MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylacidiphilum infernorum V4

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010794	ATTTT	2	10	1777	1786	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010794	TTTTC	2	10	10392	10401	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010794	AATAG	2	10	36441	36450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010794	TTTTC	2	10	39935	39944	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010794	ACGGA	2	10	50112	50121	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010794	GGGGA	2	10	50506	50515	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010794	CGGGC	2	10	50584	50593	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010794	TGCGG	2	10	50660	50669	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010794	GAGGG	2	10	55132	55141	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010794	ATCTT	2	10	59290	59299	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010794	CTTTT	2	10	61275	61284	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010794	AATTT	2	10	64136	64145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010794	AAAAG	2	10	68587	68596	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010794	ATATG	2	10	73679	73688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010794	ATAAA	2	10	94966	94975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010794	ACGGA	2	10	96017	96026	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010794	GCTTT	2	10	96069	96078	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010794	TGCTT	2	10	96228	96237	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010794	AAATG	2	10	119776	119785	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010794	GCTTT	2	10	147103	147112	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010794	TTTTC	2	10	148898	148907	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010794	CTCAT	2	10	151773	151782	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010794	AAGGT	2	10	152152	152161	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010794	GTTAA	2	10	154087	154096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010794	TAGAA	2	10	160424	160433	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010794	AAAGG	2	10	166110	166119	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010794	TAATA	2	10	169696	169705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010794	TTTAT	2	10	171303	171312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010794	TTAAA	2	10	189050	189059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010794	CCTTC	2	10	193848	193857	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_010794	TTGAC	2	10	228844	228853	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010794	AATAA	2	10	242776	242785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010794	GGCCT	2	10	267058	267067	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_010794	GGAGG	2	10	276591	276600	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010794	CACTC	2	10	294079	294088	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_010794	AAAGT	2	10	309704	309713	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010794	CTCGT	2	10	313689	313698	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_010794	GCATG	2	10	334143	334152	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010794	AATTA	2	10	336451	336460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010794	ATTGC	2	10	342732	342741	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010794	AATAA	3	15	346289	346303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010794	GCAAG	2	10	356959	356968	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010794	GCAAG	2	10	357013	357022	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010794	ACGGA	2	10	357542	357551	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010794	AAAAG	2	10	363930	363939	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010794	CTTTT	2	10	367565	367574	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010794	GGAAA	2	10	376572	376581	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010794	AGCGC	2	10	381253	381262	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_010794	CTGTA	2	10	382559	382568	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010794	AAATA	2	10	382925	382934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010794	AAATA	2	10	388230	388239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010794	GTTTG	2	10	400559	400568	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010794	TAATT	2	10	411366	411375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010794	TAAAA	2	10	414512	414521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010794	GAAAA	2	10	421077	421086	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010794	AAAAG	2	10	430116	430125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010794	TTTAG	2	10	446172	446181	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010794	AAACA	2	10	461234	461243	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010794	CTTTT	2	10	478950	478959	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010794	CTTTC	2	10	511746	511755	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010794	AAAGA	2	10	538275	538284	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010794	ATTTT	2	10	541231	541240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010794	TTGAA	2	10	543792	543801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010794	GAAAA	2	10	548839	548848	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010794	TTAAT	2	10	559196	559205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010794	GAAAA	2	10	561259	561268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010794	TCCTT	2	10	566001	566010	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_010794	GCGTA	2	10	575967	575976	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010794	TGTCT	2	10	600857	600866	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010794	GGGGA	2	10	617007	617016	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010794	CAAGG	2	10	617021	617030	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010794	TTTTC	2	10	638769	638778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010794	TTTTC	2	10	654093	654102	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010794	GGTGG	2	10	658076	658085	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010794	CTAAG	2	10	658747	658756	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010794	CGAAG	2	10	698781	698790	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010794	AGAAA	2	10	699829	699838	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010794	TTTCT	2	10	702087	702096	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010794	TTATA	2	10	710086	710095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010794	ATTTT	2	10	710119	710128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010794	AAACA	2	10	727920	727929	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010794	TTAAA	2	10	738405	738414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010794	CCTTT	2	10	739794	739803	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_010794	AGTTT	2	10	740672	740681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010794	GAAAA	2	10	746229	746238	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010794	TTTTA	2	10	753883	753892	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010794	TATAG	2	10	755262	755271	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010794	TTATA	2	10	755296	755305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010794	GGAAG	2	10	757160	757169	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010794	TGGAG	2	10	759726	759735	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010794	GGGGA	2	10	768371	768380	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010794	GATGG	2	10	797014	797023	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010794	ATTTT	2	10	797062	797071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010794	TAGGG	2	10	808124	808133	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010794	TAAAA	2	10	809656	809665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010794	AAAGG	2	10	815464	815473	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010794	AAAGG	2	10	815477	815486	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010794	TACGA	2	10	822641	822650	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010794	GCTAT	2	10	824545	824554	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010794	CAACC	2	10	824653	824662	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_010794	GTTTT	2	10	839670	839679	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010794	AAAAT	2	10	854577	854586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010794	TAAAA	2	10	873720	873729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010794	AAAAT	2	10	885541	885550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010794	TCGTG	2	10	893092	893101	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010794	TCGGT	2	10	893748	893757	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010794	TGTAG	2	10	893955	893964	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010794	GCGAA	2	10	894862	894871	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010794	AGCGG	2	10	897011	897020	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010794	AGGGA	2	10	924793	924802	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010794	GGATA	2	10	931751	931760	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010794	GCGCT	2	10	935764	935773	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_010794	AGGAA	2	10	937502	937511	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010794	TTCTT	2	10	940723	940732	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010794	AAATA	2	10	944825	944834	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010794	TTGCT	2	10	948395	948404	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010794	GCTTT	2	10	973483	973492	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_010794	TCCTT	2	10	986378	986387	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_010794	CTTTA	2	10	1010109	1010118	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010794	TGGAA	2	10	1015775	1015784	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010794	TTTGG	2	10	1016010	1016019	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010794	GATAA	2	10	1026607	1026616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010794	AAAAT	2	10	1029329	1029338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010794	CTTTT	2	10	1030083	1030092	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010794	AGATA	2	10	1032071	1032080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010794	CGGGC	2	10	1062706	1062715	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010794	TATAA	2	10	1069114	1069123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010794	GAAAA	2	10	1069134	1069143	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010794	TTCTT	2	10	1079707	1079716	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010794	CTTTT	2	10	1087364	1087373	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010794	AATAA	2	10	1116871	1116880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010794	TATTT	2	10	1136695	1136704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010794	AATGA	2	10	1145660	1145669	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010794	TAATT	2	10	1175508	1175517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010794	GCTTA	2	10	1203097	1203106	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010794	TTCTT	2	10	1222476	1222485	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010794	AAAGA	2	10	1223671	1223680	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010794	AAAAT	2	10	1231949	1231958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010794	CCGGG	2	10	1240266	1240275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_010794	TTTTC	2	10	1249856	1249865	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_010794	GAAAA	2	10	1253918	1253927	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010794	ATTCT	2	10	1254331	1254340	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010794	TACAA	2	10	1260664	1260673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010794	ATATT	2	10	1262828	1262837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010794	ATCGT	2	10	1269135	1269144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_010794	CAAGC	2	10	1286302	1286311	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_010794	AAAAG	2	10	1299510	1299519	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.