MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylacidiphilum infernorum V4

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010794	ATAAAA	2	12	218	229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010794	AAAATC	2	12	22672	22683	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010794	GAGAAA	2	12	77254	77265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010794	ATAATG	2	12	138829	138840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010794	TTGAAT	2	12	175562	175573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010794	AGGCTA	2	12	178055	178066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010794	CTATGG	2	12	180015	180026	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010794	CTTTTT	2	12	189223	189234	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010794	TGAATT	2	12	224114	224125	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010794	TCCAAT	2	12	231404	231415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010794	GAAATA	2	12	264162	264173	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010794	CAACCT	2	12	313112	313123	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010794	TAACTT	2	12	366750	366761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010794	ATTTTT	2	12	372617	372628	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010794	GCAGGA	2	12	455731	455742	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010794	GTTTTT	2	12	500355	500366	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010794	ATATAA	2	12	505110	505121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010794	ATAAAA	3	18	542561	542578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010794	GACTTG	2	12	560746	560757	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010794	AAAAAT	2	12	570402	570413	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010794	GGGATG	2	12	614019	614030	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010794	CCGCGG	2	12	616806	616817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010794	ATTTGG	2	12	656114	656125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010794	TGTATA	2	12	658059	658070	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010794	TTTTTA	2	12	658190	658201	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010794	TGGTTT	2	12	698797	698808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010794	CTTGCC	2	12	710129	710140	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010794	CGATTT	2	12	718861	718872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010794	CTTTAG	2	12	721501	721512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010794	TATTTT	2	12	735466	735477	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010794	TTAAAA	2	12	809625	809636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010794	ATAAGA	2	12	821059	821070	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010794	CTAGTC	2	12	824604	824615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010794	GTAAAA	2	12	825770	825781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010794	AATGCA	2	12	826872	826883	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010794	AATGCA	2	12	827006	827017	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010794	AAGATA	2	12	840094	840105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010794	TCCTGG	2	12	840544	840555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010794	ACGCGC	2	12	886301	886312	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010794	AAATGG	2	12	940749	940760	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010794	GAAGGA	2	12	958723	958734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010794	AAAAAT	2	12	979076	979087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010794	GATATA	2	12	987511	987522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010794	CTTTTC	2	12	1007146	1007157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010794	AAGAGG	2	12	1015730	1015741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010794	TAAAAA	2	12	1068225	1068236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010794	TATAAA	2	12	1144853	1144864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010794	ATTCCT	2	12	1149757	1149768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010794	AAAAAT	2	12	1156012	1156023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010794	GATTTT	2	12	1217880	1217891	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010794	GAAATT	2	12	1221088	1221099	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010794	TACAAG	2	12	1250078	1250089	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010794	TAACTT	2	12	1299337	1299348	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010794	AAACAA	2	12	1299413	1299424	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010794	TTCTTT	2	12	1340445	1340456	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010794	AATATT	2	12	1400790	1400801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010794	CCTTTT	2	12	1421023	1421034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010794	CATTTC	2	12	1479421	1479432	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010794	TCCCAC	2	12	1479893	1479904	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010794	TTGTTT	2	12	1523380	1523391	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010794	TTAAAA	2	12	1524556	1524567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010794	AGGCTC	2	12	1547260	1547271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010794	GCCTTA	2	12	1588108	1588119	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010794	CTGAAG	2	12	1613907	1613918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010794	TAATTT	2	12	1656264	1656275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010794	ACCGCG	2	12	1686208	1686219	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010794	CATGAG	2	12	1725940	1725951	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010794	GCGCGT	2	12	1752083	1752094	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010794	TCTTGA	2	12	1770224	1770235	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010794	AAAAGA	2	12	1834089	1834100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010794	AAAAAG	2	12	1870679	1870690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010794	CTTTTC	2	12	1906526	1906537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010794	CTTTTT	2	12	1948180	1948191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010794	CTTCTC	2	12	2020994	2021005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010794	ATCCTT	2	12	2027702	2027713	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010794	TTTTTA	2	12	2057610	2057621	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010794	TTGATA	2	12	2071838	2071849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010794	CAAGCC	2	12	2080511	2080522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010794	CATGAA	2	12	2086216	2086227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010794	ATAAAG	2	12	2106418	2106429	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010794	AAAAGA	2	12	2108924	2108935	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010794	TTTTCT	2	12	2108948	2108959	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010794	TTTCCC	2	12	2176185	2176196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010794	AAAAGA	2	12	2226304	2226315	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010794	CTTTGC	2	12	2241572	2241583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010794	TCCTTC	2	12	2286080	2286091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.