MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 11773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010717	GATG	2	8	44	51	25 %	25 %	50 %	0 %	188574271
2	NC_010717	CCCG	2	8	89	96	0 %	0 %	25 %	75 %	188574271
3	NC_010717	GTCG	2	8	839	846	0 %	25 %	50 %	25 %	188574271
4	NC_010717	CGAT	2	8	847	854	25 %	25 %	25 %	25 %	188574271
5	NC_010717	GCCG	2	8	1257	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	188574271
6	NC_010717	TGCC	2	8	1286	1293	0 %	25 %	25 %	50 %	188574271
7	NC_010717	CCTG	2	8	1728	1735	0 %	25 %	25 %	50 %	188574272
8	NC_010717	GGAC	2	8	1764	1771	25 %	0 %	50 %	25 %	188574272
9	NC_010717	CCCG	2	8	1858	1865	0 %	0 %	25 %	75 %	188574272
10	NC_010717	CTGC	2	8	1978	1985	0 %	25 %	25 %	50 %	188574272
11	NC_010717	CCGT	2	8	1996	2003	0 %	25 %	25 %	50 %	188574272
12	NC_010717	TGCG	2	8	2438	2445	0 %	25 %	50 %	25 %	188574272
13	NC_010717	CGAA	2	8	2471	2478	50 %	0 %	25 %	25 %	188574272
14	NC_010717	GCCT	2	8	4859	4866	0 %	25 %	25 %	50 %	188574273
15	NC_010717	CCCG	2	8	5023	5030	0 %	0 %	25 %	75 %	188574273
16	NC_010717	CGAA	2	8	6349	6356	50 %	0 %	25 %	25 %	188574274
17	NC_010717	GCAG	2	8	7154	7161	25 %	0 %	50 %	25 %	188574274
18	NC_010717	GCCG	2	8	8332	8339	0 %	0 %	50 %	50 %	188574275
19	NC_010717	ACCC	2	8	9457	9464	25 %	0 %	0 %	75 %	188574276
20	NC_010717	GCAA	2	8	9860	9867	50 %	0 %	25 %	25 %	188574277
21	NC_010717	TGGG	2	8	9899	9906	0 %	25 %	75 %	0 %	188574277
22	NC_010717	GTCG	2	8	11718	11725	0 %	25 %	50 %	25 %	188574278
23	NC_010717	CGTT	2	8	12446	12453	0 %	50 %	25 %	25 %	188574279
24	NC_010717	GGTG	2	8	12543	12550	0 %	25 %	75 %	0 %	188574279
25	NC_010717	GAAG	2	8	12913	12920	50 %	0 %	50 %	0 %	188574280
26	NC_010717	GTGC	2	8	14563	14570	0 %	25 %	50 %	25 %	188574282
27	NC_010717	GATC	2	8	14757	14764	25 %	25 %	25 %	25 %	188574283
28	NC_010717	GGTG	2	8	15800	15807	0 %	25 %	75 %	0 %	188574284
29	NC_010717	CATC	2	8	15932	15939	25 %	25 %	0 %	50 %	188574284
30	NC_010717	GTTG	2	8	17210	17217	0 %	50 %	50 %	0 %	188574285
31	NC_010717	GTTG	2	8	17496	17503	0 %	50 %	50 %	0 %	188574285
32	NC_010717	GGCT	2	8	17840	17847	0 %	25 %	50 %	25 %	188574285
33	NC_010717	CGGC	2	8	18077	18084	0 %	0 %	50 %	50 %	188574285
34	NC_010717	CGTG	2	8	18727	18734	0 %	25 %	50 %	25 %	188574286
35	NC_010717	TGGC	2	8	19134	19141	0 %	25 %	50 %	25 %	188574286
36	NC_010717	GCCG	2	8	19175	19182	0 %	0 %	50 %	50 %	188574286
37	NC_010717	CGGC	2	8	19317	19324	0 %	0 %	50 %	50 %	188574286
38	NC_010717	CGGG	2	8	20730	20737	0 %	0 %	75 %	25 %	188574287
39	NC_010717	GATC	2	8	20740	20747	25 %	25 %	25 %	25 %	188574287
40	NC_010717	GCCG	2	8	20805	20812	0 %	0 %	50 %	50 %	188574287
41	NC_010717	GAGC	2	8	20974	20981	25 %	0 %	50 %	25 %	188574287
42	NC_010717	AGCA	2	8	21883	21890	50 %	0 %	25 %	25 %	188574287
43	NC_010717	AGCG	2	8	22214	22221	25 %	0 %	50 %	25 %	188574288
44	NC_010717	GCAG	2	8	22231	22238	25 %	0 %	50 %	25 %	188574288
45	NC_010717	GCGT	2	8	22332	22339	0 %	25 %	50 %	25 %	188574288
46	NC_010717	CGCC	2	8	24328	24335	0 %	0 %	25 %	75 %	188574291
47	NC_010717	CGCC	2	8	24525	24532	0 %	0 %	25 %	75 %	188574291
48	NC_010717	CAGC	2	8	24686	24693	25 %	0 %	25 %	50 %	188574291
49	NC_010717	CGCC	2	8	24913	24920	0 %	0 %	25 %	75 %	188574291
50	NC_010717	CTGC	2	8	25081	25088	0 %	25 %	25 %	50 %	188574291
51	NC_010717	GCGT	2	8	25100	25107	0 %	25 %	50 %	25 %	188574291
52	NC_010717	CAGC	2	8	25717	25724	25 %	0 %	25 %	50 %	188574292
53	NC_010717	CTTC	2	8	26232	26239	0 %	50 %	0 %	50 %	188574293
54	NC_010717	TTAT	2	8	26366	26373	25 %	75 %	0 %	0 %	188574293
55	NC_010717	GCCC	2	8	26805	26812	0 %	0 %	25 %	75 %	188574293
56	NC_010717	GGGC	2	8	27932	27939	0 %	0 %	75 %	25 %	188574295
57	NC_010717	TCGA	2	8	28086	28093	25 %	25 %	25 %	25 %	188574295
58	NC_010717	GCCG	2	8	28514	28521	0 %	0 %	50 %	50 %	188574295
59	NC_010717	GCCG	2	8	29546	29553	0 %	0 %	50 %	50 %	188574298
60	NC_010717	CGGC	2	8	30052	30059	0 %	0 %	50 %	50 %	188574298
61	NC_010717	GATG	2	8	30109	30116	25 %	25 %	50 %	0 %	188574298
62	NC_010717	CTTG	2	8	30731	30738	0 %	50 %	25 %	25 %	188574299
63	NC_010717	GCCG	2	8	30797	30804	0 %	0 %	50 %	50 %	188574299
64	NC_010717	CTGG	2	8	33004	33011	0 %	25 %	50 %	25 %	188574300
65	NC_010717	GCGA	2	8	33039	33046	25 %	0 %	50 %	25 %	188574300
66	NC_010717	GTGC	2	8	35525	35532	0 %	25 %	50 %	25 %	188574302
67	NC_010717	GGCG	2	8	35570	35577	0 %	0 %	75 %	25 %	188574302
68	NC_010717	CAGG	2	8	36155	36162	25 %	0 %	50 %	25 %	188574303
69	NC_010717	CCAG	2	8	37016	37023	25 %	0 %	25 %	50 %	188574305
70	NC_010717	TGGC	2	8	37580	37587	0 %	25 %	50 %	25 %	188574306
71	NC_010717	ACCA	2	8	37806	37813	50 %	0 %	0 %	50 %	188574306
72	NC_010717	TTGC	2	8	39448	39455	0 %	50 %	25 %	25 %	188574308
73	NC_010717	CAAC	2	8	39651	39658	50 %	0 %	0 %	50 %	188574308
74	NC_010717	TGTT	2	8	39901	39908	0 %	75 %	25 %	0 %	188574308
75	NC_010717	CGAA	2	8	40850	40857	50 %	0 %	25 %	25 %	188574309
76	NC_010717	TGCT	2	8	41425	41432	0 %	50 %	25 %	25 %	188574311
77	NC_010717	TCGG	2	8	41888	41895	0 %	25 %	50 %	25 %	188574311
78	NC_010717	TCCA	2	8	42534	42541	25 %	25 %	0 %	50 %	188574312
79	NC_010717	GCAG	2	8	42849	42856	25 %	0 %	50 %	25 %	188574313
80	NC_010717	GCGG	2	8	42864	42871	0 %	0 %	75 %	25 %	188574313
81	NC_010717	TCGA	2	8	43476	43483	25 %	25 %	25 %	25 %	188574314
82	NC_010717	CGAA	2	8	43693	43700	50 %	0 %	25 %	25 %	188574314
83	NC_010717	CCCG	2	8	43857	43864	0 %	0 %	25 %	75 %	188574314
84	NC_010717	GATG	2	8	44277	44284	25 %	25 %	50 %	0 %	188574316
85	NC_010717	CCGA	2	8	44443	44450	25 %	0 %	25 %	50 %	188574316
86	NC_010717	CTGG	2	8	44868	44875	0 %	25 %	50 %	25 %	188574317
87	NC_010717	CCAT	2	8	45118	45125	25 %	25 %	0 %	50 %	188574317
88	NC_010717	GCTG	2	8	45579	45586	0 %	25 %	50 %	25 %	188574317
89	NC_010717	CGTC	2	8	46301	46308	0 %	25 %	25 %	50 %	188574318
90	NC_010717	GCGT	2	8	46374	46381	0 %	25 %	50 %	25 %	188574318
91	NC_010717	CACG	2	8	46531	46538	25 %	0 %	25 %	50 %	188574318
92	NC_010717	CGTC	2	8	46827	46834	0 %	25 %	25 %	50 %	188574318
93	NC_010717	CGCA	2	8	47513	47520	25 %	0 %	25 %	50 %	188574320
94	NC_010717	GTGC	2	8	47553	47560	0 %	25 %	50 %	25 %	188574320
95	NC_010717	AAGC	2	8	47883	47890	50 %	0 %	25 %	25 %	188574321
96	NC_010717	GCTG	2	8	49848	49855	0 %	25 %	50 %	25 %	188574324
97	NC_010717	CAGC	2	8	50445	50452	25 %	0 %	25 %	50 %	188574324
98	NC_010717	TGGC	2	8	51833	51840	0 %	25 %	50 %	25 %	188574326
99	NC_010717	GCCG	2	8	52866	52873	0 %	0 %	50 %	50 %	188574327
100	NC_010717	GACG	2	8	53140	53147	25 %	0 %	50 %	25 %	188574327
101	NC_010717	CACC	2	8	54320	54327	25 %	0 %	0 %	75 %	188574328
102	NC_010717	GTTG	2	8	54500	54507	0 %	50 %	50 %	0 %	188574328
103	NC_010717	CGCT	2	8	54559	54566	0 %	25 %	25 %	50 %	188574328
104	NC_010717	GCCG	2	8	54732	54739	0 %	0 %	50 %	50 %	188574329
105	NC_010717	CCAG	2	8	55072	55079	25 %	0 %	25 %	50 %	188574329
106	NC_010717	GCAC	2	8	55110	55117	25 %	0 %	25 %	50 %	188574329
107	NC_010717	CGCC	2	8	56092	56099	0 %	0 %	25 %	75 %	188574331
108	NC_010717	CCAT	2	8	56486	56493	25 %	25 %	0 %	50 %	188574331
109	NC_010717	GATG	2	8	56608	56615	25 %	25 %	50 %	0 %	188574331
110	NC_010717	GCCA	2	8	56885	56892	25 %	0 %	25 %	50 %	188574331
111	NC_010717	CGAC	2	8	59147	59154	25 %	0 %	25 %	50 %	188574334
112	NC_010717	CGTG	2	8	59309	59316	0 %	25 %	50 %	25 %	188574334
113	NC_010717	TTCC	2	8	59709	59716	0 %	50 %	0 %	50 %	188574334
114	NC_010717	CTCA	2	8	59817	59824	25 %	25 %	0 %	50 %	188574334
115	NC_010717	GATT	2	8	60211	60218	25 %	50 %	25 %	0 %	188574334
116	NC_010717	TCGG	2	8	61894	61901	0 %	25 %	50 %	25 %	188574336
117	NC_010717	AGCC	2	8	62289	62296	25 %	0 %	25 %	50 %	188574336
118	NC_010717	CCGC	2	8	62799	62806	0 %	0 %	25 %	75 %	188574336
119	NC_010717	TGGC	2	8	63378	63385	0 %	25 %	50 %	25 %	188574337
120	NC_010717	CGCC	2	8	63932	63939	0 %	0 %	25 %	75 %	188574338
121	NC_010717	ACGC	2	8	64012	64019	25 %	0 %	25 %	50 %	188574338
122	NC_010717	CGGT	2	8	64159	64166	0 %	25 %	50 %	25 %	188574338
123	NC_010717	AACG	2	8	65142	65149	50 %	0 %	25 %	25 %	188574338
124	NC_010717	CGCC	2	8	66501	66508	0 %	0 %	25 %	75 %	188574340
125	NC_010717	TCGC	2	8	66922	66929	0 %	25 %	25 %	50 %	188574341
126	NC_010717	GCTG	2	8	67211	67218	0 %	25 %	50 %	25 %	188574342
127	NC_010717	CAGC	2	8	70238	70245	25 %	0 %	25 %	50 %	188574346
128	NC_010717	TGCG	2	8	71073	71080	0 %	25 %	50 %	25 %	188574347
129	NC_010717	GCCG	2	8	71653	71660	0 %	0 %	50 %	50 %	188574348
130	NC_010717	GGGC	2	8	71910	71917	0 %	0 %	75 %	25 %	188574348
131	NC_010717	TGCA	2	8	72016	72023	25 %	25 %	25 %	25 %	188574348
132	NC_010717	TTGC	2	8	72385	72392	0 %	50 %	25 %	25 %	188574348
133	NC_010717	CGCT	2	8	72489	72496	0 %	25 %	25 %	50 %	188574348
134	NC_010717	CGAG	2	8	72546	72553	25 %	0 %	50 %	25 %	188574348
135	NC_010717	CGCC	2	8	72684	72691	0 %	0 %	25 %	75 %	188574348
136	NC_010717	CCAT	2	8	72794	72801	25 %	25 %	0 %	50 %	188574348
137	NC_010717	GGAA	2	8	73150	73157	50 %	0 %	50 %	0 %	188574348
138	NC_010717	AGCC	2	8	74141	74148	25 %	0 %	25 %	50 %	188574349
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