MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 plasmid pTGL1

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010802	CGAC	2	8	378	385	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010802	GCAG	2	8	408	415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010802	GGTG	2	8	524	531	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010802	CGTA	2	8	533	540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010802	CGTT	2	8	678	685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010802	AAGG	2	8	769	776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010802	GCCG	2	8	919	926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010802	AACC	2	8	3003	3010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010802	GTCA	2	8	3111	3118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010802	ATCC	2	8	4331	4338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010802	GCCG	2	8	5282	5289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010802	CTCG	2	8	6691	6698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010802	GTCG	2	8	9773	9780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010802	GGCG	2	8	10067	10074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010802	AGCG	3	12	11744	11755	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010802	TCGG	2	8	14357	14364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010802	GTCC	2	8	14387	14394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010802	GAAG	2	8	15067	15074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010802	TCGC	2	8	16294	16301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010802	GCCC	2	8	19601	19608	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_010802	AACG	2	8	19755	19762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010802	GAAT	2	8	33776	33783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010802	CGTC	2	8	34391	34398	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010802	GGCG	2	8	34512	34519	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010802	ACCC	2	8	38495	38502	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_010802	TGCC	2	8	38672	38679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010802	GTCT	2	8	41627	41634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010802	CCAA	2	8	41678	41685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010802	TGCG	2	8	41739	41746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010802	ACCG	2	8	42301	42308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010802	TGAC	2	8	42689	42696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010802	TGAA	2	8	43667	43674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010802	TGAG	2	8	44038	44045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010802	CGAT	2	8	44126	44133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010802	GTCG	2	8	44175	44182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010802	AAAG	2	8	44512	44519	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010802	GACC	2	8	44677	44684	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010802	GTTC	2	8	44734	44741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010802	GTCG	2	8	44815	44822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010802	GACT	2	8	44882	44889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010802	GAAG	2	8	45144	45151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010802	AATC	2	8	53282	53289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010802	CGAG	2	8	56351	56358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010802	GGAC	2	8	62740	62747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010802	TTCC	2	8	63182	63189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010802	ACGG	2	8	63943	63950	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010802	GCCG	2	8	64137	64144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010802	ACTC	2	8	64192	64199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010802	GTTT	2	8	65372	65379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010802	CGTC	2	8	65890	65897	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010802	CACC	2	8	65922	65929	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_010802	CGCA	2	8	66088	66095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010802	TGGC	2	8	67693	67700	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010802	GTTT	2	8	68178	68185	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010802	GGCA	2	8	71366	71373	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010802	GGGC	2	8	71625	71632	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010802	AGCG	2	8	71941	71948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010802	CCCG	2	8	71969	71976	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_010802	CCAA	2	8	72326	72333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010802	TCGG	2	8	72476	72483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010802	GAGG	2	8	72790	72797	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010802	GGGA	2	8	75448	75455	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010802	GCCG	2	8	75749	75756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010802	GGCT	2	8	75778	75785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010802	CTAA	2	8	75966	75973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010802	TCGA	2	8	76047	76054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010802	GGGA	2	8	76636	76643	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010802	TGCT	2	8	76746	76753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010802	GCCG	2	8	76925	76932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010802	GCCG	2	8	76938	76945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010802	CGAG	2	8	77055	77062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010802	AGCA	2	8	77271	77278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010802	AGCC	2	8	77885	77892	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010802	CGGC	2	8	77964	77971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010802	GCCG	2	8	78250	78257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010802	GTTT	2	8	78982	78989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010802	ATCG	2	8	82274	82281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010802	TGCC	2	8	82640	82647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010802	GGGT	2	8	82730	82737	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010802	ACCG	2	8	83623	83630	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010802	CGAC	2	8	84086	84093	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010802	CCAA	2	8	84198	84205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010802	TTGA	2	8	84898	84905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010802	TTGA	2	8	84939	84946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010802	TTGA	2	8	85087	85094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010802	CGCT	2	8	87982	87989	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010802	GGTA	2	8	89755	89762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010802	AGAC	2	8	89979	89986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010802	CGAA	2	8	90073	90080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010802	GCCT	2	8	90787	90794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010802	CTTC	2	8	91764	91771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010802	GCGT	2	8	91787	91794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010802	TTGA	2	8	93685	93692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010802	CGCA	2	8	95638	95645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010802	GTCC	2	8	97561	97568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010802	CCGC	2	8	98047	98054	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_010802	CCGA	2	8	106793	106800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010802	CCTT	2	8	107199	107206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010802	CAAT	2	8	110081	110088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010802	TTTC	2	8	110481	110488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010802	GCAC	2	8	125269	125276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010802	GATG	2	8	125438	125445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010802	TGCG	2	8	125598	125605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010802	TGTC	2	8	142951	142958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010802	TGGC	2	8	143034	143041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010802	TCGC	2	8	153317	153324	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010802	CGAT	2	8	154298	154305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010802	GCCG	2	8	156576	156583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010802	TCGA	2	8	159744	159751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010802	CGGC	2	8	160255	160262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010802	GCTC	2	8	160370	160377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010802	GTGC	2	8	161382	161389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010802	GCCG	2	8	161427	161434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010802	CCGG	2	8	162713	162720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010802	GCCG	2	8	163501	163508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010802	CCGG	3	12	163619	163630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010802	AGGC	2	8	164461	164468	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010802	CCTC	2	8	164553	164560	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_010802	CTGG	2	8	164760	164767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010802	GCGA	2	8	164802	164809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010802	TTGA	2	8	164975	164982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010802	GATG	2	8	167082	167089	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010802	GACC	2	8	167399	167406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.