MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium populi BJ001 plasmid pMPOP02

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010721	GCCG	2	8	227	234	0 %	0 %	50 %	50 %	188579260
2	NC_010721	CGGC	2	8	528	535	0 %	0 %	50 %	50 %	188579261
3	NC_010721	GACC	2	8	750	757	25 %	0 %	25 %	50 %	188579262
4	NC_010721	TCGC	2	8	903	910	0 %	25 %	25 %	50 %	188579262
5	NC_010721	CGGA	2	8	1841	1848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010721	CGGG	2	8	2114	2121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010721	GCCG	2	8	2363	2370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010721	CCGG	2	8	2442	2449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010721	TGCT	2	8	3349	3356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010721	CGAA	2	8	3408	3415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010721	GCGG	2	8	3551	3558	0 %	0 %	75 %	25 %	188579265
12	NC_010721	TCGC	2	8	4101	4108	0 %	25 %	25 %	50 %	188579265
13	NC_010721	TCGC	2	8	4152	4159	0 %	25 %	25 %	50 %	188579265
14	NC_010721	GGAA	2	8	4204	4211	50 %	0 %	50 %	0 %	188579265
15	NC_010721	ACGA	2	8	4779	4786	50 %	0 %	25 %	25 %	188579265
16	NC_010721	GAAG	2	8	4973	4980	50 %	0 %	50 %	0 %	188579265
17	NC_010721	GCTC	2	8	5227	5234	0 %	25 %	25 %	50 %	188579265
18	NC_010721	CGTC	2	8	5650	5657	0 %	25 %	25 %	50 %	188579265
19	NC_010721	CGAC	2	8	5863	5870	25 %	0 %	25 %	50 %	188579265
20	NC_010721	CGAG	2	8	6031	6038	25 %	0 %	50 %	25 %	188579265
21	NC_010721	GCCG	2	8	6407	6414	0 %	0 %	50 %	50 %	188579265
22	NC_010721	CGGC	2	8	6568	6575	0 %	0 %	50 %	50 %	188579265
23	NC_010721	CGTC	2	8	7794	7801	0 %	25 %	25 %	50 %	188579266
24	NC_010721	GCCG	2	8	8229	8236	0 %	0 %	50 %	50 %	188579267
25	NC_010721	CCGG	2	8	8534	8541	0 %	0 %	50 %	50 %	188579267
26	NC_010721	GGCG	2	8	8865	8872	0 %	0 %	75 %	25 %	188579267
27	NC_010721	TTTC	2	8	9139	9146	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010721	CACG	2	8	9279	9286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010721	CATC	2	8	9400	9407	25 %	25 %	0 %	50 %	188579268
30	NC_010721	GCCT	2	8	9599	9606	0 %	25 %	25 %	50 %	188579268
31	NC_010721	ATCG	2	8	9679	9686	25 %	25 %	25 %	25 %	188579268
32	NC_010721	TCAT	2	8	9908	9915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010721	GCCT	2	8	10763	10770	0 %	25 %	25 %	50 %	188579270
34	NC_010721	CGCT	2	8	10826	10833	0 %	25 %	25 %	50 %	188579270
35	NC_010721	CGTC	2	8	11109	11116	0 %	25 %	25 %	50 %	188579270
36	NC_010721	GATC	2	8	11912	11919	25 %	25 %	25 %	25 %	188579271
37	NC_010721	GGTC	2	8	12374	12381	0 %	25 %	50 %	25 %	188579271
38	NC_010721	GGCC	2	8	12698	12705	0 %	0 %	50 %	50 %	188579271
39	NC_010721	CTGG	2	8	12740	12747	0 %	25 %	50 %	25 %	188579271
40	NC_010721	CGCC	2	8	12758	12765	0 %	0 %	25 %	75 %	188579271
41	NC_010721	GACG	2	8	12803	12810	25 %	0 %	50 %	25 %	188579271
42	NC_010721	TCGA	2	8	12952	12959	25 %	25 %	25 %	25 %	188579271
43	NC_010721	GCGA	2	8	13380	13387	25 %	0 %	50 %	25 %	188579271
44	NC_010721	ACCT	2	8	13980	13987	25 %	25 %	0 %	50 %	188579271
45	NC_010721	CGGC	2	8	14018	14025	0 %	0 %	50 %	50 %	188579271
46	NC_010721	ACGG	2	8	14682	14689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010721	GCAC	2	8	14759	14766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010721	GCTC	2	8	14816	14823	0 %	25 %	25 %	50 %	188579273
49	NC_010721	GCCG	2	8	14884	14891	0 %	0 %	50 %	50 %	188579273
50	NC_010721	CGGC	2	8	14962	14969	0 %	0 %	50 %	50 %	188579273
51	NC_010721	GTGC	2	8	15144	15151	0 %	25 %	50 %	25 %	188579273
52	NC_010721	GCTC	2	8	15321	15328	0 %	25 %	25 %	50 %	188579273
53	NC_010721	CGGC	2	8	16392	16399	0 %	0 %	50 %	50 %	188579274
54	NC_010721	CCGC	2	8	16573	16580	0 %	0 %	25 %	75 %	188579275
55	NC_010721	CAAG	2	8	16654	16661	50 %	0 %	25 %	25 %	188579275
56	NC_010721	TTAC	2	8	17202	17209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010721	CGAC	2	8	17633	17640	25 %	0 %	25 %	50 %	188579276
58	NC_010721	ACGC	2	8	18418	18425	25 %	0 %	25 %	50 %	188579276
59	NC_010721	CGGC	2	8	18500	18507	0 %	0 %	50 %	50 %	188579276
60	NC_010721	ACCT	2	8	18855	18862	25 %	25 %	0 %	50 %	188579277
61	NC_010721	CGAC	2	8	19187	19194	25 %	0 %	25 %	50 %	188579279
62	NC_010721	ACAA	2	8	19665	19672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010721	CGGC	2	8	19897	19904	0 %	0 %	50 %	50 %	188579280
64	NC_010721	CGGC	2	8	19999	20006	0 %	0 %	50 %	50 %	188579280
65	NC_010721	CGGC	2	8	20383	20390	0 %	0 %	50 %	50 %	188579280
66	NC_010721	GCCG	2	8	20795	20802	0 %	0 %	50 %	50 %	188579280
67	NC_010721	CAAG	2	8	20906	20913	50 %	0 %	25 %	25 %	188579281
68	NC_010721	GCCG	2	8	20963	20970	0 %	0 %	50 %	50 %	188579281
69	NC_010721	CGCA	2	8	21084	21091	25 %	0 %	25 %	50 %	188579281
70	NC_010721	GCCG	2	8	21759	21766	0 %	0 %	50 %	50 %	188579282
71	NC_010721	CGTC	2	8	21956	21963	0 %	25 %	25 %	50 %	188579283
72	NC_010721	CTCA	2	8	22448	22455	25 %	25 %	0 %	50 %	188579284
73	NC_010721	GGCA	2	8	22685	22692	25 %	0 %	50 %	25 %	188579285
74	NC_010721	GCTC	2	8	23049	23056	0 %	25 %	25 %	50 %	188579285
75	NC_010721	TCAG	2	8	23280	23287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.