MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 chromosome

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010723	TATAGA	2	12	9168	9179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010723	ATAAGT	2	12	28113	28124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010723	TAATTT	2	12	43353	43364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010723	TATTAA	2	12	44376	44387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010723	AATATT	2	12	46997	47008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010723	TATATT	2	12	69637	69648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010723	ATATAA	2	12	75216	75227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010723	AAAATT	2	12	83957	83968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010723	TATTTT	2	12	108387	108398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010723	TAAAAT	2	12	112094	112105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010723	TATATT	2	12	120761	120772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010723	TATTTA	2	12	125817	125828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010723	TAAAAA	2	12	138619	138630	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010723	AAATAA	2	12	150522	150533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010723	AAGTAT	2	12	161867	161878	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010723	TAAAAT	2	12	183188	183199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010723	TTTAAA	2	12	192330	192341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010723	TTTAAA	2	12	192742	192753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010723	ATTTTA	2	12	193145	193156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010723	AACTGA	2	12	202273	202284	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010723	TAAAAA	2	12	214589	214600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010723	AATATA	2	12	215387	215398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010723	CAAAGT	2	12	215411	215422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010723	CAAAAA	2	12	215427	215438	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010723	AAAATT	2	12	220126	220137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010723	TTAAAT	2	12	246925	246936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010723	ATTTAT	2	12	263917	263928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010723	TTAGTT	2	12	276830	276841	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010723	GAAAAA	2	12	318861	318872	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010723	TTAAAT	2	12	330029	330040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010723	ATAAAA	2	12	334948	334959	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010723	TTTAAA	2	12	340197	340208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010723	ATTAAG	2	12	348233	348244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010723	ATTTTA	2	12	351926	351937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010723	TAAATT	2	12	354630	354641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010723	TAAAAA	2	12	361556	361567	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010723	GAAAGG	2	12	365986	365997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010723	ATTTTA	2	12	366061	366072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010723	TTTAAA	2	12	367793	367804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010723	TAAATA	2	12	375494	375505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010723	TTAAAA	2	12	388977	388988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010723	AATAAA	2	12	398296	398307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010723	CATTAA	2	12	425617	425628	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010723	GCTAAT	2	12	473672	473683	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010723	ACAAAA	2	12	487582	487593	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010723	AATTAT	2	12	515563	515574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010723	AGTGAA	2	12	520102	520113	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010723	TTAAAA	2	12	525873	525884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010723	TGAAAA	2	12	529344	529355	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010723	TGCAAA	2	12	532044	532055	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010723	TTTAAG	2	12	552449	552460	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010723	TAATAT	2	12	563957	563968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010723	TAAAAA	2	12	572105	572116	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010723	TAAGTA	2	12	574954	574965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010723	TTTAAA	2	12	575226	575237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010723	ATAGGT	2	12	582592	582603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010723	TAAAAA	2	12	596517	596528	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010723	TTATAT	2	12	597144	597155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010723	TAAAAC	3	18	602154	602171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010723	ATTTAT	2	12	607953	607964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010723	GGTAGA	2	12	636673	636684	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010723	TAAAAC	2	12	638321	638332	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010723	TAAAAT	2	12	646167	646178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010723	ATAATT	2	12	681791	681802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010723	TTTTTA	2	12	684461	684472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010723	GTTATT	2	12	685952	685963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010723	ATTAAT	2	12	696552	696563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010723	GATAAA	2	12	704168	704179	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010723	AAAAAG	2	12	711717	711728	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010723	TAATTA	2	12	717431	717442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010723	TTATAA	2	12	718284	718295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010723	TTGTCT	2	12	720251	720262	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010723	ATTAAA	2	12	722166	722177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010723	ATAGAT	2	12	734742	734753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010723	CTAATG	2	12	744228	744239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010723	CATATA	2	12	757162	757173	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010723	AGTATA	2	12	761379	761390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010723	ATTTTT	2	12	761438	761449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010723	AAATTA	2	12	766382	766393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010723	TTAAAT	2	12	771715	771726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010723	ATTTAA	2	12	771800	771811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010723	TAAAAA	2	12	811471	811482	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010723	CAAAAT	2	12	825223	825234	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010723	TTTAAT	2	12	825256	825267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010723	TAAAAA	2	12	833638	833649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010723	TGGTAT	2	12	859039	859050	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010723	TATTAA	2	12	868460	868471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010723	ATTTAT	2	12	873328	873339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010723	AGAAAA	2	12	882638	882649	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010723	AATATA	2	12	882742	882753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010723	TAAATA	2	12	917610	917621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010723	GAAAAG	2	12	924860	924871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010723	AATATA	2	12	959853	959864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010723	GATTAA	2	12	995180	995191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010723	TATTTT	2	12	997289	997300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010723	ACAATA	2	12	1017531	1017542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010723	TTTGTG	2	12	1021758	1021769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010723	ATAAAT	2	12	1026866	1026877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010723	TATATT	2	12	1039947	1039958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010723	TTTACA	2	12	1046217	1046228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010723	TTAATA	2	12	1055978	1055989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010723	TATAAA	2	12	1056524	1056535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010723	TTTAAA	2	12	1058410	1058421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010723	TTTTTA	2	12	1073613	1073624	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010723	TAAAAT	2	12	1086602	1086613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010723	TAAAAA	2	12	1088962	1088973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010723	AAAGTT	2	12	1089045	1089056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010723	AAGTAA	2	12	1097671	1097682	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010723	AAAATT	2	12	1110990	1111001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010723	AAAATT	2	12	1126499	1126510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010723	AATTAA	2	12	1130042	1130053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010723	TAAAAA	2	12	1133129	1133140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010723	TTTAAT	2	12	1134945	1134956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010723	ATTTAA	2	12	1151216	1151227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010723	TTTAAA	2	12	1151250	1151261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010723	AATGTA	2	12	1226888	1226899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010723	ATAAAA	2	12	1226961	1226972	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010723	AATAAA	2	12	1228019	1228030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010723	AAGCTT	2	12	1269760	1269771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010723	ATTTAA	2	12	1282884	1282895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010723	AATTGT	2	12	1302226	1302237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010723	ATTATA	2	12	1310704	1310715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010723	TTAAAA	2	12	1324480	1324491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010723	TTTAAG	2	12	1339694	1339705	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010723	TATAAT	2	12	1349306	1349317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010723	ATATTT	2	12	1352067	1352078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010723	AAAACA	2	12	1367222	1367233	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_010723	AATTTG	2	12	1389899	1389910	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010723	AATATA	2	12	1392907	1392918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010723	TTGACA	2	12	1394788	1394799	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_010723	AATAAA	2	12	1400788	1400799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010723	TAAATT	2	12	1410309	1410320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010723	TAAATA	2	12	1419316	1419327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010723	TGCAGA	2	12	1431608	1431619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_010723	GAAGCT	2	12	1435766	1435777	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_010723	TCGGTT	2	12	1436007	1436018	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_010723	ATATCT	2	12	1458878	1458889	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_010723	ATTTAA	2	12	1464808	1464819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010723	TAAATT	2	12	1468260	1468271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010723	TATAAA	2	12	1492344	1492355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010723	TATAAA	2	12	1498557	1498568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010723	CATATT	2	12	1511991	1512002	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_010723	TTAATA	2	12	1521124	1521135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010723	AAAATA	2	12	1542432	1542443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010723	TTTAAA	2	12	1548428	1548439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010723	ATTAAA	2	12	1557882	1557893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_010723	AAAATT	2	12	1580418	1580429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010723	TAATAT	2	12	1604632	1604643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010723	TAGATT	2	12	1642681	1642692	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_010723	TTTTCT	2	12	2581317	2581328	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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260	NC_010723	AAATTC	2	12	2592138	2592149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
261	NC_010723	ATAGTT	2	12	2594402	2594413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010723	TTGTAT	2	12	2595939	2595950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010723	AACTCT	2	12	2597940	2597951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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265	NC_010723	TAGACA	2	12	2614496	2614507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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387	NC_010723	ATATTA	2	12	3651517	3651528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.