MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 chromosome

Total Repeats: 1238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010723	TCTAT	2	10	1706	1715	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010723	TTAAA	2	10	1716	1725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010723	TTTTA	2	10	9112	9121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010723	AAATT	2	10	9361	9370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010723	GGTAA	2	10	9813	9822	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010723	TCGTG	2	10	10604	10613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010723	TTTAA	2	10	11145	11154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010723	CCAAA	2	10	11571	11580	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010723	GGGAG	2	10	11827	11836	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010723	TAAGT	2	10	12356	12365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010723	AGGAT	2	10	12779	12788	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010723	CGGGA	2	10	14043	14052	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010723	TAATA	2	10	17382	17391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010723	TAAAA	2	10	19994	20003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010723	ATTTA	2	10	20024	20033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010723	TATAA	2	10	28162	28171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010723	TAAAA	2	10	31870	31879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010723	TTTAA	2	10	33201	33210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010723	TATAA	2	10	35619	35628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010723	TAATT	4	20	38334	38353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010723	TATAA	2	10	39367	39376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010723	TATAA	2	10	39430	39439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010723	TCATT	2	10	41098	41107	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010723	GTAAG	2	10	42898	42907	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010723	AATAA	2	10	43332	43341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010723	AGATA	2	10	44392	44401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010723	TATAG	2	10	48117	48126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010723	TAATA	2	10	48151	48160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010723	ATATT	2	10	49842	49851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010723	ATATA	2	10	49913	49922	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010723	GATAA	2	10	51787	51796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010723	TAAAA	2	10	56855	56864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010723	TTTTA	2	10	60815	60824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010723	TAAAT	2	10	66544	66553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010723	TATAC	2	10	68613	68622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010723	AATTG	2	10	83726	83735	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010723	ATTAA	2	10	83743	83752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010723	TAAAA	2	10	86249	86258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010723	TAATT	2	10	92441	92450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010723	AAAAG	2	10	92867	92876	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010723	ATTTT	2	10	99665	99674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010723	TTAAT	2	10	101147	101156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010723	GTTTT	2	10	101540	101549	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010723	TAAAA	3	15	116855	116869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010723	TTTTC	2	10	120830	120839	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010723	TAAAT	2	10	120844	120853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010723	AATTT	2	10	125786	125795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010723	AAATC	2	10	126798	126807	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010723	TAAAA	2	10	127184	127193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010723	TTGTG	2	10	128819	128828	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010723	AATTA	2	10	130960	130969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010723	TAATA	2	10	137123	137132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010723	ATTTT	2	10	137135	137144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010723	ATTTT	2	10	140002	140011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010723	ATATT	2	10	144973	144982	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010723	TAATT	2	10	156766	156775	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010723	TTAAA	2	10	159203	159212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010723	TAATT	2	10	170920	170929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010723	TAATA	2	10	177550	177559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010723	TTACA	2	10	178192	178201	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010723	AGTAA	2	10	185209	185218	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010723	TAATA	2	10	185223	185232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010723	AAATT	2	10	186961	186970	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010723	ATAGT	2	10	188815	188824	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010723	TATAA	2	10	192671	192680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010723	AAAGA	2	10	200861	200870	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010723	TAATT	2	10	202121	202130	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010723	GGTAA	2	10	202651	202660	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010723	TCGTG	2	10	203442	203451	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010723	TTTAA	2	10	203983	203992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010723	CCAAA	2	10	204568	204577	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_010723	GGGAG	2	10	204824	204833	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010723	TAAGT	2	10	205353	205362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010723	AGGAT	2	10	205776	205785	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010723	CGGGA	2	10	207040	207049	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010723	TTTAA	2	10	209000	209009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010723	AATTT	2	10	211152	211161	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010723	ATATA	2	10	211935	211944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010723	TAATT	2	10	225461	225470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010723	AGATA	2	10	227497	227506	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010723	TAAAA	2	10	233711	233720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010723	GAAGT	2	10	235309	235318	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010723	TTTTA	2	10	246244	246253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010723	TTAGT	2	10	246818	246827	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010723	GCATA	2	10	251148	251157	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010723	AAAGG	2	10	252355	252364	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010723	TATAA	2	10	265791	265800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010723	TAAAT	2	10	273862	273871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010723	TAATT	2	10	273874	273883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010723	TAAAA	2	10	274829	274838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010723	AGTAT	2	10	277015	277024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010723	TATAT	2	10	278045	278054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010723	TGTTA	2	10	289569	289578	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010723	AAAGA	2	10	301263	301272	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010723	TTTAA	2	10	301667	301676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010723	TTAAA	2	10	301800	301809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010723	ATAAA	2	10	304070	304079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010723	TATGC	2	10	329732	329741	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010723	ATAAA	2	10	331585	331594	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010723	ATTAT	2	10	334016	334025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010723	TAAAT	2	10	334836	334845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010723	TTTTA	2	10	336360	336369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010723	ATATA	2	10	338482	338491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010723	ATAAA	2	10	341553	341562	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010723	AATTA	2	10	341584	341593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010723	GTTAA	2	10	342768	342777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010723	TAATA	2	10	342878	342887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010723	ATAAA	2	10	347266	347275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010723	AATAA	2	10	347608	347617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010723	ATAAA	2	10	350614	350623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010723	TTTAG	2	10	353413	353422	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010723	TAATC	2	10	356427	356436	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010723	TTATA	2	10	360634	360643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010723	TATAA	2	10	360760	360769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010723	TTAAT	2	10	361702	361711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010723	CAATT	2	10	362208	362217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010723	TAAAA	2	10	366027	366036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010723	TTAAA	2	10	366087	366096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010723	ATTTA	2	10	368905	368914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010723	AATAT	2	10	372385	372394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010723	AGAGA	2	10	375483	375492	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010723	AAGAA	2	10	376240	376249	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010723	CATTA	2	10	383017	383026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010723	AAATA	2	10	388954	388963	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010723	ATTAA	2	10	391742	391751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010723	TGTAA	2	10	395355	395364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010723	ATTAA	2	10	397698	397707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010723	TATTT	2	10	403200	403209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010723	TTAAT	2	10	403244	403253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010723	TATAA	2	10	407026	407035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010723	AATAA	2	10	410969	410978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010723	ATAAA	2	10	413766	413775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010723	TAAAT	2	10	419963	419972	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010723	TAAAA	2	10	426111	426120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010723	ATAAA	2	10	427820	427829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010723	TGATA	2	10	429113	429122	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010723	GGTAA	2	10	429621	429630	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010723	TCGTG	2	10	430412	430421	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010723	TTTAA	2	10	430953	430962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010723	ATTAA	2	10	431250	431259	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010723	CCAAA	2	10	431529	431538	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_010723	GGGAG	2	10	431785	431794	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010723	TAAGT	2	10	432314	432323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010723	AGGAT	2	10	432737	432746	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010723	CGGGA	2	10	434001	434010	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_010723	TTATA	2	10	444383	444392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010723	TTATC	2	10	444441	444450	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010723	TATTT	2	10	451824	451833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010723	TTTTA	2	10	460953	460962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_010723	ATATA	2	10	462555	462564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_010723	GTTAC	2	10	501992	502001	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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