MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1 chromosome

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010730	AAAAT	2	10	1562	1571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010730	AGATA	2	10	4459	4468	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010730	ACTTT	2	10	6461	6470	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010730	ATATT	2	10	9711	9720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010730	GAAAA	2	10	12800	12809	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010730	TATAA	2	10	15914	15923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010730	TAAAA	2	10	27510	27519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010730	TAAAA	2	10	27858	27867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010730	ATGGG	2	10	33428	33437	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010730	TTATC	2	10	41948	41957	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010730	CGAAG	2	10	46823	46832	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010730	TTAAA	2	10	52017	52026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010730	TTATA	2	10	53625	53634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010730	TTAAA	2	10	55089	55098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010730	CAGAG	2	10	66835	66844	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010730	TGAAA	2	10	71810	71819	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010730	CCTTA	2	10	71826	71835	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010730	CAAAT	2	10	78354	78363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010730	GTGAT	2	10	78384	78393	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010730	CAAAA	2	10	83102	83111	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010730	ATTAA	2	10	83893	83902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010730	TAAAG	2	10	85679	85688	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010730	GAAAA	2	10	86148	86157	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010730	TTGTT	2	10	90957	90966	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010730	CGAAG	2	10	91132	91141	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010730	CAAAA	2	10	101053	101062	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010730	TGAAA	2	10	112549	112558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010730	CCTTA	2	10	112565	112574	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_010730	GAAAA	2	10	118881	118890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010730	TTTAT	2	10	140866	140875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010730	ATTGA	2	10	140979	140988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010730	TAAAA	2	10	141033	141042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010730	AAAGT	2	10	151729	151738	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010730	GGAGG	2	10	157850	157859	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010730	TGAAA	2	10	158902	158911	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010730	ACATA	2	10	166551	166560	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010730	ATTTA	2	10	178677	178686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010730	TAAAA	3	15	178691	178705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010730	ACATT	2	10	181353	181362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010730	AACAA	2	10	209171	209180	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010730	CTTTT	2	10	210268	210277	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010730	AATAT	2	10	214479	214488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010730	AAAGT	2	10	226514	226523	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010730	AAAGT	2	10	228398	228407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010730	TATAA	2	10	235728	235737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010730	AGCGA	2	10	252640	252649	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010730	AGCGA	2	10	257438	257447	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010730	AGCGA	2	10	257571	257580	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010730	ACTTT	2	10	261378	261387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010730	GAAAA	2	10	265382	265391	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010730	TTTTA	2	10	268089	268098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010730	TTTTA	2	10	269958	269967	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010730	ATTAA	2	10	279233	279242	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010730	ATTTA	2	10	299295	299304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010730	TCTTT	2	10	327834	327843	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010730	TTTGA	2	10	336930	336939	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010730	TTTCA	2	10	342426	342435	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010730	TTTAA	2	10	354168	354177	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010730	GCCAA	2	10	354497	354506	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_010730	GCTCT	2	10	354666	354675	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010730	CCCCT	2	10	355509	355518	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
62	NC_010730	ATTGG	2	10	356039	356048	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010730	CACGA	2	10	358189	358198	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_010730	AGAGA	2	10	359791	359800	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010730	TTTTA	2	10	359897	359906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010730	AGGTC	2	10	370382	370391	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010730	TTTTA	2	10	373105	373114	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010730	AAAGT	2	10	376153	376162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010730	AGCGA	2	10	387083	387092	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010730	CTTCA	2	10	389713	389722	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_010730	TAAAT	2	10	395589	395598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010730	TTTCA	2	10	397212	397221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010730	ATATA	2	10	400552	400561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010730	AGCGA	2	10	404457	404466	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010730	GATTT	2	10	408101	408110	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010730	GAATA	2	10	426550	426559	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010730	CTAAG	2	10	440990	440999	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010730	ATAAA	2	10	441083	441092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010730	TTTAA	2	10	444576	444585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010730	AAAAT	2	10	444617	444626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010730	AGCGA	2	10	444865	444874	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010730	TAAAT	2	10	460670	460679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010730	AAATC	2	10	461605	461614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010730	AATAA	2	10	462417	462426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010730	AAATA	2	10	462976	462985	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010730	TTAAA	2	10	463019	463028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010730	CAATT	2	10	463060	463069	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010730	AATAC	2	10	464247	464256	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010730	AAATA	2	10	489376	489385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010730	AAAGT	2	10	489878	489887	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010730	ACTTT	2	10	517442	517451	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010730	TAAAA	2	10	531771	531780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010730	TTTTA	2	10	555463	555472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010730	ACTTT	2	10	576094	576103	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010730	TAACA	2	10	577838	577847	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010730	TTAAT	2	10	578353	578362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010730	CTTTT	2	10	582081	582090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010730	AAAAT	2	10	604419	604428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010730	CATAG	2	10	610761	610770	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010730	TCAAA	2	10	611066	611075	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010730	AGCGA	2	10	616423	616432	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010730	AAATA	2	10	619807	619816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010730	AATAA	2	10	621467	621476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010730	AGCTA	2	10	639254	639263	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010730	GAAAA	2	10	642166	642175	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010730	TAATA	2	10	648478	648487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010730	TACTT	2	10	652419	652428	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010730	TTTCA	2	10	654523	654532	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010730	GGGAG	2	10	662680	662689	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010730	AAAGT	2	10	672203	672212	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010730	CATAT	2	10	683277	683286	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010730	GAAAA	2	10	692381	692390	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010730	ATTTT	2	10	692688	692697	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010730	ATTTT	2	10	693054	693063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010730	TCAAA	2	10	694557	694566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010730	GTATA	3	15	704794	704808	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010730	TCCCC	2	10	712472	712481	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
118	NC_010730	TCAAA	2	10	739919	739928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010730	TTTCT	2	10	740224	740233	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010730	ATTTT	2	10	740289	740298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010730	ATTTT	2	10	745052	745061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010730	AACGG	2	10	745161	745170	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010730	TAAAA	2	10	747367	747376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010730	GAAAA	2	10	747479	747488	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010730	GCCAA	2	10	749837	749846	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_010730	GCTCT	2	10	750006	750015	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010730	CCCCT	2	10	750849	750858	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_010730	ATTGG	2	10	751379	751388	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010730	CACGA	2	10	753621	753630	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_010730	CTTTT	2	10	754850	754859	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010730	TTCCT	2	10	755517	755526	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_010730	AAAAC	2	10	768677	768686	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010730	ACCTT	2	10	771696	771705	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_010730	ATTTA	2	10	771946	771955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010730	AGTAA	2	10	772000	772009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010730	AGCGA	2	10	778457	778466	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010730	ATATT	2	10	778734	778743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010730	TTTTC	2	10	778756	778765	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010730	ACTTT	2	10	781932	781941	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010730	AAACA	2	10	789051	789060	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_010730	TAAAA	2	10	794659	794668	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010730	TTTGA	2	10	802089	802098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010730	CTTCG	2	10	802117	802126	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_010730	TCTAA	2	10	802306	802315	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010730	TTAAA	2	10	807382	807391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010730	ATCTT	2	10	808995	809004	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_010730	GCGAA	2	10	812231	812240	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010730	GCCAA	2	10	822036	822045	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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318	NC_010730	GAAAA	2	10	1838300	1838309	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.