MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 chromosome

Total Repeats: 52734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010723	ATA	2	6	364	369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
2	NC_010723	TAA	2	6	381	386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
3	NC_010723	TAG	2	6	402	407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
4	NC_010723	ATG	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
5	NC_010723	ATA	2	6	662	667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
6	NC_010723	TTC	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188589439
7	NC_010723	TAA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
8	NC_010723	GAT	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
9	NC_010723	GAA	2	6	745	750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
10	NC_010723	GAT	2	6	790	795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
11	NC_010723	AAG	2	6	827	832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
12	NC_010723	TTC	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188589439
13	NC_010723	AAT	2	6	876	881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
14	NC_010723	ATC	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188589439
15	NC_010723	CCA	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188589439
16	NC_010723	AGA	2	6	921	926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
17	NC_010723	TAA	2	6	1106	1111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
18	NC_010723	AAT	2	6	1113	1118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
19	NC_010723	TAG	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
20	NC_010723	GAT	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
21	NC_010723	AGA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
22	NC_010723	GAA	2	6	1369	1374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
23	NC_010723	TGG	2	6	1377	1382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188589439
24	NC_010723	TAC	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188589439
25	NC_010723	TGA	2	6	1440	1445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
26	NC_010723	ACA	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188589439
27	NC_010723	AAG	2	6	1477	1482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
28	NC_010723	ATT	2	6	1784	1789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587627
29	NC_010723	CAA	2	6	1831	1836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587627
30	NC_010723	CTA	2	6	1867	1872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587627
31	NC_010723	ATG	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587627
32	NC_010723	TTA	2	6	1987	1992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587627
33	NC_010723	AGA	2	6	2033	2038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
34	NC_010723	TGT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188587627
35	NC_010723	CAT	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587627
36	NC_010723	ATT	2	6	2228	2233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587627
37	NC_010723	AAG	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
38	NC_010723	AGA	2	6	2372	2377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
39	NC_010723	TAA	2	6	2408	2413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587627
40	NC_010723	CAT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587627
41	NC_010723	TAC	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587627
42	NC_010723	ATT	2	6	2510	2515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587627
43	NC_010723	GAA	2	6	2532	2537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
44	NC_010723	CTT	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188587627
45	NC_010723	ATA	2	6	2584	2589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587627
46	NC_010723	AGA	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
47	NC_010723	TAA	3	9	2623	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587627
48	NC_010723	GAA	2	6	2661	2666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
49	NC_010723	GAA	2	6	2688	2693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
50	NC_010723	TTA	2	6	2721	2726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587627
51	NC_010723	TGA	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587627
52	NC_010723	AGG	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587627
53	NC_010723	AAG	2	6	2997	3002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588344
54	NC_010723	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588344
55	NC_010723	TAT	2	6	3064	3069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188588344
56	NC_010723	AAT	2	6	3217	3222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
57	NC_010723	AGA	2	6	3531	3536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590699
58	NC_010723	ATA	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
59	NC_010723	AAG	2	6	3567	3572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590699
60	NC_010723	TAT	2	6	3613	3618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188590699
61	NC_010723	TAA	2	6	3636	3641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
62	NC_010723	TAA	2	6	3684	3689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
63	NC_010723	TAG	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590699
64	NC_010723	ATT	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188590699
65	NC_010723	AGA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590699
66	NC_010723	AAT	2	6	3898	3903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
67	NC_010723	TTA	2	6	3904	3909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188590699
68	NC_010723	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
69	NC_010723	ATA	2	6	3974	3979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
70	NC_010723	CAA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188590699
71	NC_010723	TTC	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188590699
72	NC_010723	ATT	2	6	4054	4059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188590699
73	NC_010723	TTA	2	6	4087	4092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188590699
74	NC_010723	AGA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590699
75	NC_010723	GAT	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590699
76	NC_010723	TGT	2	6	4298	4303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188589365
77	NC_010723	ATT	2	6	4320	4325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188589365
78	NC_010723	ATA	2	6	4342	4347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589365
79	NC_010723	GAA	2	6	4389	4394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589365
80	NC_010723	TAA	2	6	4454	4459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589365
81	NC_010723	TCT	2	6	4488	4493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188589365
82	NC_010723	AAT	2	6	4580	4585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588443
83	NC_010723	ATG	2	6	4593	4598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
84	NC_010723	GTA	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
85	NC_010723	ATA	2	6	4710	4715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588443
86	NC_010723	TGA	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
87	NC_010723	CAG	2	6	4842	4847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188588443
88	NC_010723	TAA	2	6	4854	4859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588443
89	NC_010723	CGG	2	6	4876	4881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188588443
90	NC_010723	TGG	3	9	4888	4896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188588443
91	NC_010723	TGG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188588443
92	NC_010723	TGT	2	6	4939	4944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188588443
93	NC_010723	CAA	2	6	5000	5005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188588443
94	NC_010723	GAA	2	6	5057	5062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588443
95	NC_010723	ACA	2	6	5069	5074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188588443
96	NC_010723	TGA	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
97	NC_010723	GAT	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
98	NC_010723	GAA	2	6	5210	5215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588443
99	NC_010723	ATT	2	6	5217	5222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188588443
100	NC_010723	ATG	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
101	NC_010723	TAA	2	6	5383	5388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588443
102	NC_010723	TGA	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
103	NC_010723	CAG	2	6	5532	5537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188588443
104	NC_010723	TTG	2	6	5616	5621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188588443
105	NC_010723	AGA	2	6	5656	5661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588443
106	NC_010723	GCA	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188588443
107	NC_010723	GCT	2	6	5723	5728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188588443
108	NC_010723	TGG	3	9	5992	6000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188588443
109	NC_010723	ATA	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588443
110	NC_010723	AAT	3	9	6043	6051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588443
111	NC_010723	ATT	3	9	6091	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188588443
112	NC_010723	TAG	2	6	6129	6134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
113	NC_010723	TGA	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
114	NC_010723	AAG	2	6	6424	6429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588443
115	NC_010723	TGT	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188588443
116	NC_010723	TAG	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587904
117	NC_010723	ATC	2	6	6730	6735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587904
118	NC_010723	ATG	2	6	6757	6762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587904
119	NC_010723	TAG	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587904
120	NC_010723	TGC	2	6	6848	6853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188587904
121	NC_010723	GAA	4	12	6954	6965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587904
122	NC_010723	ATC	2	6	7010	7015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587904
123	NC_010723	CCT	2	6	7047	7052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188587904
124	NC_010723	AAT	2	6	7082	7087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587904
125	NC_010723	CAA	2	6	7162	7167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587904
126	NC_010723	TAG	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587904
127	NC_010723	GAA	3	9	7245	7253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587904
128	NC_010723	ATA	2	6	7269	7274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587904
129	NC_010723	TAA	2	6	7298	7303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587904
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131	NC_010723	TTA	2	6	7449	7454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587904
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