MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF plasmid pNTHE01

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010715	CTT	2	6	268	273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010715	CCT	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010715	TTC	2	6	359	364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010715	ATC	2	6	457	462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010715	CTT	2	6	531	536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010715	TCT	2	6	672	677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010715	TAA	2	6	937	942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010715	TAT	2	6	994	999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010715	TAA	2	6	1094	1099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010715	ATT	2	6	1142	1147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010715	ATT	2	6	1163	1168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010715	TTA	2	6	1182	1187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010715	TTA	2	6	1236	1241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010715	TTC	2	6	1247	1252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010715	TCT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010715	TAT	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010715	TCT	2	6	1473	1478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010715	TAA	2	6	1506	1511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010715	CTG	2	6	1516	1521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010715	TTA	2	6	1543	1548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010715	CTT	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010715	CAG	2	6	1699	1704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010715	AAT	2	6	1742	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010715	TGA	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010715	TTC	2	6	1848	1853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010715	TAA	2	6	1866	1871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010715	AAT	2	6	1938	1943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010715	AAC	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010715	TCC	2	6	2026	2031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010715	CTA	2	6	2048	2053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010715	ATA	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010715	CAT	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010715	AAC	2	6	2259	2264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010715	GCA	2	6	2305	2310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010715	CTG	2	6	2372	2377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010715	TGT	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010715	TCT	3	9	2650	2658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010715	GCT	3	9	2785	2793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010715	TCA	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010715	ATC	2	6	3021	3026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010715	TTC	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010715	ATT	2	6	3075	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010715	TAC	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010715	CTT	2	6	3254	3259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010715	TTC	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010715	GTA	2	6	3349	3354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010715	ATC	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010715	TCA	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010715	AAT	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010715	CTT	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010715	TCT	2	6	3595	3600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010715	TCA	2	6	3739	3744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010715	TTC	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010715	AAG	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010715	GTA	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010715	ACA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010715	ACA	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010715	TTC	2	6	4053	4058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010715	AGG	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010715	TTG	2	6	4349	4354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010715	ATT	2	6	4500	4505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010715	AGT	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010715	CTA	2	6	4676	4681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010715	TCA	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010715	TTG	2	6	4857	4862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010715	CTT	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584628
67	NC_010715	CCA	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584628
68	NC_010715	AGC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584628
69	NC_010715	TAT	3	9	5093	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584628
70	NC_010715	CTT	2	6	5114	5119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584628
71	NC_010715	TCT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584628
72	NC_010715	TCT	2	6	5299	5304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584629
73	NC_010715	TAC	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584629
74	NC_010715	ATT	2	6	5354	5359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584629
75	NC_010715	GCT	2	6	5372	5377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584629
76	NC_010715	TAG	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584629
77	NC_010715	ACA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584629
78	NC_010715	GGT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584629
79	NC_010715	TAA	2	6	5620	5625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584629
80	NC_010715	CAG	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584629
81	NC_010715	TTG	2	6	5794	5799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584629
82	NC_010715	ATA	2	6	5865	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584629
83	NC_010715	CTC	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584629
84	NC_010715	GTA	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584629
85	NC_010715	CCT	2	6	5954	5959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_010715	CTG	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010715	CTT	2	6	6014	6019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010715	AAT	2	6	6058	6063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010715	GAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584630
90	NC_010715	TTG	2	6	6250	6255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584630
91	NC_010715	GAT	2	6	6381	6386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584630
92	NC_010715	GTG	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584630
93	NC_010715	TAT	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584630
94	NC_010715	TGA	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584630
95	NC_010715	GAG	3	9	6498	6506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188584630
96	NC_010715	AGA	2	6	6548	6553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584630
97	NC_010715	AGA	2	6	6572	6577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584630
98	NC_010715	GAT	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584630
99	NC_010715	TGG	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584630
100	NC_010715	TAA	2	6	6615	6620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584630
101	NC_010715	ACC	2	6	6631	6636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010715	CAC	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584631
103	NC_010715	GTT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584631
104	NC_010715	ATG	2	6	7051	7056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010715	ACC	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010715	ATA	2	6	7199	7204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010715	TAT	2	6	7598	7603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584632
108	NC_010715	CAG	2	6	7864	7869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584632
109	NC_010715	TTC	2	6	7967	7972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
110	NC_010715	AAT	2	6	8008	8013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584632
111	NC_010715	TAC	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584632
112	NC_010715	GTT	2	6	8128	8133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584632
113	NC_010715	GAA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584632
114	NC_010715	TAC	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584632
115	NC_010715	TCT	2	6	8367	8372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
116	NC_010715	TGA	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584632
117	NC_010715	TAT	2	6	8513	8518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584632
118	NC_010715	AAC	2	6	8560	8565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584632
119	NC_010715	CTT	2	6	8731	8736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
120	NC_010715	AGC	2	6	8865	8870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584632
121	NC_010715	TCT	2	6	9045	9050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
122	NC_010715	CTC	2	6	9079	9084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584632
123	NC_010715	TAT	2	6	9098	9103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584632
124	NC_010715	TTC	2	6	9164	9169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
125	NC_010715	ATC	2	6	9173	9178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584632
126	NC_010715	CTG	2	6	9482	9487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584632
127	NC_010715	CCT	2	6	9502	9507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010715	ATA	2	6	9615	9620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010715	CTA	2	6	9685	9690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010715	CAT	2	6	9935	9940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584633
131	NC_010715	CAT	2	6	9943	9948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584633
132	NC_010715	TCT	3	9	9963	9971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584633
133	NC_010715	AAC	2	6	10182	10187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584633
134	NC_010715	CCT	2	6	10248	10253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_010715	TAT	2	6	10332	10337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584634
136	NC_010715	CCA	2	6	10361	10366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584634
137	NC_010715	TCT	2	6	10449	10454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584634
138	NC_010715	GAT	2	6	10477	10482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584634
139	NC_010715	GTT	2	6	10510	10515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584634
140	NC_010715	CTT	2	6	10516	10521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584634
141	NC_010715	TTC	2	6	10541	10546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584634
142	NC_010715	CGT	2	6	10678	10683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584634
143	NC_010715	TCC	2	6	10893	10898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584634
144	NC_010715	AAT	2	6	11007	11012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584635
145	NC_010715	TTC	2	6	11084	11089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584635
146	NC_010715	GTT	2	6	11115	11120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584635
147	NC_010715	AGC	2	6	11123	11128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584635
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149	NC_010715	TAT	2	6	11244	11249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584635
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151	NC_010715	TGT	2	6	11498	11503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010715	TGT	2	6	11511	11516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010715	GTA	2	6	11590	11595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584636
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159	NC_010715	CTT	2	6	12136	12141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584636
160	NC_010715	CTT	2	6	12163	12168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584636
161	NC_010715	TTA	2	6	12186	12191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584636
162	NC_010715	TGA	2	6	12237	12242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584636
163	NC_010715	TGA	2	6	12278	12283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584636
164	NC_010715	TTG	2	6	12298	12303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584636
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167	NC_010715	CCT	2	6	12521	12526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_010715	TGT	2	6	12652	12657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010715	TAC	2	6	13049	13054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_010715	ACA	2	6	13108	13113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_010715	TGA	2	6	13287	13292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010715	GTT	2	6	13294	13299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010715	TGT	2	6	13332	13337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010715	TTG	2	6	13414	13419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_010715	TTG	2	6	13605	13610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_010715	TAT	2	6	13940	13945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584637
183	NC_010715	CTA	2	6	13957	13962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584637
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186	NC_010715	ATT	2	6	14095	14100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584638
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232	NC_010715	TTA	2	6	16796	16801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_010715	TTA	2	6	16808	16813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_010715	ATA	2	6	17029	17034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_010715	ATT	2	6	17105	17110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_010715	TTA	2	6	17133	17138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_010715	TTC	3	9	17199	17207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.