MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF chromosome

Total Repeats: 545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010718	TATAT	2	10	1664	1673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010718	GAAAA	2	10	7569	7578	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010718	GGAAG	2	10	7579	7588	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010718	GAAAA	2	10	10298	10307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010718	CCTTC	2	10	11550	11559	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_010718	TCGTG	2	10	11597	11606	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010718	GGGAG	2	10	13076	13085	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010718	AAGCA	2	10	13784	13793	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010718	GTAGG	2	10	14161	14170	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010718	CCGTA	2	10	14333	14342	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_010718	TAAAT	2	10	16032	16041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010718	AAATT	2	10	17948	17957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010718	ATTTG	2	10	20117	20126	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010718	AATCC	2	10	22507	22516	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010718	ATTTA	2	10	24521	24530	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010718	ATATT	2	10	24750	24759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010718	CTCGA	2	10	25352	25361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010718	ATATA	2	10	29295	29304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010718	AAATT	2	10	29636	29645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010718	ATTTT	2	10	37013	37022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010718	GTATA	2	10	55544	55553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010718	TCCCC	2	10	63011	63020	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
23	NC_010718	TCAAT	2	10	80993	81002	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010718	AGGGG	2	10	85389	85398	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010718	TTCAT	2	10	102061	102070	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010718	TACAA	2	10	121730	121739	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010718	TTAAT	2	10	125537	125546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010718	CCTTC	2	10	136940	136949	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_010718	TCGTG	2	10	136987	136996	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010718	GGGAG	2	10	138466	138475	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010718	AAGCA	2	10	139174	139183	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010718	GTAGG	2	10	139551	139560	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010718	CCGTA	2	10	139723	139732	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_010718	TAAAA	2	10	145314	145323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010718	CAGGG	2	10	145352	145361	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010718	TAATA	2	10	149243	149252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010718	CAAAA	2	10	152331	152340	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010718	TGAAT	2	10	159423	159432	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010718	TAGCA	2	10	159444	159453	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010718	ATTTC	2	10	162735	162744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010718	ATAAA	2	10	172737	172746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010718	TAATT	2	10	177725	177734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010718	AGGTG	2	10	177739	177748	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010718	ATCAA	2	10	186068	186077	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010718	CTTTA	2	10	194609	194618	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010718	TAAAA	2	10	200167	200176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010718	GCAGT	2	10	200251	200260	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010718	ATTAG	2	10	232467	232476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010718	AGGGG	2	10	235430	235439	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010718	TTATA	2	10	243354	243363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010718	ATTAA	2	10	243590	243599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010718	TAAAT	2	10	264341	264350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010718	TGAAT	2	10	273944	273953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010718	GGTGG	2	10	278053	278062	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010718	ATCTA	2	10	284152	284161	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010718	TTTTA	2	10	287748	287757	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010718	CAGGT	2	10	294498	294507	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010718	AGTGA	2	10	296299	296308	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010718	AAATT	2	10	303850	303859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010718	TATAA	2	10	306808	306817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010718	CACAA	2	10	311928	311937	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010718	CCTTC	2	10	313140	313149	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_010718	TCGTG	2	10	313187	313196	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010718	GGGAG	2	10	314414	314423	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010718	AAGCA	2	10	315122	315131	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010718	GTAGG	2	10	315499	315508	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010718	CCGTA	2	10	315671	315680	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_010718	GGGAG	2	10	327686	327695	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010718	TTGTT	2	10	331926	331935	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010718	AATTG	2	10	346860	346869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010718	TTAAA	2	10	358843	358852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010718	AATAA	2	10	370432	370441	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010718	AAAAT	2	10	372519	372528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010718	TATTT	2	10	373150	373159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010718	ATTTT	2	10	375157	375166	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010718	ATGAA	2	10	385167	385176	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010718	AATTG	2	10	391521	391530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010718	CAATC	2	10	396138	396147	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_010718	AATAA	2	10	398926	398935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010718	TTATT	2	10	419088	419097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010718	TTCAA	2	10	451747	451756	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010718	TAATT	2	10	467477	467486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010718	TAATA	2	10	473294	473303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010718	GACCG	2	10	477998	478007	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_010718	AGATA	2	10	490303	490312	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010718	TTTTA	2	10	494961	494970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010718	AGATG	2	10	503596	503605	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010718	TTAGT	2	10	506989	506998	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010718	ATAAA	2	10	507098	507107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010718	TGTCA	2	10	513182	513191	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010718	TGGTT	2	10	514861	514870	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010718	TAATT	2	10	537904	537913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010718	AAAAT	2	10	542363	542372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010718	TGAAA	2	10	579145	579154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010718	TTAAT	2	10	579935	579944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010718	AACTA	2	10	612927	612936	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010718	CTAAC	2	10	613435	613444	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_010718	AGCAT	2	10	618171	618180	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010718	GACAG	2	10	620972	620981	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010718	GGGGA	2	10	622593	622602	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010718	CAAAA	2	10	623991	624000	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010718	ATCAA	2	10	632752	632761	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_010718	GATAA	2	10	632798	632807	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010718	GAGTT	2	10	632864	632873	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010718	TAATT	2	10	635874	635883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010718	TTTAA	2	10	640725	640734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010718	ATGTG	2	10	645779	645788	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010718	TATAT	2	10	647319	647328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010718	TTTAC	2	10	651338	651347	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010718	AACAA	2	10	657911	657920	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010718	GTAGA	2	10	678009	678018	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010718	GAGGG	2	10	678138	678147	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010718	ATCAC	2	10	691035	691044	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_010718	TTTAT	2	10	691045	691054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010718	ATTTC	2	10	691154	691163	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010718	ATTTC	2	10	691862	691871	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010718	AATGA	2	10	692012	692021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010718	GATTA	2	10	692143	692152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010718	ATTTA	2	10	694724	694733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010718	GTAGG	2	10	715057	715066	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010718	TGAAT	2	10	716266	716275	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010718	ATTCC	2	10	719983	719992	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_010718	TAAAC	2	10	734859	734868	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010718	AGGAA	2	10	735298	735307	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010718	TCTTT	2	10	735753	735762	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010718	TGTCA	2	10	735763	735772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010718	ATCAA	2	10	740192	740201	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010718	AGCAA	2	10	740767	740776	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010718	AGGGT	2	10	743856	743865	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010718	ATCAC	2	10	746793	746802	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_010718	ATTAA	2	10	747020	747029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010718	ATTTT	2	10	761623	761632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010718	TGAGA	2	10	763022	763031	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010718	TATAA	2	10	773643	773652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010718	TATGA	2	10	784755	784764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010718	ATCAA	2	10	788216	788225	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010718	AGCAA	2	10	788791	788800	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010718	TTGCT	2	10	789578	789587	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010718	TTGAT	2	10	790153	790162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010718	TTGAT	2	10	791192	791201	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010718	AAAAT	2	10	801733	801742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010718	TAAAT	2	10	811089	811098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010718	TTTAA	2	10	811112	811121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010718	AAGGA	2	10	814933	814942	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010718	TCCTT	2	10	814961	814970	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_010718	TTCAC	2	10	815092	815101	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_010718	TAGTG	2	10	817862	817871	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010718	AAAAG	2	10	824998	825007	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_010718	AAATT	2	10	2705161	2705170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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