MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 plasmid pTGL1

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010802	CCTTCT	2	12	3566	3577	0 %	50 %	0 %	50 %	189348765
2	NC_010802	CGTCAC	2	12	4293	4304	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010802	ACGCCG	2	12	6899	6910	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189348767
4	NC_010802	GGCCAC	2	12	11125	11136	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189348770
5	NC_010802	TGCCGG	2	12	11966	11977	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010802	GTCGAA	2	12	12069	12080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010802	GTGAAC	2	12	15206	15217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010802	TTTCCG	2	12	15729	15740	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189348773
9	NC_010802	GATCGG	2	12	19996	20007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189348778
10	NC_010802	CGAAGC	2	12	20696	20707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189348779
11	NC_010802	CGTGAT	2	12	21462	21473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189348779
12	NC_010802	GCGCCC	2	12	21714	21725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189348780
13	NC_010802	CCGCGA	2	12	25080	25091	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189348782
14	NC_010802	GCGCCA	2	12	27789	27800	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189348784
15	NC_010802	TCGGCA	2	12	33740	33751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010802	AGTCCG	2	12	36984	36995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010802	CCCAGA	2	12	38818	38829	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	189348790
18	NC_010802	ACGGTT	2	12	44185	44196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010802	TCAAGC	2	12	45592	45603	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189348793
20	NC_010802	TGGTTC	2	12	45753	45764	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	189348793
21	NC_010802	TCGGCA	2	12	55709	55720	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189348798
22	NC_010802	CGATCA	2	12	55887	55898	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010802	TGCCGC	3	18	60617	60634	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189348800
24	NC_010802	TCTCCA	2	12	61705	61716	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189348800
25	NC_010802	CCCACT	2	12	64831	64842	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	189348802
26	NC_010802	GCTCGA	2	12	67715	67726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010802	CGCAAC	2	12	70282	70293	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	189348810
28	NC_010802	TCGGCG	2	12	73032	73043	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189348811
29	NC_010802	GGGCGG	2	12	78757	78768	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010802	GCGAGT	2	12	79228	79239	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010802	GCCGCG	2	12	81948	81959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010802	GCCCAC	2	12	83848	83859	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010802	CGATCG	2	12	84649	84660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010802	GCCATC	2	12	90519	90530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189348820
35	NC_010802	CTACGG	2	12	96906	96917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189348829
36	NC_010802	ATCACG	2	12	97613	97624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010802	CAAACG	2	12	97770	97781	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189348831
38	NC_010802	CGAGCA	2	12	99995	100006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189348833
39	NC_010802	GCCGGT	2	12	100331	100342	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189348834
40	NC_010802	TTCTCC	2	12	101811	101822	0 %	50 %	0 %	50 %	189348834
41	NC_010802	TGCGCA	2	12	102084	102095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189348834
42	NC_010802	AGGAAC	2	12	102273	102284	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	189348834
43	NC_010802	CGTTGT	2	12	102688	102699	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	189348834
44	NC_010802	CTGCAC	2	12	103214	103225	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189348834
45	NC_010802	CGACAC	2	12	104332	104343	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	189348835
46	NC_010802	CCGCGA	2	12	106117	106128	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189348836
47	NC_010802	CAGGTG	2	12	117392	117403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189348848
48	NC_010802	TCAGCA	2	12	118770	118781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189348849
49	NC_010802	TGACGA	2	12	122365	122376	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189348853
50	NC_010802	GAGATG	2	12	122685	122696	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	189348853
51	NC_010802	TCGTGC	2	12	124464	124475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189348856
52	NC_010802	GCCAAG	2	12	126328	126339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189348859
53	NC_010802	CGCGGC	2	12	128009	128020	0 %	0 %	50 %	50 %	189348861
54	NC_010802	TGCGCG	2	12	128890	128901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189348861
55	NC_010802	CCGAGT	2	12	130107	130118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189348862
56	NC_010802	ATCGCG	2	12	130619	130630	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189348862
57	NC_010802	CAAGGT	2	12	132918	132929	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189348863
58	NC_010802	CATGCT	2	12	133917	133928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189348864
59	NC_010802	GCGCTG	2	12	134146	134157	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189348864
60	NC_010802	TTCACG	2	12	134686	134697	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189348864
61	NC_010802	GCCCGG	2	12	137728	137739	0 %	0 %	50 %	50 %	189348871
62	NC_010802	GCGATC	2	12	145452	145463	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189348876
63	NC_010802	ACGTGA	2	12	147715	147726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189348876
64	NC_010802	GATCCA	2	12	152610	152621	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189348881
65	NC_010802	ATCTCG	2	12	152955	152966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189348882
66	NC_010802	CCGAGA	2	12	159144	159155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010802	CCGACG	2	12	162533	162544	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.