MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF plasmid pNTHE02

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010724	TCC	2	6	303	308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188587526
2	NC_010724	AGC	2	6	320	325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188587526
3	NC_010724	AGA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587526
4	NC_010724	AAG	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587526
5	NC_010724	ACC	2	6	450	455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188587526
6	NC_010724	ATT	2	6	485	490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587526
7	NC_010724	AGT	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587526
8	NC_010724	ATA	2	6	840	845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587526
9	NC_010724	GAG	2	6	902	907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587526
10	NC_010724	AGA	2	6	965	970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587526
11	NC_010724	AAT	2	6	993	998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587526
12	NC_010724	AGT	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587526
13	NC_010724	AGA	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587527
14	NC_010724	CAA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587527
15	NC_010724	AAT	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587527
16	NC_010724	GAT	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587527
17	NC_010724	TCA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587527
18	NC_010724	CAG	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188587527
19	NC_010724	TCA	2	6	1755	1760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587528
20	NC_010724	ATT	2	6	1856	1861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587528
21	NC_010724	AAC	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587528
22	NC_010724	GGT	2	6	2137	2142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587528
23	NC_010724	TAA	2	6	2154	2159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587528
24	NC_010724	TAT	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587528
25	NC_010724	AAC	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587528
26	NC_010724	AGG	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587528
27	NC_010724	AGA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
28	NC_010724	GGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587529
29	NC_010724	GTG	2	6	2691	2696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587529
30	NC_010724	AAG	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
31	NC_010724	AGA	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
32	NC_010724	GAA	2	6	2882	2887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
33	NC_010724	AGA	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
34	NC_010724	AGA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
35	NC_010724	ATA	2	6	2991	2996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587529
36	NC_010724	ACT	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587530
37	NC_010724	AGA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587530
38	NC_010724	GCT	2	6	3562	3567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188587530
39	NC_010724	AAG	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587530
40	NC_010724	ATA	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587531
41	NC_010724	GAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587531
42	NC_010724	GGA	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587531
43	NC_010724	GGA	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587531
44	NC_010724	TTA	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587532
45	NC_010724	CAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
46	NC_010724	AGA	2	6	4548	4553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587532
47	NC_010724	TAA	2	6	4607	4612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587532
48	NC_010724	CAA	2	6	4785	4790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
49	NC_010724	TCA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587532
50	NC_010724	ATT	2	6	4996	5001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587532
51	NC_010724	AAC	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
52	NC_010724	GGT	2	6	5277	5282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587532
53	NC_010724	TAA	2	6	5294	5299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587532
54	NC_010724	TAT	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587532
55	NC_010724	AAC	2	6	5349	5354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
56	NC_010724	AGG	2	6	5485	5490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587532
57	NC_010724	TCA	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587533
58	NC_010724	ATT	2	6	5933	5938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587533
59	NC_010724	AAC	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587533
60	NC_010724	TAT	2	6	6028	6033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587533
61	NC_010724	TCA	2	6	6066	6071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587533
62	NC_010724	GAA	2	6	6142	6147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
63	NC_010724	TTC	2	6	6359	6364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188587533
64	NC_010724	AGA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
65	NC_010724	TAA	2	6	6519	6524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587533
66	NC_010724	ATT	2	6	6654	6659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587533
67	NC_010724	GAA	2	6	6700	6705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
68	NC_010724	CTG	2	6	6818	6823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188587533
69	NC_010724	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587533
70	NC_010724	AAC	2	6	6836	6841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587533
71	NC_010724	GAA	2	6	6856	6861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
72	NC_010724	GAA	2	6	6892	6897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
73	NC_010724	CGG	2	6	6904	6909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188587533
74	NC_010724	AAG	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
75	NC_010724	GGA	2	6	7095	7100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587533
76	NC_010724	ATT	2	6	7164	7169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587534
77	NC_010724	CTA	2	6	7248	7253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587534
78	NC_010724	CAT	2	6	7276	7281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587534
79	NC_010724	TGT	2	6	7336	7341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188587534
80	NC_010724	ATC	2	6	7360	7365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587534
81	NC_010724	TGG	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587534
82	NC_010724	GAA	2	6	7408	7413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587534
83	NC_010724	ATA	2	6	7434	7439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587534
84	NC_010724	TAA	2	6	7509	7514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587534
85	NC_010724	AAT	2	6	7543	7548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587534
86	NC_010724	TAC	2	6	7578	7583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587534
87	NC_010724	GAA	2	6	7592	7597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.