MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium populi BJ001 plasmid pMPOP01

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010727	GCTCC	2	10	462	471	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_010727	CCAAG	2	10	3512	3521	40 %	0 %	20 %	40 %	188584603
3	NC_010727	GGCGA	2	10	3738	3747	20 %	0 %	60 %	20 %	188584603
4	NC_010727	GCCGT	2	10	3931	3940	0 %	20 %	40 %	40 %	188584603
5	NC_010727	GCGCA	2	10	4897	4906	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010727	CGCTG	2	10	5202	5211	0 %	20 %	40 %	40 %	188584605
7	NC_010727	CGGCG	2	10	5247	5256	0 %	0 %	60 %	40 %	188584605
8	NC_010727	GCCGA	2	10	5314	5323	20 %	0 %	40 %	40 %	188584605
9	NC_010727	ACGCG	2	10	6442	6451	20 %	0 %	40 %	40 %	188584607
10	NC_010727	GAACA	2	10	7086	7095	60 %	0 %	20 %	20 %	188584607
11	NC_010727	GACAC	2	10	7101	7110	40 %	0 %	20 %	40 %	188584607
12	NC_010727	CAGCT	2	10	7788	7797	20 %	20 %	20 %	40 %	188584607
13	NC_010727	TTCCA	2	10	8316	8325	20 %	40 %	0 %	40 %	188584607
14	NC_010727	CGGCT	2	10	8667	8676	0 %	20 %	40 %	40 %	188584607
15	NC_010727	CATCG	2	10	8844	8853	20 %	20 %	20 %	40 %	188584607
16	NC_010727	CATTC	2	10	9410	9419	20 %	40 %	0 %	40 %	188584608
17	NC_010727	CTCGC	2	10	10228	10237	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_010727	GCCGG	2	10	10387	10396	0 %	0 %	60 %	40 %	188584610
19	NC_010727	ACCGC	2	10	11338	11347	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_010727	TCGCT	2	10	12849	12858	0 %	40 %	20 %	40 %	188584612
21	NC_010727	GTTCA	2	10	15224	15233	20 %	40 %	20 %	20 %	188584616
22	NC_010727	GGTCA	2	10	15471	15480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010727	CACTC	2	10	17498	17507	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_010727	GCCGT	2	10	17605	17614	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010727	TAGGG	2	10	20767	20776	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.