MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium populi BJ001 plasmid pMPOP01

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010727	GCGA	2	8	1359	1366	25 %	0 %	50 %	25 %	188584602
2	NC_010727	GCCG	2	8	2055	2062	0 %	0 %	50 %	50 %	188584602
3	NC_010727	CGGG	2	8	2410	2417	0 %	0 %	75 %	25 %	188584602
4	NC_010727	CCGG	2	8	2653	2660	0 %	0 %	50 %	50 %	188584602
5	NC_010727	GCCG	2	8	3168	3175	0 %	0 %	50 %	50 %	188584603
6	NC_010727	GCGA	2	8	3471	3478	25 %	0 %	50 %	25 %	188584603
7	NC_010727	GCTG	2	8	3778	3785	0 %	25 %	50 %	25 %	188584603
8	NC_010727	GCCT	2	8	5726	5733	0 %	25 %	25 %	50 %	188584606
9	NC_010727	CGCT	2	8	5789	5796	0 %	25 %	25 %	50 %	188584606
10	NC_010727	CGTC	2	8	6072	6079	0 %	25 %	25 %	50 %	188584606
11	NC_010727	GATC	2	8	6875	6882	25 %	25 %	25 %	25 %	188584607
12	NC_010727	GGTC	2	8	7337	7344	0 %	25 %	50 %	25 %	188584607
13	NC_010727	GGCC	2	8	7661	7668	0 %	0 %	50 %	50 %	188584607
14	NC_010727	CTGG	2	8	7703	7710	0 %	25 %	50 %	25 %	188584607
15	NC_010727	CGCC	2	8	7721	7728	0 %	0 %	25 %	75 %	188584607
16	NC_010727	GACG	2	8	7766	7773	25 %	0 %	50 %	25 %	188584607
17	NC_010727	TCGA	2	8	7915	7922	25 %	25 %	25 %	25 %	188584607
18	NC_010727	GCGA	2	8	8343	8350	25 %	0 %	50 %	25 %	188584607
19	NC_010727	ACCT	2	8	8943	8950	25 %	25 %	0 %	50 %	188584607
20	NC_010727	CGGC	2	8	8981	8988	0 %	0 %	50 %	50 %	188584607
21	NC_010727	CAAG	2	8	9758	9765	50 %	0 %	25 %	25 %	188584609
22	NC_010727	GGTT	2	8	9945	9952	0 %	50 %	50 %	0 %	188584609
23	NC_010727	CGGC	2	8	11462	11469	0 %	0 %	50 %	50 %	188584611
24	NC_010727	CACC	2	8	11883	11890	25 %	0 %	0 %	75 %	188584611
25	NC_010727	CCGG	2	8	12036	12043	0 %	0 %	50 %	50 %	188584611
26	NC_010727	CCGG	2	8	12067	12074	0 %	0 %	50 %	50 %	188584611
27	NC_010727	CCGC	2	8	12220	12227	0 %	0 %	25 %	75 %	188584612
28	NC_010727	TCGC	2	8	12259	12266	0 %	25 %	25 %	50 %	188584612
29	NC_010727	CCGT	2	8	13557	13564	0 %	25 %	25 %	50 %	188584613
30	NC_010727	GCTG	2	8	14387	14394	0 %	25 %	50 %	25 %	188584615
31	NC_010727	GCTG	2	8	14876	14883	0 %	25 %	50 %	25 %	188584615
32	NC_010727	AGGC	2	8	14985	14992	25 %	0 %	50 %	25 %	188584615
33	NC_010727	GCGG	2	8	15079	15086	0 %	0 %	75 %	25 %	188584616
34	NC_010727	GCGG	2	8	16215	16222	0 %	0 %	75 %	25 %	188584617
35	NC_010727	CGAC	2	8	16359	16366	25 %	0 %	25 %	50 %	188584618
36	NC_010727	GGCC	2	8	16395	16402	0 %	0 %	50 %	50 %	188584618
37	NC_010727	GTCG	2	8	16646	16653	0 %	25 %	50 %	25 %	188584618
38	NC_010727	CCCG	2	8	16740	16747	0 %	0 %	25 %	75 %	188584618
39	NC_010727	GCCC	2	8	18765	18772	0 %	0 %	25 %	75 %	188584620
40	NC_010727	GCCG	2	8	19688	19695	0 %	0 %	50 %	50 %	188584621
41	NC_010727	GCTC	2	8	19954	19961	0 %	25 %	25 %	50 %	188584621
42	NC_010727	GAAA	2	8	21039	21046	75 %	0 %	25 %	0 %	188584622
43	NC_010727	GGAT	2	8	21216	21223	25 %	25 %	50 %	0 %	188584622
44	NC_010727	GCCG	2	8	21531	21538	0 %	0 %	50 %	50 %	188584622
45	NC_010727	CGGC	2	8	22172	22179	0 %	0 %	50 %	50 %	188584622
46	NC_010727	CGTT	2	8	22346	22353	0 %	50 %	25 %	25 %	188584622
47	NC_010727	GCCG	2	8	22832	22839	0 %	0 %	50 %	50 %	188584623
48	NC_010727	GTGC	2	8	23161	23168	0 %	25 %	50 %	25 %	188584624
49	NC_010727	GTCG	2	8	23477	23484	0 %	25 %	50 %	25 %	188584625
50	NC_010727	AGCC	2	8	23914	23921	25 %	0 %	25 %	50 %	188584626
51	NC_010727	TTCG	2	8	24093	24100	0 %	50 %	25 %	25 %	188584626
52	NC_010727	CTCG	2	8	24137	24144	0 %	25 %	25 %	50 %	188584626
53	NC_010727	AGCG	2	8	24296	24303	25 %	0 %	50 %	25 %	188584626
54	NC_010727	GCCC	2	8	24553	24560	0 %	0 %	25 %	75 %	188584626
55	NC_010727	AGGT	2	8	24573	24580	25 %	25 %	50 %	0 %	188584626
56	NC_010727	GAGC	2	8	24854	24861	25 %	0 %	50 %	25 %	188584626

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.