MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 chromosome 3

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010801	GTCCGC	2	12	14581	14592	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010801	ATGAGG	2	12	33399	33410	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010801	GCGAGC	2	12	34098	34109	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010801	TGCGGC	2	12	39080	39091	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010801	TCACGA	2	12	83840	83851	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010801	CTGGTT	2	12	84997	85008	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010801	GCGCTT	2	12	86573	86584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010801	CTCAAG	2	12	87487	87498	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010801	CCGAAC	3	18	95952	95969	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010801	GCGCCG	2	12	100713	100724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010801	GCTTCG	2	12	102133	102144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010801	GTCGCA	2	12	103863	103874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010801	ATCCGC	2	12	104464	104475	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010801	GCCCCT	2	12	107003	107014	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010801	CTCGTC	2	12	114114	114125	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010801	TCGCGA	2	12	118885	118896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010801	TCGACG	2	12	119113	119124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010801	GCCTGC	2	12	134362	134373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010801	GTCGGA	2	12	149079	149090	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010801	CGGCGA	2	12	175717	175728	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010801	CGCCGG	2	12	178033	178044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010801	CCGTCG	2	12	178956	178967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010801	CGACGC	2	12	203808	203819	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010801	GGCGCA	2	12	221862	221873	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010801	GAAACC	2	12	227770	227781	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010801	TCAGAA	2	12	232512	232523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010801	AACGCG	2	12	242793	242804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010801	GAGGGC	2	12	246708	246719	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010801	CCAGCG	2	12	287054	287065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010801	GCGATG	2	12	292503	292514	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010801	ACCGAG	2	12	292565	292576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010801	ACGAGG	2	12	347800	347811	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010801	TGCTCG	2	12	350763	350774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010801	TGATCG	2	12	351665	351676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010801	ACGCCG	2	12	357212	357223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010801	AGGCCG	2	12	392716	392727	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010801	CGTGAA	2	12	396497	396508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010801	GACAGC	2	12	442877	442888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010801	CGGCCG	2	12	444580	444591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010801	CCATGG	2	12	457773	457784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010801	CAGCTT	2	12	458222	458233	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010801	AATGCG	2	12	459732	459743	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010801	CGACGC	2	12	462854	462865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010801	TCGGCA	2	12	463032	463043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010801	GCCATC	2	12	463147	463158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010801	CATACG	2	12	465433	465444	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010801	ATCGGC	2	12	472224	472235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010801	GGCGAA	2	12	478626	478637	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010801	CGGCGT	2	12	486294	486305	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010801	TTTTGG	2	12	486704	486715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010801	CGGCGC	2	12	513337	513348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010801	CTGGGG	2	12	520410	520421	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010801	CTCGTT	2	12	523522	523533	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010801	TCTGGT	2	12	525560	525571	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010801	ATCGGC	2	12	543973	543984	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010801	ACGCAC	2	12	563659	563670	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010801	CAGCTT	2	12	566670	566681	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010801	CGATCA	2	12	590008	590019	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010801	AAGCGC	2	12	604774	604785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010801	CGCCGG	2	12	633894	633905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010801	TTCACG	2	12	638195	638206	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010801	CTCACC	2	12	666041	666052	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010801	ACCCCG	2	12	677856	677867	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010801	CATGTC	2	12	688440	688451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010801	CGCGGC	2	12	698236	698247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010801	CGATCG	2	12	707115	707126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010801	TCGCGC	2	12	720617	720628	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010801	GACGCC	2	12	720952	720963	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010801	GCCGTC	2	12	721383	721394	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010801	CGGCGA	2	12	762760	762771	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010801	TCCTTC	2	12	798126	798137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010801	CGTTCT	2	12	801847	801858	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010801	TCCGTT	2	12	814260	814271	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010801	GCGCTC	2	12	816698	816709	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010801	GCGTCG	2	12	839698	839709	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010801	GCGAGA	2	12	863527	863538	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010801	CGATCG	2	12	912348	912359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.