MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010717	CGGTG	2	10	7714	7723	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010717	CACTG	2	10	11295	11304	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010717	CAACA	2	10	13614	13623	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010717	ACGGT	2	10	14978	14987	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010717	GCGCC	2	10	14997	15006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_010717	CAGCG	2	10	22879	22888	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010717	CCAGA	2	10	26027	26036	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010717	GGCAC	2	10	27325	27334	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010717	GGCGG	2	10	27335	27344	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010717	GGGAG	2	10	30680	30689	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010717	GCATC	2	10	31260	31269	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010717	CCGCG	2	10	43127	43136	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_010717	CAGGT	2	10	46976	46985	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010717	GCTTG	2	10	49600	49609	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010717	CCGTC	2	10	50987	50996	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_010717	TGCGC	2	10	55788	55797	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010717	CGCAA	2	10	58267	58276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010717	GAAGC	2	10	70901	70910	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010717	CGTGC	2	10	84485	84494	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010717	CTGAG	2	10	84515	84524	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010717	ATTGC	2	10	87101	87110	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010717	TTCGC	2	10	99204	99213	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010717	CCAAG	2	10	112514	112523	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_010717	GCATG	2	10	113734	113743	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010717	CGACC	2	10	120598	120607	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_010717	GCCGT	2	10	121857	121866	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010717	AGTGC	2	10	121880	121889	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010717	GATTG	2	10	122020	122029	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010717	GGCCT	2	10	122047	122056	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_010717	AGCGC	2	10	124605	124614	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_010717	CGCAT	2	10	125811	125820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_010717	GTTGG	2	10	129428	129437	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010717	CTTAT	2	10	135577	135586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010717	TCAGG	2	10	138697	138706	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010717	ATCGC	2	10	142737	142746	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010717	GCTTG	2	10	148170	148179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010717	CGGCG	2	10	156939	156948	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_010717	TTAAT	2	10	158479	158488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010717	ACCTG	2	10	163802	163811	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010717	GGCTC	2	10	164270	164279	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_010717	CGAAC	2	10	173286	173295	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_010717	TGGCG	2	10	182897	182906	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010717	AGCGC	2	10	194057	194066	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010717	TGCAC	2	10	200715	200724	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_010717	GTGCC	2	10	207675	207684	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010717	ATTTT	2	10	208995	209004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010717	TGTCG	2	10	209062	209071	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010717	TGCAC	2	10	217277	217286	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_010717	ATGCG	2	10	237434	237443	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010717	GTTGA	2	10	239182	239191	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010717	CCGGG	2	10	244314	244323	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_010717	CGGCA	2	10	246540	246549	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_010717	GCAGT	2	10	255618	255627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010717	AACGT	2	10	260446	260455	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010717	GCCTT	2	10	260485	260494	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_010717	GCATC	2	10	264312	264321	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_010717	CTCGC	2	10	265508	265517	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_010717	AAGGC	2	10	265894	265903	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010717	AAAGG	2	10	268471	268480	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010717	GAACT	2	10	269602	269611	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010717	TGCAC	2	10	271464	271473	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010717	CGCTG	2	10	272754	272763	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010717	TGCTC	2	10	272914	272923	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_010717	CGCTG	2	10	291311	291320	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_010717	TTGCG	2	10	291473	291482	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010717	GCTGG	2	10	303641	303650	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010717	CGCTT	2	10	309324	309333	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_010717	CCGCG	2	10	312028	312037	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_010717	CGGCG	2	10	315575	315584	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_010717	CCGGC	2	10	337822	337831	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_010717	CAACG	2	10	337839	337848	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_010717	CAACG	2	10	343012	343021	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_010717	CGAGG	2	10	343890	343899	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010717	TCACC	2	10	343919	343928	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_010717	GGCGT	2	10	346646	346655	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010717	CACGC	2	10	348197	348206	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_010717	GGGAG	2	10	361582	361591	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010717	TCCCT	2	10	366118	366127	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_010717	GAATC	2	10	366451	366460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010717	TCCGA	2	10	371887	371896	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_010717	GAACA	2	10	373145	373154	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010717	CTGCG	2	10	375530	375539	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_010717	AGCCC	2	10	375585	375594	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_010717	CTGCA	2	10	386932	386941	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_010717	CATGG	2	10	401474	401483	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010717	GGGGT	2	10	412983	412992	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010717	AGCCG	2	10	417196	417205	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_010717	AAGCC	2	10	420220	420229	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_010717	CGTTG	2	10	423487	423496	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010717	GCGCC	2	10	423560	423569	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
91	NC_010717	GACAG	2	10	427274	427283	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010717	TGCGC	2	10	430378	430387	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010717	GCAGC	2	10	432665	432674	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_010717	CGGCG	2	10	433262	433271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_010717	CTCGC	2	10	442349	442358	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_010717	ACCGC	2	10	445231	445240	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_010717	GCGTT	2	10	455647	455656	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010717	ACGCA	2	10	461482	461491	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_010717	GTGAG	2	10	461783	461792	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010717	TCTGG	2	10	466344	466353	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010717	CGGCG	2	10	473931	473940	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_010717	GGGAA	2	10	473953	473962	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010717	TCGCC	2	10	482073	482082	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_010717	GATCT	2	10	484488	484497	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010717	TCCCT	2	10	486136	486145	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_010717	GTGCA	2	10	489102	489111	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010717	AGCGC	2	10	489116	489125	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_010717	TGCGA	2	10	489141	489150	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010717	GACAA	2	10	496369	496378	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010717	TTTCG	2	10	510463	510472	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010717	ATCGC	2	10	514876	514885	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_010717	TGCAG	2	10	523583	523592	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010717	TGCGC	2	10	539977	539986	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_010717	GCCGC	2	10	540055	540064	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_010717	CTGCG	2	10	543998	544007	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_010717	GCAGG	2	10	552885	552894	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010717	GAGCA	2	10	556588	556597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_010717	GTGCA	2	10	557518	557527	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010717	CAGGT	2	10	570117	570126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010717	CGCAA	2	10	572329	572338	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_010717	CGCAC	2	10	576098	576107	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_010717	TGGGC	2	10	577561	577570	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010717	AGCGC	2	10	579847	579856	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_010717	GTGCA	2	10	580503	580512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010717	CGTGC	2	10	588975	588984	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_010717	TGCCT	2	10	603376	603385	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010717	GCTTC	2	10	616993	617002	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_010717	CTTCG	2	10	621929	621938	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_010717	CGCCC	2	10	621943	621952	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
130	NC_010717	ATGCA	2	10	634287	634296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010717	TCAGG	2	10	636998	637007	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010717	GTGCA	2	10	637408	637417	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010717	CTTGG	2	10	637537	637546	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010717	TTGTC	2	10	645742	645751	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010717	GTGCT	2	10	655015	655024	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010717	AGCGC	2	10	658623	658632	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_010717	GCATG	2	10	662329	662338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010717	CTGCA	2	10	662467	662476	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_010717	ACGCA	2	10	663061	663070	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_010717	GGCCG	2	10	683038	683047	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_010717	CGGCG	2	10	685900	685909	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_010717	AGCGC	2	10	685924	685933	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_010717	GCCGT	4	20	686068	686087	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_010717	ACGCC	2	10	699743	699752	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_010717	TCACG	2	10	717688	717697	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_010717	CTGCG	2	10	720706	720715	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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148	NC_010717	CGCTG	2	10	724043	724052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_010717	ACCGC	2	10	726409	726418	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
150	NC_010717	TGCGA	2	10	738272	738281	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_010717	TGCGG	2	10	770717	770726	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_010717	TATGC	2	10	942124	942133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_010717	ACACG	2	10	1467271	1467280	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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279	NC_010717	GACCT	2	10	1482415	1482424	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_010717	CGCAG	2	10	1540253	1540262	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
287	NC_010717	GCATC	2	10	1557901	1557910	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_010717	GTTTT	2	10	1560565	1560574	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_010717	TGCGC	2	10	1572044	1572053	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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295	NC_010717	GCCAT	2	10	1589808	1589817	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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323	NC_010717	CTGCG	2	10	1785506	1785515	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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333	NC_010717	TCAGG	2	10	1838688	1838697	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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389	NC_010717	CGCTG	2	10	2232698	2232707	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
390	NC_010717	GGCCA	2	10	2235162	2235171	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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400	NC_010717	GTGCA	2	10	2313880	2313889	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
401	NC_010717	AGGGC	2	10	2321622	2321631	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
402	NC_010717	CCGCA	2	10	2333044	2333053	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
403	NC_010717	TCAGG	2	10	2348282	2348291	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
404	NC_010717	CGCCA	2	10	2348906	2348915	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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406	NC_010717	TGCGC	2	10	2367699	2367708	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
407	NC_010717	GATTG	2	10	2368234	2368243	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_010717	AGCGA	2	10	2392440	2392449	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
411	NC_010717	CGCCC	2	10	2400327	2400336	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
412	NC_010717	ACGTC	2	10	2401188	2401197	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
413	NC_010717	ATGCG	2	10	2404521	2404530	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
414	NC_010717	CATTG	2	10	2404805	2404814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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416	NC_010717	CGGCA	2	10	2408597	2408606	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
417	NC_010717	ACGAT	2	10	2409240	2409249	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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419	NC_010717	GTAGC	2	10	2411507	2411516	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
420	NC_010717	GACGC	2	10	2412037	2412046	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
421	NC_010717	GCGCC	2	10	2418712	2418721	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
422	NC_010717	GGCAC	2	10	2418749	2418758	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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424	NC_010717	TCAGG	2	10	2425220	2425229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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461	NC_010717	TCCGC	2	10	2771803	2771812	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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465	NC_010717	CGCAG	2	10	2794708	2794717	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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467	NC_010717	CAACG	2	10	2817436	2817445	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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498	NC_010717	AGTCC	2	10	3044767	3044776	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_010717	CACCT	2	10	3081855	3081864	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

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