MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Porphyromonas gingivalis ATCC 33277

Total Repeats: 295

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010729	CGAAA	2	10	7023	7032	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010729	GAAGG	2	10	10070	10079	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010729	TCTTT	2	10	15507	15516	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010729	CCATC	2	10	24163	24172	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_010729	ACAAA	2	10	29880	29889	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010729	CTCTT	2	10	45478	45487	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010729	ATCAA	2	10	50534	50543	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010729	TTTTC	2	10	58146	58155	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010729	CCGAC	2	10	58487	58496	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_010729	AAGAA	2	10	83306	83315	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010729	AGTCC	2	10	115285	115294	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010729	AAACC	2	10	123500	123509	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010729	CGAGC	2	10	130853	130862	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_010729	ATTGT	2	10	133820	133829	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010729	CCCTT	2	10	134727	134736	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_010729	TGCAG	2	10	135335	135344	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010729	AACAA	2	10	143157	143166	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010729	AAGAA	2	10	168400	168409	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010729	ATTAT	2	10	168714	168723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010729	TAATA	2	10	169540	169549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010729	GCTTC	2	10	170315	170324	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010729	GCACC	2	10	180210	180219	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_010729	ATGTA	2	10	188120	188129	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010729	AGATT	2	10	190250	190259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010729	CAAAT	2	10	191541	191550	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010729	CAAGC	2	10	218278	218287	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010729	TTGAT	2	10	218297	218306	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010729	AGTTT	2	10	224143	224152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010729	GTATA	2	10	224181	224190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010729	ATTCG	2	10	225561	225570	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010729	TCGGA	2	10	230610	230619	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010729	ATATA	2	10	232816	232825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010729	CCGTA	2	10	233250	233259	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_010729	AAGAT	2	10	234391	234400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010729	TTCCT	2	10	234899	234908	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010729	AATCT	2	10	244053	244062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010729	TAGAA	2	10	254323	254332	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010729	GCCTT	2	10	254974	254983	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010729	ACCAT	2	10	258227	258236	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010729	ATGAA	2	10	261820	261829	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010729	CGTCC	2	10	265777	265786	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_010729	CGTTC	2	10	277766	277775	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_010729	ACAAA	2	10	295122	295131	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010729	AAAAG	2	10	318754	318763	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010729	CGATC	2	10	349408	349417	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010729	TAATT	2	10	355858	355867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010729	TTATG	2	10	357111	357120	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010729	AAAAG	2	10	366066	366075	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010729	GGATG	2	10	368786	368795	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010729	CGAGC	2	10	375259	375268	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010729	ATTTC	2	10	375503	375512	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010729	AAGAG	2	10	376682	376691	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010729	GGCTT	2	10	380831	380840	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010729	TCGTC	2	10	393087	393096	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_010729	GTTTA	2	10	393928	393937	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010729	TTATA	2	10	400555	400564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010729	GCCAC	2	10	426506	426515	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_010729	TTTTC	2	10	432813	432822	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010729	TTTTG	2	10	451725	451734	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010729	TATGA	2	10	458407	458416	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010729	GGTTT	2	10	475756	475765	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010729	TCGGA	2	10	478574	478583	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010729	ATATA	2	10	480780	480789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010729	CCGTA	2	10	481214	481223	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_010729	AAGAT	2	10	482355	482364	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010729	CGGCT	2	10	484438	484447	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_010729	TCTTA	2	10	487322	487331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010729	TAATA	2	10	503367	503376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010729	TTTTA	2	10	510485	510494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010729	AATAG	2	10	524262	524271	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010729	AGGAA	2	10	527237	527246	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010729	AAAAG	2	10	532472	532481	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010729	CAAAA	2	10	571269	571278	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010729	GTACA	2	10	576638	576647	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010729	TGTTT	2	10	576667	576676	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010729	AGAGA	2	10	586925	586934	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010729	TTTGC	2	10	591424	591433	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010729	AAATT	2	10	596363	596372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010729	GCAAT	2	10	596389	596398	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010729	TTGTC	2	10	601047	601056	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010729	TTTTG	2	10	614090	614099	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010729	TTCCG	2	10	626276	626285	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_010729	ACAAA	2	10	626518	626527	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010729	TTTGA	2	10	635106	635115	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010729	CGAGC	2	10	657306	657315	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_010729	TAAGA	2	10	669689	669698	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010729	ATTGC	2	10	696198	696207	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010729	CCGAT	2	10	696314	696323	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_010729	TCGGA	2	10	711448	711457	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010729	TAATA	2	10	711558	711567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010729	CATTC	2	10	717914	717923	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_010729	ACTAA	2	10	718219	718228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010729	CCCTT	2	10	720601	720610	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_010729	CTTTT	2	10	727146	727155	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010729	GTGTT	2	10	727534	727543	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010729	ATTTA	2	10	740169	740178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010729	TCTGC	2	10	741411	741420	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_010729	TCCAT	2	10	748755	748764	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_010729	TTGTT	2	10	754106	754115	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010729	TGGCG	2	10	775005	775014	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010729	CCTTT	2	10	776956	776965	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_010729	AATAA	2	10	780360	780369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010729	GTATC	2	10	803592	803601	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010729	TAATA	2	10	804610	804619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010729	AGGAA	2	10	804620	804629	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010729	TCGTA	2	10	813802	813811	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010729	AAACT	2	10	813905	813914	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010729	AACTA	2	10	813929	813938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010729	TTCTA	2	10	814085	814094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010729	TTCAG	2	10	815446	815455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010729	AGCTA	2	10	846401	846410	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010729	CAAAA	2	10	846424	846433	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010729	GTTTT	2	10	854927	854936	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010729	CCAAT	2	10	855349	855358	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_010729	ATAAA	2	10	867712	867721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010729	ATCTC	2	10	873312	873321	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_010729	TAAAA	2	10	888739	888748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010729	GATTT	2	10	909627	909636	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010729	GATAT	2	10	911833	911842	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010729	TATCC	2	10	916506	916515	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_010729	ACGAA	2	10	936365	936374	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010729	TAAAA	2	10	940937	940946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010729	TTTTC	2	10	946248	946257	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010729	CCTTT	2	10	947024	947033	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_010729	CAAAA	2	10	981697	981706	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010729	CAAGA	2	10	985335	985344	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010729	ATTTG	2	10	989710	989719	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010729	ATAAG	2	10	989852	989861	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010729	GGATC	2	10	989875	989884	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010729	ATACA	2	10	989913	989922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010729	GGCTC	2	10	992937	992946	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_010729	CTAAC	2	10	995176	995185	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_010729	TGTCC	2	10	1004330	1004339	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_010729	ACCCG	2	10	1009346	1009355	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_010729	TAATA	3	15	1009466	1009480	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010729	TTTTC	2	10	1027968	1027977	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010729	ATTTC	2	10	1031176	1031185	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010729	GAAAT	2	10	1043826	1043835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010729	AATAC	2	10	1043926	1043935	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010729	TGAAA	2	10	1045912	1045921	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010729	GAAAC	2	10	1059365	1059374	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010729	CTTAA	2	10	1065997	1066006	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010729	AATTA	2	10	1070150	1070159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010729	TCCTT	2	10	1082454	1082463	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_010729	TCCTG	2	10	1095087	1095096	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_010729	GAAAG	2	10	1109008	1109017	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010729	AGACG	2	10	1127163	1127172	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_010729	AAGAT	2	10	2300633	2300642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_010729	GTATT	2	10	2316372	2316381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_010729	AGAGA	2	10	2316501	2316510	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
289	NC_010729	AAGCA	2	10	2328902	2328911	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
290	NC_010729	GAGAT	2	10	2335419	2335428	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
291	NC_010729	TTGTG	2	10	2336516	2336525	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
292	NC_010729	CTATT	2	10	2339180	2339189	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
293	NC_010729	ACGGC	2	10	2344464	2344473	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
294	NC_010729	GAAAA	2	10	2346079	2346088	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
295	NC_010729	CAAAA	2	10	2354365	2354374	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.