MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylobacterium populi BJ001 plasmid pMPOP01

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010727	GGA	2	6	90	95	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010727	TCG	2	6	110	115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010727	GCC	2	6	174	179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_010727	GAG	2	6	247	252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010727	CAC	2	6	256	261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010727	CTC	3	9	319	327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010727	CGA	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010727	GGC	2	6	432	437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010727	GTC	2	6	523	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010727	CCG	2	6	597	602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010727	CGC	2	6	700	705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_010727	GGC	2	6	717	722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010727	GCC	2	6	724	729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010727	CGA	2	6	750	755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010727	AGT	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010727	GAA	2	6	856	861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010727	GGC	2	6	895	900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010727	GGC	2	6	988	993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010727	TCC	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010727	CCG	2	6	1282	1287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010727	GCC	3	9	1347	1355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
22	NC_010727	GCC	2	6	1368	1373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
23	NC_010727	GCC	2	6	1442	1447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
24	NC_010727	TAG	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584602
25	NC_010727	TTC	2	6	1494	1499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584602
26	NC_010727	GGC	2	6	1530	1535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584602
27	NC_010727	CGA	2	6	1558	1563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584602
28	NC_010727	AGT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584602
29	NC_010727	CGC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
30	NC_010727	CCG	2	6	1753	1758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
31	NC_010727	GCA	2	6	1831	1836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584602
32	NC_010727	TGA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584602
33	NC_010727	CGT	2	6	1940	1945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
34	NC_010727	GAC	2	6	2008	2013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584602
35	NC_010727	GCC	2	6	2018	2023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
36	NC_010727	GCG	2	6	2028	2033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584602
37	NC_010727	GTC	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
38	NC_010727	CGC	2	6	2130	2135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
39	NC_010727	TCG	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
40	NC_010727	TCG	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
41	NC_010727	GTC	2	6	2270	2275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
42	NC_010727	CGA	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584602
43	NC_010727	TCA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584602
44	NC_010727	CCG	2	6	2507	2512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
45	NC_010727	GGC	2	6	2517	2522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584602
46	NC_010727	CTC	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584602
47	NC_010727	GAC	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584602
48	NC_010727	GTC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
49	NC_010727	GCC	2	6	2707	2712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
50	NC_010727	CGC	2	6	2743	2748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
51	NC_010727	CGG	2	6	2808	2813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
52	NC_010727	GCG	2	6	2827	2832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
53	NC_010727	CGG	2	6	2879	2884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
54	NC_010727	GAC	2	6	2946	2951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
55	NC_010727	CGA	2	6	2981	2986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
56	NC_010727	GGC	2	6	3072	3077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
57	NC_010727	GCC	2	6	3240	3245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
58	NC_010727	CGC	2	6	3264	3269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
59	NC_010727	GCC	2	6	3336	3341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
60	NC_010727	GCG	2	6	3354	3359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
61	NC_010727	CGA	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
62	NC_010727	GCA	2	6	3528	3533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
63	NC_010727	GCC	2	6	3538	3543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
64	NC_010727	CGA	3	9	3566	3574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
65	NC_010727	TCC	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584603
66	NC_010727	CAG	2	6	3705	3710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
67	NC_010727	ACC	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584603
68	NC_010727	GCC	2	6	3791	3796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
69	NC_010727	GGC	2	6	3877	3882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
70	NC_010727	TCG	2	6	3904	3909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584603
71	NC_010727	CGA	2	6	3911	3916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
72	NC_010727	GCA	2	6	3946	3951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
73	NC_010727	GCC	2	6	4129	4134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584604
74	NC_010727	TTC	2	6	4148	4153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584604
75	NC_010727	CTG	2	6	4183	4188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584604
76	NC_010727	GCG	2	6	4212	4217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584604
77	NC_010727	CGT	2	6	4233	4238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584604
78	NC_010727	GCA	2	6	4320	4325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584604
79	NC_010727	GAA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584604
80	NC_010727	GGC	2	6	4345	4350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584604
81	NC_010727	TCG	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584604
82	NC_010727	GCG	2	6	4515	4520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584604
83	NC_010727	CTC	2	6	4585	4590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584604
84	NC_010727	GCT	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584604
85	NC_010727	ATG	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010727	GAC	2	6	4995	5000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584605
87	NC_010727	TGC	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584605
88	NC_010727	TGG	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584605
89	NC_010727	TGA	2	6	5108	5113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584605
90	NC_010727	CAA	2	6	5226	5231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584605
91	NC_010727	CTT	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584605
92	NC_010727	CAG	2	6	5429	5434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584605
93	NC_010727	TCG	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584606
94	NC_010727	ATC	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584606
95	NC_010727	GAC	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584606
96	NC_010727	CTG	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584606
97	NC_010727	CGC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584606
98	NC_010727	GCT	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584606
99	NC_010727	GCC	2	6	6000	6005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584606
100	NC_010727	GAT	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584606
101	NC_010727	CCG	2	6	6042	6047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584606
102	NC_010727	CGA	3	9	6221	6229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
103	NC_010727	GAC	2	6	6264	6269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
104	NC_010727	CAT	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584607
105	NC_010727	CCG	2	6	6284	6289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
106	NC_010727	CGC	2	6	6385	6390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
107	NC_010727	TCG	2	6	6397	6402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
108	NC_010727	ACG	2	6	6528	6533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
109	NC_010727	GAC	3	9	6563	6571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
110	NC_010727	CAT	2	6	6623	6628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584607
111	NC_010727	GCT	2	6	6737	6742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
112	NC_010727	CGC	2	6	6833	6838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
113	NC_010727	CAT	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584607
114	NC_010727	TGG	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584607
115	NC_010727	CGA	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
116	NC_010727	GCT	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
117	NC_010727	CGC	2	6	7178	7183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
118	NC_010727	CGC	2	6	7307	7312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
119	NC_010727	TCC	2	6	7327	7332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584607
120	NC_010727	AGC	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
121	NC_010727	ACG	2	6	7715	7720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
122	NC_010727	CTT	2	6	7902	7907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584607
123	NC_010727	CGG	2	6	7996	8001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584607
124	NC_010727	CCA	2	6	8014	8019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584607
125	NC_010727	CGC	2	6	8155	8160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
126	NC_010727	CCG	2	6	8222	8227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
127	NC_010727	GGC	2	6	8351	8356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584607
128	NC_010727	GCT	2	6	8372	8377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
129	NC_010727	CCA	2	6	8378	8383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584607
130	NC_010727	CGC	2	6	8479	8484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
131	NC_010727	CGC	2	6	8498	8503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
132	NC_010727	CGA	2	6	8573	8578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
133	NC_010727	GAC	2	6	8601	8606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
134	NC_010727	TGC	2	6	8608	8613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
135	NC_010727	CGT	2	6	8639	8644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
136	NC_010727	AGC	2	6	8761	8766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
137	NC_010727	CGC	2	6	8778	8783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
138	NC_010727	CAA	2	6	8798	8803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584607
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140	NC_010727	TCG	2	6	8911	8916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
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154	NC_010727	CTG	2	6	9432	9437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584608
155	NC_010727	ACG	2	6	9475	9480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584608
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162	NC_010727	CGG	2	6	10068	10073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_010727	CTT	2	6	16712	16717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584618
257	NC_010727	AGA	2	6	16723	16728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584618
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259	NC_010727	TCA	2	6	17034	17039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_010727	GCT	2	6	17057	17062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_010727	CGG	2	6	17143	17148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_010727	AGC	2	6	17156	17161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_010727	GCC	2	6	17168	17173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_010727	AAC	2	6	17358	17363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_010727	GCA	2	6	17392	17397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_010727	GAC	2	6	17426	17431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_010727	GCA	2	6	17620	17625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_010727	GCC	2	6	17803	17808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584619
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.