MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methylacidiphilum infernorum V4

Total Repeats: 869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010794	ATAAAA	2	12	218	229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010794	AGCTCA	2	12	5037	5048	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189218024
3	NC_010794	GACGTT	2	12	5321	5332	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189218024
4	NC_010794	CTTTAT	2	12	5545	5556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189218025
5	NC_010794	ATTGGA	2	12	8126	8137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189218027
6	NC_010794	TTTTAT	2	12	11289	11300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189218031
7	NC_010794	TTTTGT	2	12	11422	11433	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	189218032
8	NC_010794	TAACCC	2	12	15642	15653	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	189218036
9	NC_010794	GGGTAA	2	12	18642	18653	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	189218038
10	NC_010794	GATGCT	2	12	19334	19345	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189218038
11	NC_010794	AAAATC	2	12	22672	22683	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010794	TTAAAG	2	12	22898	22909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189218041
13	NC_010794	GGATAA	2	12	24434	24445	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	189218041
14	NC_010794	CTGAAG	2	12	32284	32295	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189218050
15	NC_010794	TGCGGC	2	12	35831	35842	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189218052
16	NC_010794	TGTTTT	2	12	37620	37631	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	189218053
17	NC_010794	ACCCCT	2	12	41557	41568	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	189218059
18	NC_010794	GCTTTG	2	12	42036	42047	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	189218059
19	NC_010794	TTTCAG	2	12	44485	44496	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189218065
20	NC_010794	ATAGGA	2	12	45276	45287	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	189218066
21	NC_010794	AATTTC	2	12	47108	47119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189218067
22	NC_010794	AGGATG	2	12	47899	47910	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	189218068
23	NC_010794	CTCTCA	2	12	54302	54313	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189218077
24	NC_010794	ATATTT	2	12	61239	61250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189218083
25	NC_010794	GGGGAT	2	12	62201	62212	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	189218084
26	NC_010794	TTAATC	2	12	63036	63047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189218084
27	NC_010794	TTTTCT	2	12	69111	69122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189218090
28	NC_010794	GGAAAA	2	12	70653	70664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189218091
29	NC_010794	GCCTTT	2	12	75775	75786	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189218098
30	NC_010794	GAGAAA	2	12	77254	77265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010794	CTTTTA	2	12	77553	77564	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189218099
32	NC_010794	GCTTTT	2	12	84679	84690	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189218106
33	NC_010794	TTTAAC	2	12	85619	85630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189218107
34	NC_010794	TTCGTG	2	12	92458	92469	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	189218112
35	NC_010794	TAAAAA	2	12	93813	93824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189218114
36	NC_010794	CTTATT	2	12	95054	95065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189218116
37	NC_010794	TGCTTC	2	12	97407	97418	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189218118
38	NC_010794	CCTTAT	2	12	100836	100847	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189218121
39	NC_010794	TCTTTT	2	12	103106	103117	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189218123
40	NC_010794	GTTCAA	2	12	105854	105865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189218126
41	NC_010794	CCAGTA	2	12	108743	108754	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189218128
42	NC_010794	GTTAAA	2	12	109362	109373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189218129
43	NC_010794	ATGAAC	2	12	116632	116643	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189218134
44	NC_010794	GTTCGA	2	12	117543	117554	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189218134
45	NC_010794	AGCGGG	2	12	119242	119253	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	189218135
46	NC_010794	TGGAAA	2	12	122342	122353	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	189218137
47	NC_010794	TACAAT	2	12	129378	129389	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189218141
48	NC_010794	AAAAGA	2	12	130277	130288	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189218142
49	NC_010794	GGTTTT	2	12	136135	136146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189218145
50	NC_010794	ATAATG	2	12	138829	138840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010794	ATATCG	2	12	139358	139369	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189218149
52	NC_010794	CCAATT	2	12	140024	140035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189218149
53	NC_010794	GACGGG	2	12	141243	141254	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	189218149
54	NC_010794	GAAGTC	2	12	142842	142853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189218151
55	NC_010794	CATCTC	2	12	149400	149411	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189218164
56	NC_010794	GAAAAA	2	12	157188	157199	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189218170
57	NC_010794	GGCTCG	2	12	161850	161861	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189218174
58	NC_010794	CCGATG	2	12	162215	162226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189218174
59	NC_010794	CTGTTT	2	12	172796	172807	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189218185
60	NC_010794	TTGAAT	2	12	175562	175573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010794	TTTTTC	2	12	176291	176302	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189218191
62	NC_010794	AGGCTA	2	12	178055	178066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010794	CTATGG	2	12	180015	180026	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010794	CCTATT	2	12	183292	183303	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189218197
65	NC_010794	CATTGC	2	12	184566	184577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189218198
66	NC_010794	CTTTTT	2	12	189223	189234	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010794	TCAGGA	2	12	194445	194456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189218210
68	NC_010794	TCGACT	2	12	201422	201433	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189218219
69	NC_010794	TTTCCT	2	12	202593	202604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189218220
70	NC_010794	ATGGCT	2	12	203386	203397	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189218221
71	NC_010794	ATTGGA	2	12	210549	210560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189218229
72	NC_010794	CCTCTC	2	12	216170	216181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189218233
73	NC_010794	CCGGGA	2	12	216782	216793	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189218233
74	NC_010794	TAAAAA	2	12	218087	218098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189218234
75	NC_010794	TGGGGT	2	12	218861	218872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189218235
76	NC_010794	GGCGGG	2	12	219509	219520	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	189218235
77	NC_010794	CGTTAT	2	12	220816	220827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189218238
78	NC_010794	TGAATT	2	12	224114	224125	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010794	AGGGAA	2	12	224420	224431	50 %	0 %	50 %	0 %	189218243
80	NC_010794	TCTTTT	2	12	224765	224776	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189218243
81	NC_010794	CAATGC	2	12	226821	226832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189218245
82	NC_010794	TGCCTT	2	12	230759	230770	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189218249
83	NC_010794	TCCAAT	2	12	231404	231415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010794	CGATAT	2	12	232652	232663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189218253
85	NC_010794	GTTGAA	2	12	233751	233762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189218253
86	NC_010794	ATATTG	2	12	236569	236580	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189218254
87	NC_010794	ATACGG	2	12	237335	237346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189218255
88	NC_010794	TTTTGG	2	12	238090	238101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189218256
89	NC_010794	GAATTT	2	12	238151	238162	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189218256
90	NC_010794	TCGACT	2	12	239230	239241	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189218258
91	NC_010794	CTCCTT	2	12	241298	241309	0 %	50 %	0 %	50 %	189218258
92	NC_010794	GGGAAA	2	12	242648	242659	50 %	0 %	50 %	0 %	189218259
93	NC_010794	AAAATA	2	12	247187	247198	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189218263
94	NC_010794	TTTATT	2	12	249986	249997	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189218268
95	NC_010794	AGCAAA	2	12	253353	253364	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189218271
96	NC_010794	GAAATA	2	12	264162	264173	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010794	AGGATA	2	12	265013	265024	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	189218282
98	NC_010794	CCTATT	2	12	265276	265287	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189218282
99	NC_010794	TTGGGA	2	12	268284	268295	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	189218285
100	NC_010794	CAAAAC	2	12	271570	271581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189218290
101	NC_010794	AAAGAA	2	12	271790	271801	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189218291
102	NC_010794	TTTCTT	3	18	278912	278929	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189218298
103	NC_010794	ATAGGC	2	12	279222	279233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189218298
104	NC_010794	ATGGGT	2	12	281737	281748	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	189218302
105	NC_010794	TCGTTG	2	12	283196	283207	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	189218304
106	NC_010794	GATTGG	2	12	283796	283807	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	189218304
107	NC_010794	TAAAAA	2	12	294329	294340	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189218316
108	NC_010794	ATTTTT	2	12	302706	302717	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189218325
109	NC_010794	TTGGCA	2	12	302878	302889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189218325
110	NC_010794	ATTTCC	2	12	304242	304253	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189218327
111	NC_010794	CAACCT	2	12	313112	313123	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010794	CGGGTC	2	12	317009	317020	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189218335
113	NC_010794	GCCATG	2	12	318268	318279	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189218336
114	NC_010794	GATCCG	2	12	320518	320529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189218337
115	NC_010794	GAGATT	2	12	321034	321045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189218338
116	NC_010794	CCTGCG	2	12	322187	322198	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189218338
117	NC_010794	AGCAGG	2	12	322597	322608	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	189218338
118	NC_010794	CCTTGG	2	12	326499	326510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189218340
119	NC_010794	ACCATC	2	12	327281	327292	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	189218340
120	NC_010794	GACCAG	2	12	330639	330650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189218341
121	NC_010794	TTGACG	2	12	333656	333667	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189218342
122	NC_010794	AAAAGC	2	12	337756	337767	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189218345
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124	NC_010794	AGGAAG	2	12	340686	340697	50 %	0 %	50 %	0 %	189218346
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128	NC_010794	GGCAAT	2	12	359605	359616	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189218366
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131	NC_010794	AGCCAA	2	12	367759	367770	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189218380
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231	NC_010794	CCGCGG	2	12	616806	616817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
232	NC_010794	TATGGA	2	12	621028	621039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189218653
233	NC_010794	GGAAAG	2	12	621702	621713	50 %	0 %	50 %	0 %	189218654
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236	NC_010794	TTGGCA	2	12	630020	630031	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189218663
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465	NC_010794	CCCCTT	2	12	1239612	1239623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189219341
466	NC_010794	AGGGCA	2	12	1243197	1243208	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	189219346
467	NC_010794	ATTTGA	2	12	1244385	1244396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189219346
468	NC_010794	GGGTCT	2	12	1247649	1247660	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189219348
469	NC_010794	CGGAAT	2	12	1248022	1248033	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189219348
470	NC_010794	GGAGGC	2	12	1248094	1248105	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	189219348
471	NC_010794	GTCTTT	2	12	1249936	1249947	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189219350
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473	NC_010794	CTTGGG	2	12	1253574	1253585	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189219357
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