MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium populi BJ001 plasmid pMPOP01

Total Repeats: 313

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010727	GCC	3	9	1347	1355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
2	NC_010727	GCC	2	6	1368	1373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
3	NC_010727	GCC	2	6	1442	1447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
4	NC_010727	TAG	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584602
5	NC_010727	TTC	2	6	1494	1499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584602
6	NC_010727	GGC	2	6	1530	1535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584602
7	NC_010727	CGA	2	6	1558	1563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584602
8	NC_010727	AGT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584602
9	NC_010727	CGC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
10	NC_010727	CCG	2	6	1753	1758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
11	NC_010727	GCA	2	6	1831	1836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584602
12	NC_010727	TGA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584602
13	NC_010727	CGT	2	6	1940	1945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
14	NC_010727	GAC	2	6	2008	2013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584602
15	NC_010727	GCC	2	6	2018	2023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
16	NC_010727	GCG	2	6	2028	2033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584602
17	NC_010727	GTC	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
18	NC_010727	CGC	2	6	2130	2135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
19	NC_010727	TCG	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
20	NC_010727	TCG	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
21	NC_010727	GTC	2	6	2270	2275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
22	NC_010727	CGA	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584602
23	NC_010727	TCA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584602
24	NC_010727	CCG	2	6	2507	2512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584602
25	NC_010727	GGC	2	6	2517	2522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584602
26	NC_010727	CTC	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584602
27	NC_010727	GAC	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584602
28	NC_010727	GTC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584602
29	NC_010727	GCC	2	6	2707	2712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
30	NC_010727	CGC	2	6	2743	2748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
31	NC_010727	CGG	2	6	2808	2813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
32	NC_010727	GCG	2	6	2827	2832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
33	NC_010727	CGG	2	6	2879	2884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
34	NC_010727	GAC	2	6	2946	2951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
35	NC_010727	CGA	2	6	2981	2986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
36	NC_010727	GGC	2	6	3072	3077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
37	NC_010727	GCC	2	6	3240	3245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
38	NC_010727	CGC	2	6	3264	3269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
39	NC_010727	GCC	2	6	3336	3341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
40	NC_010727	GCG	2	6	3354	3359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
41	NC_010727	CGA	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
42	NC_010727	GCA	2	6	3528	3533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
43	NC_010727	GCC	2	6	3538	3543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
44	NC_010727	CGA	3	9	3566	3574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
45	NC_010727	TCC	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584603
46	NC_010727	CAG	2	6	3705	3710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
47	NC_010727	ACC	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584603
48	NC_010727	GCC	2	6	3791	3796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584603
49	NC_010727	GGC	2	6	3877	3882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584603
50	NC_010727	TCG	2	6	3904	3909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584603
51	NC_010727	CGA	2	6	3911	3916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
52	NC_010727	GCA	2	6	3946	3951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584603
53	NC_010727	GCC	2	6	4129	4134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584604
54	NC_010727	TTC	2	6	4148	4153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584604
55	NC_010727	CTG	2	6	4183	4188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584604
56	NC_010727	GCG	2	6	4212	4217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584604
57	NC_010727	CGT	2	6	4233	4238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584604
58	NC_010727	GCA	2	6	4320	4325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584604
59	NC_010727	GAA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584604
60	NC_010727	GGC	2	6	4345	4350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584604
61	NC_010727	TCG	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584604
62	NC_010727	GCG	2	6	4515	4520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584604
63	NC_010727	CTC	2	6	4585	4590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584604
64	NC_010727	GCT	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584604
65	NC_010727	GAC	2	6	4995	5000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584605
66	NC_010727	TGC	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584605
67	NC_010727	TGG	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584605
68	NC_010727	TGA	2	6	5108	5113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584605
69	NC_010727	CAA	2	6	5226	5231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584605
70	NC_010727	CTT	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584605
71	NC_010727	CAG	2	6	5429	5434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584605
72	NC_010727	TCG	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584606
73	NC_010727	ATC	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584606
74	NC_010727	GAC	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584606
75	NC_010727	CTG	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584606
76	NC_010727	CGC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584606
77	NC_010727	GCT	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584606
78	NC_010727	GCC	2	6	6000	6005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584606
79	NC_010727	GAT	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584606
80	NC_010727	CCG	2	6	6042	6047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584606
81	NC_010727	CGA	3	9	6221	6229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
82	NC_010727	GAC	2	6	6264	6269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
83	NC_010727	CAT	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584607
84	NC_010727	CCG	2	6	6284	6289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
85	NC_010727	CGC	2	6	6385	6390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
86	NC_010727	TCG	2	6	6397	6402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
87	NC_010727	ACG	2	6	6528	6533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
88	NC_010727	GAC	3	9	6563	6571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
89	NC_010727	CAT	2	6	6623	6628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584607
90	NC_010727	GCT	2	6	6737	6742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
91	NC_010727	CGC	2	6	6833	6838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
92	NC_010727	CAT	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584607
93	NC_010727	TGG	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584607
94	NC_010727	CGA	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
95	NC_010727	GCT	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
96	NC_010727	CGC	2	6	7178	7183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
97	NC_010727	CGC	2	6	7307	7312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
98	NC_010727	TCC	2	6	7327	7332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584607
99	NC_010727	AGC	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
100	NC_010727	ACG	2	6	7715	7720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
101	NC_010727	CTT	2	6	7902	7907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584607
102	NC_010727	CGG	2	6	7996	8001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584607
103	NC_010727	CCA	2	6	8014	8019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584607
104	NC_010727	CGC	2	6	8155	8160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
105	NC_010727	CCG	2	6	8222	8227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
106	NC_010727	GGC	2	6	8351	8356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584607
107	NC_010727	GCT	2	6	8372	8377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
108	NC_010727	CCA	2	6	8378	8383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584607
109	NC_010727	CGC	2	6	8479	8484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
110	NC_010727	CGC	2	6	8498	8503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
111	NC_010727	CGA	2	6	8573	8578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
112	NC_010727	GAC	2	6	8601	8606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
113	NC_010727	TGC	2	6	8608	8613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
114	NC_010727	CGT	2	6	8639	8644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
115	NC_010727	AGC	2	6	8761	8766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
116	NC_010727	CGC	2	6	8778	8783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
117	NC_010727	CAA	2	6	8798	8803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584607
118	NC_010727	TCT	2	6	8836	8841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584607
119	NC_010727	TCG	2	6	8911	8916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
120	NC_010727	GCC	2	6	8955	8960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
121	NC_010727	CCG	2	6	8994	8999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584607
122	NC_010727	CTG	2	6	9003	9008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584607
123	NC_010727	GCA	2	6	9032	9037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584607
124	NC_010727	CCT	2	6	9221	9226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584608
125	NC_010727	CGC	2	6	9260	9265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584608
126	NC_010727	CGA	2	6	9280	9285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584608
127	NC_010727	CGG	2	6	9306	9311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188584608
128	NC_010727	ACG	2	6	9313	9318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584608
129	NC_010727	CGC	2	6	9335	9340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584608
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253	NC_010727	GAC	2	6	20472	20477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584621
254	NC_010727	GCC	2	6	20478	20483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188584621
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.