MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 13108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010741	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025237
2	NC_010741	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025237
3	NC_010741	ACA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025237
4	NC_010741	CTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025237
5	NC_010741	AAG	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025237
6	NC_010741	TGT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025237
7	NC_010741	TTC	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025237
8	NC_010741	TTC	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025237
9	NC_010741	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025237
10	NC_010741	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025237
11	NC_010741	ACT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025237
12	NC_010741	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025237
13	NC_010741	GTG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010741	TTC	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010741	TAT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010741	TAA	2	6	1621	1626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010741	GGA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010741	AAG	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025238
19	NC_010741	GCT	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025238
20	NC_010741	TGT	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025238
21	NC_010741	CAA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025238
22	NC_010741	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025238
23	NC_010741	AGG	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025238
24	NC_010741	AGA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025238
25	NC_010741	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025238
26	NC_010741	GCA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025238
27	NC_010741	TCT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025238
28	NC_010741	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025238
29	NC_010741	GTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025238
30	NC_010741	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025238
31	NC_010741	CAG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025238
32	NC_010741	TTG	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025238
33	NC_010741	GAA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025238
34	NC_010741	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025238
35	NC_010741	AGG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025238
36	NC_010741	CAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025238
37	NC_010741	TGC	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025239
38	NC_010741	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025239
39	NC_010741	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025239
40	NC_010741	TAT	2	6	3373	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025239
41	NC_010741	CTC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025239
42	NC_010741	GAG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025239
43	NC_010741	GAT	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025239
44	NC_010741	ATG	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025239
45	NC_010741	AAT	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189025239
46	NC_010741	CGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025240
47	NC_010741	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025240
48	NC_010741	GAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025240
49	NC_010741	GAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025241
50	NC_010741	GGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025241
51	NC_010741	TTC	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025241
52	NC_010741	TCT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025241
53	NC_010741	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025241
54	NC_010741	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025241
55	NC_010741	TAC	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025241
56	NC_010741	ACG	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025241
57	NC_010741	GTA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025241
58	NC_010741	ATC	2	6	5579	5584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025241
59	NC_010741	TCT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025241
60	NC_010741	GGA	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025241
61	NC_010741	GTT	2	6	5801	5806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025241
62	NC_010741	GAT	2	6	5843	5848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025241
63	NC_010741	AGA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025241
64	NC_010741	GGA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025241
65	NC_010741	GGC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025241
66	NC_010741	TTA	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025241
67	NC_010741	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189025241
68	NC_010741	ACT	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025241
69	NC_010741	TAT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025241
70	NC_010741	TTA	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025241
71	NC_010741	AAC	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025241
72	NC_010741	AGA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025241
73	NC_010741	GTG	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025241
74	NC_010741	TAG	3	9	6798	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025241
75	NC_010741	TGT	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010741	GAG	2	6	6936	6941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010741	GGA	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010741	GGA	2	6	7135	7140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025242
79	NC_010741	CTT	2	6	7141	7146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025242
80	NC_010741	GAT	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025242
81	NC_010741	TGC	2	6	7462	7467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025242
82	NC_010741	ACT	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025242
83	NC_010741	TGA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025242
84	NC_010741	GCA	2	6	7626	7631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025242
85	NC_010741	TCA	2	6	7801	7806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025242
86	NC_010741	TTG	2	6	7812	7817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025242
87	NC_010741	GAT	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025243
88	NC_010741	TCT	2	6	8401	8406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010741	AAG	2	6	8745	8750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010741	GCA	2	6	8770	8775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010741	CTG	2	6	8784	8789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010741	ACG	2	6	8809	8814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010741	ATC	2	6	8916	8921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010741	GCA	2	6	8950	8955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010741	CGC	2	6	9009	9014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010741	CCT	2	6	9034	9039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010741	ACG	2	6	9117	9122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010741	TCT	2	6	9146	9151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010741	CGA	2	6	9173	9178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010741	TGT	2	6	9311	9316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010741	CCT	2	6	9356	9361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010741	CTT	2	6	9402	9407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010741	TCT	2	6	9539	9544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010741	GTG	2	6	9617	9622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010741	GCT	2	6	9829	9834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010741	GAT	2	6	9930	9935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010741	AGT	2	6	10141	10146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010741	CAC	2	6	10159	10164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010741	GAA	2	6	10245	10250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025244
110	NC_010741	GTG	2	6	10289	10294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025244
111	NC_010741	AGT	2	6	10323	10328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025244
112	NC_010741	TCC	2	6	10495	10500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025245
113	NC_010741	CTG	2	6	10517	10522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025245
114	NC_010741	GTC	2	6	10537	10542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025245
115	NC_010741	AGC	2	6	10609	10614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025245
116	NC_010741	TTG	2	6	10633	10638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025245
117	NC_010741	GAC	2	6	10764	10769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025245
118	NC_010741	GAA	2	6	10793	10798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025245
119	NC_010741	TAC	2	6	10905	10910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025245
120	NC_010741	TGG	2	6	10950	10955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025245
121	NC_010741	TCG	2	6	11032	11037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025245
122	NC_010741	GCA	2	6	11197	11202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025245
123	NC_010741	CAT	2	6	11251	11256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025245
124	NC_010741	AAG	2	6	11359	11364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025245
125	NC_010741	TTG	2	6	11456	11461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025245
126	NC_010741	CTG	2	6	11462	11467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025245
127	NC_010741	CGC	2	6	11487	11492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025245
128	NC_010741	CAC	2	6	11510	11515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189025245
129	NC_010741	CCT	2	6	11557	11562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025245
130	NC_010741	CGT	2	6	11583	11588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025245
131	NC_010741	GGT	2	6	11677	11682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025245
132	NC_010741	AGT	2	6	11800	11805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025245
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136	NC_010741	TGC	2	6	12081	12086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025245
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139	NC_010741	CGT	2	6	12295	12300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025245
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244	NC_010741	TAA	2	6	21450	21455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_010741	GAT	2	6	22669	22674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025254
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261	NC_010741	GGA	2	6	22944	22949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025254
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