MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium populi BJ001 plasmid pMPOP02

Total Repeats: 323

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010721	GAG	2	6	42	47	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579260
2	NC_010721	ACG	2	6	82	87	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579260
3	NC_010721	CGC	2	6	107	112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579260
4	NC_010721	CGC	2	6	128	133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579260
5	NC_010721	CCT	3	9	242	250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579260
6	NC_010721	TCG	2	6	384	389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579261
7	NC_010721	GCG	2	6	397	402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579261
8	NC_010721	GAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579261
9	NC_010721	GGC	2	6	455	460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579261
10	NC_010721	GGC	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579261
11	NC_010721	CAC	2	6	574	579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188579261
12	NC_010721	GCC	2	6	762	767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579262
13	NC_010721	CGC	2	6	840	845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579262
14	NC_010721	GCC	2	6	952	957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579262
15	NC_010721	CGA	2	6	966	971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579262
16	NC_010721	CGA	2	6	981	986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579262
17	NC_010721	CTC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579262
18	NC_010721	CGT	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579262
19	NC_010721	GAG	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579262
20	NC_010721	CGA	2	6	1157	1162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579263
21	NC_010721	CGC	2	6	1205	1210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579263
22	NC_010721	GAG	2	6	1263	1268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579263
23	NC_010721	CAC	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188579263
24	NC_010721	TGA	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188579264
25	NC_010721	GCC	2	6	1580	1585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579264
26	NC_010721	GAA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188579264
27	NC_010721	TCG	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579264
28	NC_010721	CGC	2	6	1732	1737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579264
29	NC_010721	CGC	2	6	1771	1776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579264
30	NC_010721	CGA	2	6	1783	1788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579264
31	NC_010721	GAC	2	6	1796	1801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579264
32	NC_010721	TCG	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
33	NC_010721	TTG	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188579265
34	NC_010721	TTC	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188579265
35	NC_010721	GGC	2	6	3563	3568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
36	NC_010721	GAG	2	6	3591	3596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
37	NC_010721	GAG	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
38	NC_010721	CAC	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188579265
39	NC_010721	GCA	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
40	NC_010721	GCA	2	6	3794	3799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
41	NC_010721	CTC	2	6	3846	3851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579265
42	NC_010721	TCA	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579265
43	NC_010721	CGT	2	6	3911	3916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
44	NC_010721	CGC	2	6	3929	3934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
45	NC_010721	CGA	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
46	NC_010721	GAG	2	6	4044	4049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
47	NC_010721	CGG	2	6	4226	4231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
48	NC_010721	CGA	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
49	NC_010721	TCG	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
50	NC_010721	TCG	2	6	4351	4356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
51	NC_010721	GGC	2	6	4382	4387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
52	NC_010721	CGA	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
53	NC_010721	AGC	2	6	4513	4518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
54	NC_010721	CGC	2	6	4548	4553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
55	NC_010721	CGG	2	6	4580	4585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
56	NC_010721	CGA	2	6	4610	4615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
57	NC_010721	GGC	2	6	4617	4622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
58	NC_010721	GCC	2	6	4662	4667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
59	NC_010721	CTC	2	6	4695	4700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579265
60	NC_010721	GAG	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
61	NC_010721	TCG	2	6	4732	4737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
62	NC_010721	GAG	2	6	4740	4745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
63	NC_010721	GCC	2	6	4750	4755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
64	NC_010721	GAG	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
65	NC_010721	GAG	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
66	NC_010721	GAC	2	6	4934	4939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
67	NC_010721	GAG	2	6	4944	4949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
68	NC_010721	GGC	2	6	4992	4997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
69	NC_010721	GGC	2	6	5021	5026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
70	NC_010721	GAG	2	6	5097	5102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
71	NC_010721	CGC	2	6	5132	5137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
72	NC_010721	GAC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
73	NC_010721	GAG	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
74	NC_010721	GTC	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
75	NC_010721	GGC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
76	NC_010721	GAA	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188579265
77	NC_010721	CTC	2	6	5309	5314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579265
78	NC_010721	AAG	2	6	5364	5369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188579265
79	NC_010721	CGA	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
80	NC_010721	CGC	2	6	5609	5614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
81	NC_010721	GGC	2	6	5615	5620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
82	NC_010721	GCG	3	9	5641	5649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
83	NC_010721	CTC	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579265
84	NC_010721	GAG	2	6	5802	5807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
85	NC_010721	GCC	2	6	5814	5819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
86	NC_010721	TCA	2	6	5872	5877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579265
87	NC_010721	CGT	2	6	5881	5886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
88	NC_010721	CGA	2	6	5921	5926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
89	NC_010721	GGC	2	6	5957	5962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
90	NC_010721	CGC	2	6	6011	6016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
91	NC_010721	CGC	2	6	6041	6046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
92	NC_010721	GTC	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
93	NC_010721	GGC	2	6	6098	6103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
94	NC_010721	CGA	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
95	NC_010721	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579265
96	NC_010721	CGG	2	6	6290	6295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
97	NC_010721	CTC	2	6	6308	6313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579265
98	NC_010721	CGG	2	6	6338	6343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
99	NC_010721	CGG	2	6	6359	6364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
100	NC_010721	GGC	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
101	NC_010721	GTG	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579265
102	NC_010721	CGG	2	6	6509	6514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
103	NC_010721	CGG	2	6	6551	6556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
104	NC_010721	GTG	2	6	6582	6587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579265
105	NC_010721	TCA	2	6	6601	6606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579265
106	NC_010721	GCG	2	6	6622	6627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
107	NC_010721	GGC	2	6	6668	6673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
108	NC_010721	AGT	2	6	6745	6750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188579265
109	NC_010721	ACG	2	6	7511	7516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579266
110	NC_010721	GGT	2	6	7525	7530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579266
111	NC_010721	CGT	2	6	7533	7538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579266
112	NC_010721	CGC	2	6	7618	7623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579266
113	NC_010721	ATC	2	6	7652	7657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579266
114	NC_010721	GCC	2	6	7678	7683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579266
115	NC_010721	CGA	2	6	7693	7698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579266
116	NC_010721	CGC	2	6	7744	7749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579266
117	NC_010721	GCG	2	6	7783	7788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579266
118	NC_010721	CGA	2	6	7825	7830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579266
119	NC_010721	TGC	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579267
120	NC_010721	ACG	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579267
121	NC_010721	CTC	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579267
122	NC_010721	CGC	2	6	8220	8225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579267
123	NC_010721	CTC	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579267
124	NC_010721	GTG	2	6	8308	8313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579267
125	NC_010721	GTG	2	6	8320	8325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579267
126	NC_010721	CGG	2	6	8347	8352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579267
127	NC_010721	CTC	2	6	8454	8459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579267
128	NC_010721	CCT	3	9	8462	8470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579267
129	NC_010721	AAG	2	6	8485	8490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188579267
130	NC_010721	GAC	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579267
131	NC_010721	CAT	2	6	8586	8591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579267
132	NC_010721	TCA	2	6	8660	8665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579267
133	NC_010721	CCT	2	6	8691	8696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579267
134	NC_010721	GCC	2	6	8708	8713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579267
135	NC_010721	CGA	3	9	8778	8786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579267
136	NC_010721	CGG	2	6	8805	8810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579267
137	NC_010721	GCA	2	6	8916	8921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579267
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139	NC_010721	GCC	2	6	8989	8994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579267
140	NC_010721	CTC	2	6	9043	9048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579267
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143	NC_010721	CGA	2	6	9377	9382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579268
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151	NC_010721	GGT	2	6	9782	9787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579268
152	NC_010721	CCG	2	6	9795	9800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579268
153	NC_010721	TCG	2	6	9805	9810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579268
154	NC_010721	GCC	2	6	9819	9824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579268
155	NC_010721	GAC	2	6	10032	10037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579269
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158	NC_010721	TGA	2	6	10145	10150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188579269
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163	NC_010721	ATC	2	6	10701	10706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579270
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254	NC_010721	GGA	2	6	18162	18167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579276
255	NC_010721	TCC	2	6	18350	18355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579276
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257	NC_010721	GGA	2	6	18372	18377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579276
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.