %	20 %	189345564
5	NC_010803	GAAAA	2	10	8387	8396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010803	GAAGA	2	10	10867	10876	60 %	0 %	40 %	0 %	189345566
7	NC_010803	TGCCG	2	10	11071	11080	0 %	20 %	40 %	40 %	189345566
8	NC_010803	AACTC	2	10	14218	14227	40 %	20 %	0 %	40 %	189345570
9	NC_010803	CAAAG	2	10	16630	16639	60 %	0 %	20 %	20 %	189345572
10	NC_010803	TCAGC	2	10	17063	17072	20 %	20 %	20 %	40 %	189345572
11	NC_010803	TCCCT	2	10	18300	18309	0 %	40 %	0 %	60 %	189345573
12	NC_010803	CATCG	2	10	19780	19789	20 %	20 %	20 %	40 %	189345574
13	NC_010803	CAGTG	2	10	20501	20510	20 %	20 %	40 %	20 %	189345575
14	NC_010803	TCTTA	2	10	20866	20875	20 %	60 %	0 %	20 %	189345575
15	NC_010803	ATCTG	2	10	25665	25674	20 %	40 %	20 %	20 %	189345579
16	NC_010803	CGGAA	2	10	27796	27805	40 %	0 %	40 %	20 %	189345581
17	NC_010803	TCGCC	2	10	28564	28573	0 %	20 %	20 %	60 %	189345581
18	NC_010803	TCGTT	2	10	30106	30115	0 %	60 %	20 %	20 %	189345583
19	NC_010803	GAAAA	2	10	32037	32046	80 %	0 %	20 %	0 %	189345586
20	NC_010803	CGACA	2	10	32322	32331	40 %	0 %	20 %	40 %	189345587
21	NC_010803	TCCTG	2	10	32651	32660	0 %	40 %	20 %	40 %	189345587
22	NC_010803	TCCGA	2	10	34781	34790	20 %	20 %	20 %	40 %	189345589
23	NC_010803	CTGGC	2	10	36091	36100	0 %	20 %	40 %	40 %	189345589
24	NC_010803	GATGA	2	10	36221	36230	40 %	20 %	40 %	0 %	189345589
25	NC_010803	AGAAA	2	10	38608	38617	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010803	GGGGC	2	10	40206	40215	0 %	0 %	80 %	20 %	189345592
27	NC_010803	ATGGA	2	10	41316	41325	40 %	20 %	40 %	0 %	189345593
28	NC_010803	CGGTT	2	10	41388	41397	0 %	40 %	40 %	20 %	189345593
29	NC_010803	CCGAT	2	10	43399	43408	20 %	20 %	20 %	40 %	189345593
30	NC_010803	CTGTA	2	10	43772	43781	20 %	40 %	20 %	20 %	189345594
31	NC_010803	TGCCG	2	10	44540	44549	0 %	20 %	40 %	40 %	189345594
32	NC_010803	TGTCT	2	10	44990	44999	0 %	60 %	20 %	20 %	189345595
33	NC_010803	GAACA	2	10	45424	45433	60 %	0 %	20 %	20 %	189345596
34	NC_010803	CTCTG	2	10	46230	46239	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_010803	ATCCG	2	10	48501	48510	20 %	20 %	20 %	40 %	189345599
36	NC_010803	GGCCA	2	10	51913	51922	20 %	0 %	40 %	40 %	189345603
37	NC_010803	TTCAG	2	10	53687	53696	20 %	40 %	20 %	20 %	189345606
38	NC_010803	CCGTT	2	10	55109	55118	0 %	40 %	20 %	40 %	189345608
39	NC_010803	TCGTT	2	10	55639	55648	0 %	60 %	20 %	20 %	189345608
40	NC_010803	TCCTG	2	10	57459	57468	0 %	40 %	20 %	40 %	189345610
41	NC_010803	CCCAT	2	10	62470	62479	20 %	20 %	0 %	60 %	189345613
42	NC_010803	GACGA	2	10	62645	62654	40 %	0 %	40 %	20 %	189345613
43	NC_010803	ACGGT	2	10	63655	63664	20 %	20 %	40 %	20 %	189345613
44	NC_010803	GCGGG	2	10	64778	64787	0 %	0 %	80 %	20 %	189345615
45	NC_010803	TATCG	2	10	65650	65659	20 %	40 %	20 %	20 %	189345616
46	NC_010803	TCGGG	2	10	66481	66490	0 %	20 %	60 %	20 %	189345617
47	NC_010803	CGTTC	2	10	69198	69207	0 %	40 %	20 %	40 %	189345619
48	NC_010803	CCTGC	2	10	69434	69443	0 %	20 %	20 %	60 %	189345619
49	NC_010803	TTGAT	2	10	70090	70099	20 %	60 %	20 %	0 %	189345620
50	NC_010803	GTACC	2	10	70953	70962	20 %	20 %	20 %	40 %	189345621
51	NC_010803	TTGCC	2	10	72721	72730	0 %	40 %	20 %	40 %	189345624
52	NC_010803	GCTCC	2	10	74522	74531	0 %	20 %	20 %	60 %	189345626
53	NC_010803	ATTCG	2	10	76328	76337	20 %	40 %	20 %	20 %	189345628
54	NC_010803	GGTTT	2	10	80655	80664	0 %	60 %	40 %	0 %	189345631
55	NC_010803	TGCCC	2	10	82367	82376	0 %	20 %	20 %	60 %	189345632
56	NC_010803	CGTTG	2	10	86304	86313	0 %	40 %	40 %	20 %	189345635
57	NC_010803	TTTTC	2	10	93794	93803	0 %	80 %	0 %	20 %	189345643
58	NC_010803	CGGAA	2	10	95337	95346	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010803	GCCGA	2	10	98380	98389	20 %	0 %	40 %	40 %	189345646
60	NC_010803	TCCCG	2	10	98582	98591	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_010803	GACAT	2	10	98865	98874	40 %	20 %	20 %	20 %	189345647
62	NC_010803	CGCGG	2	10	99029	99038	0 %	0 %	60 %	40 %	189345647
63	NC_010803	GTCCG	2	10	99122	99131	0 %	20 %	40 %	40 %	189345647
64	NC_010803	GAACG	2	10	99570	99579	40 %	0 %	40 %	20 %	189345647
65	NC_010803	GAACA	2	10	100064	100073	60 %	0 %	20 %	20 %	189345648
66	NC_010803	AGAAA	2	10	100624	100633	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010803	TGGTT	2	10	101778	101787	0 %	60 %	40 %	0 %	189345650
68	NC_010803	GGCAA	2	10	101904	101913	40 %	0 %	40 %	20 %	189345650
69	NC_010803	TAAAC	2	10	102376	102385	60 %	20 %	0 %	20 %	189345650
70	NC_010803	CGAAC	2	10	103981	103990	40 %	0 %	20 %	40 %	189345653
71	NC_010803	TTTGC	2	10	104930	104939	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010803	CTGAA	2	10	105941	105950	40 %	20 %	20 %	20 %	189345655
73	NC_010803	CGTTC	2	10	107142	107151	0 %	40 %	20 %	40 %	189345657
74	NC_010803	TTCTT	2	10	109710	109719	0 %	80 %	0 %	20 %	189345659
75	NC_010803	GTTAT	2	10	112727	112736	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010803	TCGTG	2	10	114036	114045	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010803	GAAAA	2	10	115183	115192	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010803	ACCGT	2	10	116629	116638	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_010803	TCGAG	2	10	119203	119212	20 %	20 %	40 %	20 %	189345663
80	NC_010803	GCCTT	2	10	121367	121376	0 %	40 %	20 %	40 %	189345665
81	NC_010803	TGCCG	2	10	122183	122192	0 %	20 %	40 %	40 %	189345666
82	NC_010803	AATAG	2	10	123518	123527	60 %	20 %	20 %	0 %	189345668
83	NC_010803	GAAAA	2	10	124219	124228	80 %	0 %	20 %	0 %	189345668
84	NC_010803	TCAGC	2	10	125936	125945	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_010803	CAACA	2	10	130465	130474	60 %	0 %	0 %	40 %	189345673
86	NC_010803	ATCTG	2	10	130922	130931	20 %	40 %	20 %	20 %	189345673
87	NC_010803	CGCCA	2	10	131612	131621	20 %	0 %	20 %	60 %	189345673
88	NC_010803	TTCTT	2	10	131816	131825	0 %	80 %	0 %	20 %	189345673
89	NC_010803	CTTTC	2	10	135012	135021	0 %	60 %	0 %	40 %	189345675
90	NC_010803	ATCTG	2	10	135534	135543	20 %	40 %	20 %	20 %	189345675
91	NC_010803	CAAAT	2	10	135699	135708	60 %	20 %	0 %	20 %	189345676
92	NC_010803	GCAAC	2	10	139873	139882	40 %	0 %	20 %	40 %	189345678
93	NC_010803	GGTTG	2	10	142853	142862	0 %	40 %	60 %	0 %	189345679
94	NC_010803	GAACA	2	10	143318	143327	60 %	0 %	20 %	20 %	189345679
95	NC_010803	TGCTC	2	10	143878	143887	0 %	40 %	20 %	40 %	189345679
96	NC_010803	CATTG	2	10	144826	144835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010803	GGAAT	2	10	144845	144854	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010803	CGGCG	2	10	146362	146371	0 %	0 %	60 %	40 %	189345682
99	NC_010803	CAGAT	2	10	148466	148475	40 %	20 %	20 %	20 %	189345684
100	NC_010803	TCGGG	2	10	148806	148815	0 %	20 %	60 %	20 %	189345684
101	NC_010803	TGCCA	2	10	149462	149471	20 %	20 %	20 %	40 %	189345684
102	NC_010803	CGATA	2	10	151591	151600	40 %	20 %	20 %	20 %	189345687
103	NC_010803	GGTTG	2	10	151786	151795	0 %	40 %	60 %	0 %	189345687
104	NC_010803	GCGGA	2	10	153273	153282	20 %	0 %	60 %	20 %	189345688
105	NC_010803	TGGCC	2	10	157816	157825	0 %	20 %	40 %	40 %	189345691
106	NC_010803	GTTAT	2	10	158295	158304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010803	TCGTG	2	10	159604	159613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010803	GAAAA	2	10	160751	160760	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010803	ACCGT	2	10	162197	162206	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_010803	TACCA	2	10	165991	166000	40 %	20 %	0 %	40 %	189345694
111	NC_010803	CTGTT	2	10	169342	169351	0 %	60 %	20 %	20 %	189345700
112	NC_010803	TCCGG	2	10	170299	170308	0 %	20 %	40 %	40 %	189345701
113	NC_010803	GCGAA	2	10	172049	172058	40 %	0 %	40 %	20 %	189345705
114	NC_010803	CGAAC	2	10	172325	172334	40 %	0 %	20 %	40 %	189345705
115	NC_010803	CCGTC	2	10	173881	173890	0 %	20 %	20 %	60 %	189345705
116	NC_010803	GTTCG	2	10	178503	178512	0 %	40 %	40 %	20 %	189345708
117	NC_010803	GTATC	2	10	181057	181066	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_010803	CGTAT	2	10	181089	181098	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010803	CGGTT	2	10	183161	183170	0 %	40 %	40 %	20 %	189345712
120	NC_010803	GATGT	2	10	183599	183608	20 %	40 %	40 %	0 %	189345713
121	NC_010803	TTGTT	2	10	185780	185789	0 %	80 %	20 %	0 %	189345715
122	NC_010803	CTGCG	2	10	188209	188218	0 %	20 %	40 %	40 %	189345718
123	NC_010803	TGCAG	2	10	188931	188940	20 %	20 %	40 %	20 %	189345719
124	NC_010803	TTCTT	2	10	190184	190193	0 %	80 %	0 %	20 %	189345721
125	NC_010803	TTCCG	2	10	190857	190866	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_010803	CATAC	2	10	193988	193997	40 %	20 %	0 %	40 %	189345725
127	NC_010803	CTGCC	2	10	194685	194694	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_010803	TTCAG	2	10	195630	195639	20 %	40 %	20 %	20 %	189345727
129	NC_010803	AACCG	2	10	196199	196208	40 %	0 %	20 %	40 %	189345728
130	NC_010803	TTCAG	2	10	196227	196236	20 %	40 %	20 %	20 %	189345728
131	NC_010803	GCCGG	2	10	198299	198308	0 %	0 %	60 %	40 %	189345730
132	NC_010803	TTATT	2	10	199226	199235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010803	TTTTC	2	10	199416	199425	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010803	ACGTT	2	10	201448	201457	20 %	40 %	20 %	20 %	189345731
135	NC_010803	GACGG	2	10	202702	202711	20 %	0 %	60 %	20 %	189345733
136	NC_010803	AAATC	2	10	203270	203279	60 %	20 %	0 %	20 %	189345733
137	NC_010803	GGCTT	2	10	203648	203657	0 %	40 %	40 %	20 %	189345734
138	NC_010803	CATCG	2	10	204616	204625	20 %	20 %	20 %	40 %	189345734
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146	NC_010803	TTATT	2	10	214002	214011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_010803	GTTTC	2	10	217233	217242	0 %	60 %	20 %	20 %	189345745
151	NC_010803	GAAGG	2	10	219569	219578	40 %	0 %	60 %	0 %	189345746
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172	NC_010803	GTTCA	2	10	252236	252245	20 %	40 %	20 %	20 %	189345771
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401	NC_010803	CAGTA	2	10	580839	580848	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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