MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 chromosome

Total Repeats: 1978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010723	CTAAAG	2	12	668	679	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188589439
2	NC_010723	AAAAGA	2	12	2798	2809	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188587627
3	NC_010723	GTAAAG	2	12	5013	5024	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188588443
4	NC_010723	GGTAAA	2	12	6179	6190	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188588443
5	NC_010723	TAACAG	2	12	8296	8307	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188587904
6	NC_010723	AGTTGA	2	12	17793	17804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588464
7	NC_010723	AGATAG	2	12	22618	22629	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188588814
8	NC_010723	TGAAGA	2	12	22939	22950	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188588814
9	NC_010723	ATCTGT	2	12	23437	23448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188588814
10	NC_010723	TTTAGA	2	12	23596	23607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188588814
11	NC_010723	GAAAAA	2	12	25826	25837	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188589987
12	NC_010723	CAGGAT	2	12	26161	26172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188589987
13	NC_010723	TTAGAT	2	12	28929	28940	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188590689
14	NC_010723	ATAAAT	2	12	29813	29824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588427
15	NC_010723	GTATAA	2	12	33848	33859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188587836
16	NC_010723	AAATAA	2	12	34016	34027	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188587836
17	NC_010723	TAGTTA	2	12	39941	39952	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188588712
18	NC_010723	AATCTT	2	12	40392	40403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188588712
19	NC_010723	TAGTAT	2	12	40551	40562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188588712
20	NC_010723	TATAGC	2	12	42021	42032	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188589253
21	NC_010723	TAAAGA	2	12	46130	46141	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188587858
22	NC_010723	AATGAG	2	12	47889	47900	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188589120
23	NC_010723	ATTTGG	2	12	53802	53813	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	188590471
24	NC_010723	AGTTTT	2	12	54282	54293	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188590642
25	NC_010723	GTATTT	2	12	55988	55999	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188588362
26	NC_010723	ATTAAA	2	12	56155	56166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588362
27	NC_010723	AGATAA	2	12	56269	56280	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188588362
28	NC_010723	GAATTA	2	12	61144	61155	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188587992
29	NC_010723	TAAAGG	2	12	63986	63997	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188588895
30	NC_010723	TCTATT	2	12	67694	67705	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188590299
31	NC_010723	TCAAAC	2	12	72478	72489	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	188588216
32	NC_010723	AGCTAT	2	12	73486	73497	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188588216
33	NC_010723	AGGAAA	2	12	75960	75971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588622
34	NC_010723	TCAGGA	2	12	79367	79378	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188589590
35	NC_010723	GAACAA	2	12	81944	81955	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188589114
36	NC_010723	TCTTTA	2	12	82295	82306	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188589114
37	NC_010723	GTATAG	2	12	84952	84963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590055
38	NC_010723	TATGAT	2	12	85107	85118	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188590055
39	NC_010723	TAGCAT	2	12	87293	87304	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188589557
40	NC_010723	AACAAA	2	12	89924	89935	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	188589185
41	NC_010723	TAAAAA	2	12	90415	90426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188588720
42	NC_010723	GGTGAA	2	12	95988	95999	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	188589689
43	NC_010723	AGAAAA	2	12	96705	96716	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188588416
44	NC_010723	GTAAAA	2	12	97060	97071	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188588416
45	NC_010723	TATATT	2	12	98795	98806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188589856
46	NC_010723	AAATAA	2	12	102218	102229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188589718
47	NC_010723	TAGCAA	2	12	102608	102619	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188589718
48	NC_010723	GAGCAA	2	12	104254	104265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	188589417
49	NC_010723	TATATT	2	12	110301	110312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188589558
50	NC_010723	ATTAGG	2	12	111801	111812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590525
51	NC_010723	ATTAAA	2	12	116512	116523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588457
52	NC_010723	GAAAAA	2	12	121711	121722	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188590309
53	NC_010723	AATATT	2	12	122410	122421	50 %	50 %	0 %	0 %	188589845
54	NC_010723	TAAAGA	2	12	122632	122643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188589845
55	NC_010723	AGGAAA	2	12	124169	124180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588373
56	NC_010723	TTATCT	2	12	130134	130145	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188589097
57	NC_010723	TGTTAT	2	12	134898	134909	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188588270
58	NC_010723	ATAGAA	2	12	135761	135772	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188588270
59	NC_010723	AGCAAA	2	12	136301	136312	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188588270
60	NC_010723	AAAATG	2	12	142861	142872	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188588409
61	NC_010723	TTTTAA	2	12	145769	145780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188588914
62	NC_010723	AGAAAT	2	12	149292	149303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188587730
63	NC_010723	TTGATA	2	12	149510	149521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188587730
64	NC_010723	TATTGA	2	12	150964	150975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188588977
65	NC_010723	TATTGA	2	12	151843	151854	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188588977
66	NC_010723	CAGTAA	2	12	152292	152303	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188588977
67	NC_010723	GAGTAT	2	12	156271	156282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588043
68	NC_010723	ATATCT	2	12	165254	165265	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188588874
69	NC_010723	AAAAAG	2	12	167679	167690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188589474
70	NC_010723	TGCATA	2	12	169019	169030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188589474
71	NC_010723	CAACTT	2	12	176570	176581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590184
72	NC_010723	TAAAGT	3	18	176960	176977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188588644
73	NC_010723	CAAAGG	2	12	177182	177193	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	188588644
74	NC_010723	ATAAAA	2	12	178708	178719	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188587923
75	NC_010723	TAGATA	2	12	180886	180897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188587923
76	NC_010723	GGCGGT	2	12	183615	183626	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	188589992
77	NC_010723	CAGGAA	2	12	183826	183837	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	188589992
78	NC_010723	TTAGTA	2	12	185417	185428	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188588461
79	NC_010723	TAGTGA	2	12	186397	186408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588461
80	NC_010723	AGTTAA	2	12	190073	190084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188590469
81	NC_010723	GATATG	2	12	190994	191005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587577
82	NC_010723	CAAAGA	2	12	191615	191626	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188587577
83	NC_010723	ATTATA	2	12	194968	194979	50 %	50 %	0 %	0 %	188590169
84	NC_010723	TTTACC	2	12	196735	196746	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188588761
85	NC_010723	TTACAT	2	12	198885	198896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188588755
86	NC_010723	TGAAGC	2	12	200088	200099	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188587819
87	NC_010723	AATAAA	2	12	200583	200594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188587819
88	NC_010723	TTTTTA	2	12	209574	209585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	188588039
89	NC_010723	ATGCTA	2	12	209647	209658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188588039
90	NC_010723	GCTTCT	2	12	210039	210050	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	188588039
91	NC_010723	TTCCAG	2	12	211620	211631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	188587973
92	NC_010723	GAAAAA	2	12	211709	211720	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188587973
93	NC_010723	AAGATG	2	12	212028	212039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188589063
94	NC_010723	GTTAAA	2	12	214015	214026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188590028
95	NC_010723	AAAATC	2	12	215055	215066	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188590751
96	NC_010723	ATTTAT	2	12	216438	216449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188588966
97	NC_010723	CTTAAA	2	12	217506	217517	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188587808
98	NC_010723	AGGTGC	2	12	218413	218424	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188590460
99	NC_010723	AAAATA	2	12	219765	219776	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188590460
100	NC_010723	AAGAAA	2	12	220424	220435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188589270
101	NC_010723	TAAAAA	2	12	221073	221084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188589270
102	NC_010723	TTTAAC	2	12	221998	222009	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188589032
103	NC_010723	AATTTA	2	12	224445	224456	50 %	50 %	0 %	0 %	188589352
104	NC_010723	TATCTA	2	12	231350	231361	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188589801
105	NC_010723	CAAAGG	2	12	231695	231706	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	188588931
106	NC_010723	AAGGAA	2	12	232169	232180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588931
107	NC_010723	AAGGAA	2	12	232741	232752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587970
108	NC_010723	GCAAAA	2	12	233050	233061	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188588004
109	NC_010723	TTTTAA	2	12	235535	235546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188588856
110	NC_010723	TTTAAT	2	12	236105	236116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188589977
111	NC_010723	ACTTCA	2	12	236216	236227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590698
112	NC_010723	AAAAGC	2	12	237626	237637	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188588432
113	NC_010723	GGATTA	2	12	238356	238367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589549
114	NC_010723	AGAAGT	2	12	238472	238483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188589549
115	NC_010723	GTTGAA	2	12	242459	242470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588112
116	NC_010723	AAAAGT	2	12	245758	245769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188590157
117	NC_010723	CAAGAA	2	12	247667	247678	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188588068
118	NC_010723	AAACTG	2	12	247848	247859	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188588068
119	NC_010723	CTTAAT	2	12	250853	250864	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188589870
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123	NC_010723	TAACTG	2	12	258549	258560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188588384
124	NC_010723	GTTGGT	2	12	258776	258787	0 %	50 %	50 %	0 %	188588384
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234	NC_010723	TTGATT	2	12	456042	456053	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188587640
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237	NC_010723	TTGATA	2	12	457991	458002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188590738
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