MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella abortus S19 chromosome 2

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010740	CTCGTC	2	12	27011	27022	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010740	TGCTTT	2	12	52967	52978	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010740	TGGCTA	2	12	114300	114311	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010740	GCGCTG	2	12	129209	129220	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010740	GATGCC	2	12	144645	144656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010740	TGCCGG	2	12	144953	144964	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010740	GGGGGC	3	18	155784	155801	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010740	GCGGTG	2	12	155804	155815	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010740	CTGGTC	2	12	155894	155905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010740	GAAAAG	2	12	171507	171518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010740	GGCAAG	2	12	233490	233501	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010740	TCGATA	2	12	250862	250873	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010740	AAGGTG	2	12	251535	251546	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010740	TGTCGC	2	12	291144	291155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010740	CCATAA	2	12	325278	325289	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010740	ACAGTC	2	12	354484	354495	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010740	GATATC	2	12	375666	375677	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010740	GCATAT	2	12	413934	413945	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010740	CGACAA	2	12	415116	415127	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010740	CGGTCA	2	12	415361	415372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010740	TCCTTT	2	12	468720	468731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010740	AAAGGC	2	12	473746	473757	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010740	GTTGAT	2	12	489295	489306	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010740	ATTACT	2	12	491020	491031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010740	CCTTTT	2	12	509117	509128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010740	TTGTGA	2	12	530823	530834	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010740	TGCTTT	2	12	545734	545745	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010740	GGCTGC	2	12	602462	602473	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010740	ATATCG	2	12	610917	610928	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010740	GATGCT	2	12	636647	636658	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010740	CATACG	2	12	659014	659025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010740	TTTTGA	2	12	677025	677036	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010740	TAGCTC	2	12	677267	677278	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010740	GGGAAA	2	12	692457	692468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010740	TAAGAA	2	12	713724	713735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010740	GCCTAT	2	12	748499	748510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010740	CTTGCC	2	12	782155	782166	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010740	AGCGGC	2	12	784261	784272	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010740	CCCAAT	2	12	784273	784284	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010740	CAGGCG	2	12	784847	784858	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010740	TTTATT	2	12	790769	790780	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010740	CAAGGC	2	12	848181	848192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010740	TCCTTC	2	12	848651	848662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010740	TTAAAA	2	12	868743	868754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010740	CGGAAA	2	12	981988	981999	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010740	CTGCCG	2	12	1064520	1064531	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010740	AAATCG	2	12	1112009	1112020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010740	GCTGAT	2	12	1148845	1148856	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010740	TTCTCG	2	12	1152034	1152045	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010740	GAGGAA	2	12	1161433	1161444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.