MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1 chromosome

Total Repeats: 972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010730	ACAAAA	2	12	3597	3608	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	188995958
2	NC_010730	CATCAG	2	12	4976	4987	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188995959
3	NC_010730	TAACTT	2	12	12733	12744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010730	TCTTAC	2	12	17151	17162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188995969
5	NC_010730	TTTTAA	2	12	17514	17525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188995970
6	NC_010730	TCTTCC	2	12	18444	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	188995971
7	NC_010730	CCTCTT	2	12	20783	20794	0 %	50 %	0 %	50 %	188995974
8	NC_010730	TCTATA	2	12	25397	25408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188995979
9	NC_010730	TCAAAA	2	12	27904	27915	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010730	TACCAT	2	12	32751	32762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188995982
11	NC_010730	TAAAAA	2	12	33558	33569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188995983
12	NC_010730	GTTGAA	2	12	34142	34153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188995984
13	NC_010730	AGATTT	2	12	34270	34281	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188995984
14	NC_010730	GGAAAA	2	12	37916	37927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188995985
15	NC_010730	GCAAAA	2	12	38096	38107	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188995985
16	NC_010730	TGTTGA	2	12	38299	38310	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	188995985
17	NC_010730	TGATAT	2	12	40343	40354	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188995987
18	NC_010730	AGTTTA	2	12	41390	41401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010730	GCAATA	2	12	44221	44232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188995989
20	NC_010730	AGAAAA	2	12	45264	45275	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188995989
21	NC_010730	CCCATT	2	12	47756	47767	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	188995990
22	NC_010730	AGAAAA	2	12	49183	49194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188995991
23	NC_010730	AAAAAG	2	12	49530	49541	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188995992
24	NC_010730	TATTTT	2	12	51701	51712	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	188995995
25	NC_010730	ATTTAA	2	12	52042	52053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010730	AGTTTC	2	12	55154	55165	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188995998
27	NC_010730	AATCTT	2	12	56576	56587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188995999
28	NC_010730	ATCATA	2	12	59281	59292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188996002
29	NC_010730	CTGTTT	2	12	63365	63376	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	188996005
30	NC_010730	AAAGCC	2	12	65989	66000	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	188996008
31	NC_010730	GATGTT	2	12	67422	67433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	188996009
32	NC_010730	AAATTA	2	12	71036	71047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188996011
33	NC_010730	AAAGTA	2	12	75110	75121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188996013
34	NC_010730	CATAAA	2	12	81520	81531	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188996020
35	NC_010730	TTTTAA	2	12	87147	87158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188996026
36	NC_010730	ATTTAA	2	12	91064	91075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010730	TAAATC	2	12	94638	94649	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188996036
38	NC_010730	TTTTTC	2	12	94761	94772	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188996036
39	NC_010730	AAAAAG	2	12	95679	95690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188996037
40	NC_010730	TATGTT	2	12	98022	98033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188996038
41	NC_010730	CTTTTT	2	12	102517	102528	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188996041
42	NC_010730	CCAACA	2	12	103065	103076	50 %	0 %	0 %	50 %	188996041
43	NC_010730	AAGGCT	2	12	103980	103991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188996042
44	NC_010730	CATAAA	2	12	104882	104893	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188996042
45	NC_010730	TTTTTG	2	12	105452	105463	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010730	TCTTGG	2	12	106656	106667	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	188996043
47	NC_010730	AAATTG	2	12	109401	109412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188996046
48	NC_010730	GTTTTT	2	12	110690	110701	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	188996048
49	NC_010730	CAATAA	2	12	111011	111022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188996050
50	NC_010730	CTTAAA	2	12	113784	113795	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188996052
51	NC_010730	TTAAAA	2	12	113809	113820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188996052
52	NC_010730	TTATAA	2	12	116033	116044	50 %	50 %	0 %	0 %	188996053
53	NC_010730	ACTTCT	2	12	116963	116974	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188996055
54	NC_010730	TACCTT	2	12	118653	118664	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188996056
55	NC_010730	GATTTT	2	12	118922	118933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010730	ATTAAA	2	12	123701	123712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010730	CTTTAG	2	12	129077	129088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188996065
58	NC_010730	TTTCTT	2	12	130865	130876	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188996065
59	NC_010730	ATGGTT	2	12	134671	134682	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	188996070
60	NC_010730	TTTCTT	2	12	138292	138303	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188996073
61	NC_010730	AGCTGG	3	18	141483	141500	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188996077
62	NC_010730	TTCTAT	2	12	142042	142053	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188996078
63	NC_010730	AGATAA	2	12	144693	144704	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188996080
64	NC_010730	TAAATT	2	12	146556	146567	50 %	50 %	0 %	0 %	188996082
65	NC_010730	ATCTAT	2	12	147306	147317	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188996082
66	NC_010730	AAATTC	2	12	149630	149641	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188996084
67	NC_010730	TAGAGA	2	12	150952	150963	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188996085
68	NC_010730	TTTTAT	2	12	156228	156239	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	188996090
69	NC_010730	TAAAAA	2	12	157805	157816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010730	CAGAGA	2	12	167705	167716	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	188996098
71	NC_010730	TTTAAT	2	12	170706	170717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188996101
72	NC_010730	ATTGGA	2	12	177024	177035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188996108
73	NC_010730	CTGTTG	2	12	177808	177819	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	188996108
74	NC_010730	TTCATC	2	12	179660	179671	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188996111
75	NC_010730	TATCTA	2	12	182562	182573	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188996113
76	NC_010730	ATGTTT	2	12	185507	185518	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188996117
77	NC_010730	AAGAAA	2	12	188959	188970	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188996121
78	NC_010730	AAAAAC	2	12	189139	189150	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	188996121
79	NC_010730	TTGGAA	2	12	190228	190239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188996121
80	NC_010730	AAAGCA	2	12	191079	191090	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188996121
81	NC_010730	CGAAGA	2	12	192473	192484	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	188996123
82	NC_010730	TTTATG	2	12	193464	193475	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188996124
83	NC_010730	ATTTTT	2	12	197603	197614	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	188996128
84	NC_010730	ACTTTT	2	12	201555	201566	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188996134
85	NC_010730	TCTTTT	2	12	202898	202909	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188996134
86	NC_010730	CTTTTT	2	12	209859	209870	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188996141
87	NC_010730	ATATCT	2	12	210893	210904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188996142
88	NC_010730	ATTTTT	2	12	212254	212265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	188996142
89	NC_010730	CTCTTT	2	12	215367	215378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188996145
90	NC_010730	ATTCTT	2	12	215875	215886	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188996146
91	NC_010730	CTGATA	2	12	216116	216127	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188996146
92	NC_010730	AAAGAA	2	12	217092	217103	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188996147
93	NC_010730	GCTCTT	2	12	219413	219424	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	188996150
94	NC_010730	TTATTT	2	12	219789	219800	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	188996150
95	NC_010730	CATGTC	2	12	220790	220801	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	188996151
96	NC_010730	CTTTTG	2	12	224844	224855	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	188996156
97	NC_010730	TGAAGA	2	12	225361	225372	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188996157
98	NC_010730	GATATT	2	12	225677	225688	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188996157
99	NC_010730	GTTACA	2	12	227360	227371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188996159
100	NC_010730	TGAGCG	2	12	228463	228474	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010730	TAAAGT	2	12	228556	228567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010730	ATCTTC	2	12	229368	229379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188996160
103	NC_010730	TTTCAT	2	12	235433	235444	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188996164
104	NC_010730	AACTAA	2	12	243388	243399	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188996172
105	NC_010730	AACCTT	2	12	243932	243943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188996173
106	NC_010730	TAAGTT	2	12	243998	244009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188996174
107	NC_010730	TATTGC	2	12	244890	244901	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188996175
108	NC_010730	TCTCTT	2	12	245008	245019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188996175
109	NC_010730	TCTGTT	2	12	245685	245696	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	188996176
110	NC_010730	CTTTTA	2	12	247375	247386	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188996178
111	NC_010730	TTCTTT	2	12	251111	251122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188996181
112	NC_010730	ACTTGA	2	12	251325	251336	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188996181
113	NC_010730	GTCTGG	2	12	251913	251924	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	188996182
114	NC_010730	GGTAAA	2	12	252729	252740	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010730	AAAGAT	2	12	253632	253643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188996184
116	NC_010730	TAAAAA	2	12	254714	254725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188996185
117	NC_010730	TAGATA	2	12	255128	255139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188996185
118	NC_010730	ATTTTG	2	12	255341	255352	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188996185
119	NC_010730	ACTTTT	2	12	256631	256642	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188996187
120	NC_010730	TATGCA	2	12	256698	256709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188996187
121	NC_010730	ATTTAA	2	12	259061	259072	50 %	50 %	0 %	0 %	188996189
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238	NC_010730	TGAATT	2	12	481733	481744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188996411
239	NC_010730	TAAATA	2	12	481896	481907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188996411
240	NC_010730	ATGATC	2	12	482868	482879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188996413
241	NC_010730	TGTAAG	2	12	485330	485341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188996416
242	NC_010730	TTAATA	2	12	487932	487943	50 %	50 %	0 %	0 %	188996419
243	NC_010730	CTACTT	2	12	490320	490331	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188996421
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248	NC_010730	GATTTT	2	12	505317	505328	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188996435
249	NC_010730	CTTTTT	2	12	512392	512403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188996442
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257	NC_010730	ATTACC	2	12	522901	522912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188996453
258	NC_010730	CTTTGT	2	12	523017	523028	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	188996453
259	NC_010730	GACCAG	2	12	523485	523496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188996453
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283	NC_010730	TGTTTA	2	12	576625	576636	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188996503
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287	NC_010730	GGAGAT	2	12	580168	580179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_010730	TAATTC	2	12	582151	582162	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
292	NC_010730	TTCTAT	2	12	583043	583054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188996508
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294	NC_010730	CTTCCA	2	12	592573	592584	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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299	NC_010730	ATCAAC	2	12	599465	599476	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	188996524
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