MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium populi BJ001 plasmid pMPOP01

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010727	GACG	2	8	64	71	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010727	CCGC	2	8	117	124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_010727	ATGC	2	8	262	269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010727	GCGG	2	8	777	784	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010727	GCGA	2	8	1176	1183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010727	GCGA	2	8	1359	1366	25 %	0 %	50 %	25 %	188584602
7	NC_010727	GCCG	2	8	2055	2062	0 %	0 %	50 %	50 %	188584602
8	NC_010727	CGGG	2	8	2410	2417	0 %	0 %	75 %	25 %	188584602
9	NC_010727	CCGG	2	8	2653	2660	0 %	0 %	50 %	50 %	188584602
10	NC_010727	GCCG	2	8	3168	3175	0 %	0 %	50 %	50 %	188584603
11	NC_010727	GCGA	2	8	3471	3478	25 %	0 %	50 %	25 %	188584603
12	NC_010727	GCTG	2	8	3778	3785	0 %	25 %	50 %	25 %	188584603
13	NC_010727	TCAT	2	8	4871	4878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010727	GCCT	2	8	5726	5733	0 %	25 %	25 %	50 %	188584606
15	NC_010727	CGCT	2	8	5789	5796	0 %	25 %	25 %	50 %	188584606
16	NC_010727	CGTC	2	8	6072	6079	0 %	25 %	25 %	50 %	188584606
17	NC_010727	GATC	2	8	6875	6882	25 %	25 %	25 %	25 %	188584607
18	NC_010727	GGTC	2	8	7337	7344	0 %	25 %	50 %	25 %	188584607
19	NC_010727	GGCC	2	8	7661	7668	0 %	0 %	50 %	50 %	188584607
20	NC_010727	CTGG	2	8	7703	7710	0 %	25 %	50 %	25 %	188584607
21	NC_010727	CGCC	2	8	7721	7728	0 %	0 %	25 %	75 %	188584607
22	NC_010727	GACG	2	8	7766	7773	25 %	0 %	50 %	25 %	188584607
23	NC_010727	TCGA	2	8	7915	7922	25 %	25 %	25 %	25 %	188584607
24	NC_010727	GCGA	2	8	8343	8350	25 %	0 %	50 %	25 %	188584607
25	NC_010727	ACCT	2	8	8943	8950	25 %	25 %	0 %	50 %	188584607
26	NC_010727	CGGC	2	8	8981	8988	0 %	0 %	50 %	50 %	188584607
27	NC_010727	CAAG	2	8	9758	9765	50 %	0 %	25 %	25 %	188584609
28	NC_010727	GGTT	2	8	9945	9952	0 %	50 %	50 %	0 %	188584609
29	NC_010727	GGAA	2	8	10128	10135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010727	GACC	2	8	10642	10649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010727	GCCG	2	8	10652	10659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010727	AAAT	2	8	10887	10894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010727	GATG	2	8	10945	10952	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010727	GGTC	2	8	10984	10991	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010727	GAAG	2	8	11126	11133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010727	GCCG	2	8	11253	11260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010727	CGGC	2	8	11462	11469	0 %	0 %	50 %	50 %	188584611
38	NC_010727	CACC	2	8	11883	11890	25 %	0 %	0 %	75 %	188584611
39	NC_010727	CCGG	2	8	12036	12043	0 %	0 %	50 %	50 %	188584611
40	NC_010727	CCGG	2	8	12067	12074	0 %	0 %	50 %	50 %	188584611
41	NC_010727	CCGG	2	8	12132	12139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010727	CCGC	2	8	12220	12227	0 %	0 %	25 %	75 %	188584612
43	NC_010727	TCGC	2	8	12259	12266	0 %	25 %	25 %	50 %	188584612
44	NC_010727	GCCT	2	8	13268	13275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010727	CCGT	2	8	13557	13564	0 %	25 %	25 %	50 %	188584613
46	NC_010727	GCTG	2	8	14387	14394	0 %	25 %	50 %	25 %	188584615
47	NC_010727	GCTG	2	8	14876	14883	0 %	25 %	50 %	25 %	188584615
48	NC_010727	AGGC	2	8	14985	14992	25 %	0 %	50 %	25 %	188584615
49	NC_010727	GCGG	2	8	15079	15086	0 %	0 %	75 %	25 %	188584616
50	NC_010727	GCGG	2	8	16215	16222	0 %	0 %	75 %	25 %	188584617
51	NC_010727	CGAC	2	8	16359	16366	25 %	0 %	25 %	50 %	188584618
52	NC_010727	GGCC	2	8	16395	16402	0 %	0 %	50 %	50 %	188584618
53	NC_010727	GTCG	2	8	16646	16653	0 %	25 %	50 %	25 %	188584618
54	NC_010727	CCCG	2	8	16740	16747	0 %	0 %	25 %	75 %	188584618
55	NC_010727	CGGG	2	8	17586	17593	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010727	GCCC	2	8	18765	18772	0 %	0 %	25 %	75 %	188584620
57	NC_010727	GCCG	2	8	19688	19695	0 %	0 %	50 %	50 %	188584621
58	NC_010727	GCTC	2	8	19954	19961	0 %	25 %	25 %	50 %	188584621
59	NC_010727	GAAA	2	8	21039	21046	75 %	0 %	25 %	0 %	188584622
60	NC_010727	GGAT	2	8	21216	21223	25 %	25 %	50 %	0 %	188584622
61	NC_010727	GCCG	2	8	21531	21538	0 %	0 %	50 %	50 %	188584622
62	NC_010727	CGGC	2	8	22172	22179	0 %	0 %	50 %	50 %	188584622
63	NC_010727	CGTT	2	8	22346	22353	0 %	50 %	25 %	25 %	188584622
64	NC_010727	GCGG	2	8	22615	22622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010727	GCCG	2	8	22832	22839	0 %	0 %	50 %	50 %	188584623
66	NC_010727	GTGC	2	8	23161	23168	0 %	25 %	50 %	25 %	188584624
67	NC_010727	TGAG	2	8	23336	23343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010727	GTCG	2	8	23477	23484	0 %	25 %	50 %	25 %	188584625
69	NC_010727	AGCC	2	8	23914	23921	25 %	0 %	25 %	50 %	188584626
70	NC_010727	TTCG	2	8	24093	24100	0 %	50 %	25 %	25 %	188584626
71	NC_010727	CTCG	2	8	24137	24144	0 %	25 %	25 %	50 %	188584626
72	NC_010727	AGCG	2	8	24296	24303	25 %	0 %	50 %	25 %	188584626
73	NC_010727	GCCC	2	8	24553	24560	0 %	0 %	25 %	75 %	188584626
74	NC_010727	AGGT	2	8	24573	24580	25 %	25 %	50 %	0 %	188584626
75	NC_010727	GAGC	2	8	24854	24861	25 %	0 %	50 %	25 %	188584626

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.