MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF plasmid pNTHE01

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010715	CTT	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584628
2	NC_010715	CCA	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584628
3	NC_010715	AGC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584628
4	NC_010715	TAT	3	9	5093	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584628
5	NC_010715	CTT	2	6	5114	5119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584628
6	NC_010715	TCT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584628
7	NC_010715	TCT	2	6	5299	5304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584629
8	NC_010715	TAC	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584629
9	NC_010715	ATT	2	6	5354	5359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584629
10	NC_010715	GCT	2	6	5372	5377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584629
11	NC_010715	TAG	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584629
12	NC_010715	ACA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584629
13	NC_010715	GGT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584629
14	NC_010715	TAA	2	6	5620	5625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584629
15	NC_010715	CAG	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584629
16	NC_010715	TTG	2	6	5794	5799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584629
17	NC_010715	ATA	2	6	5865	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584629
18	NC_010715	CTC	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584629
19	NC_010715	GTA	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584629
20	NC_010715	GAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584630
21	NC_010715	TTG	2	6	6250	6255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584630
22	NC_010715	GAT	2	6	6381	6386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584630
23	NC_010715	GTG	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584630
24	NC_010715	TAT	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584630
25	NC_010715	TGA	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584630
26	NC_010715	GAG	3	9	6498	6506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188584630
27	NC_010715	AGA	2	6	6548	6553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584630
28	NC_010715	AGA	2	6	6572	6577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584630
29	NC_010715	GAT	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584630
30	NC_010715	TGG	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584630
31	NC_010715	TAA	2	6	6615	6620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584630
32	NC_010715	CAC	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584631
33	NC_010715	GTT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584631
34	NC_010715	TAT	2	6	7598	7603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584632
35	NC_010715	CAG	2	6	7864	7869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584632
36	NC_010715	TTC	2	6	7967	7972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
37	NC_010715	AAT	2	6	8008	8013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584632
38	NC_010715	TAC	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584632
39	NC_010715	GTT	2	6	8128	8133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584632
40	NC_010715	GAA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584632
41	NC_010715	TAC	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584632
42	NC_010715	TCT	2	6	8367	8372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
43	NC_010715	TGA	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584632
44	NC_010715	TAT	2	6	8513	8518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584632
45	NC_010715	AAC	2	6	8560	8565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584632
46	NC_010715	CTT	2	6	8731	8736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
47	NC_010715	AGC	2	6	8865	8870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584632
48	NC_010715	TCT	2	6	9045	9050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
49	NC_010715	CTC	2	6	9079	9084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584632
50	NC_010715	TAT	2	6	9098	9103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584632
51	NC_010715	TTC	2	6	9164	9169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
52	NC_010715	ATC	2	6	9173	9178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584632
53	NC_010715	CTG	2	6	9482	9487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584632
54	NC_010715	CAT	2	6	9935	9940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584633
55	NC_010715	CAT	2	6	9943	9948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584633
56	NC_010715	TCT	3	9	9963	9971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584633
57	NC_010715	AAC	2	6	10182	10187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584633
58	NC_010715	TAT	2	6	10332	10337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584634
59	NC_010715	CCA	2	6	10361	10366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584634
60	NC_010715	TCT	2	6	10449	10454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584634
61	NC_010715	GAT	2	6	10477	10482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584634
62	NC_010715	GTT	2	6	10510	10515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584634
63	NC_010715	CTT	2	6	10516	10521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584634
64	NC_010715	TTC	2	6	10541	10546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584634
65	NC_010715	CGT	2	6	10678	10683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584634
66	NC_010715	TCC	2	6	10893	10898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584634
67	NC_010715	AAT	2	6	11007	11012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584635
68	NC_010715	TTC	2	6	11084	11089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584635
69	NC_010715	GTT	2	6	11115	11120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584635
70	NC_010715	AGC	2	6	11123	11128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584635
71	NC_010715	AGA	2	6	11155	11160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584635
72	NC_010715	TAT	2	6	11244	11249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584635
73	NC_010715	CTT	2	6	11451	11456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584635
74	NC_010715	GTA	2	6	11590	11595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584636
75	NC_010715	TCT	2	6	11631	11636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584636
76	NC_010715	TGC	2	6	11731	11736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584636
77	NC_010715	TTG	2	6	11793	11798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584636
78	NC_010715	GAC	2	6	12019	12024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584636
79	NC_010715	TCT	2	6	12093	12098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584636
80	NC_010715	CTT	2	6	12136	12141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584636
81	NC_010715	CTT	2	6	12163	12168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584636
82	NC_010715	TTA	2	6	12186	12191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584636
83	NC_010715	TGA	2	6	12237	12242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584636
84	NC_010715	TGA	2	6	12278	12283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584636
85	NC_010715	TTG	2	6	12298	12303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584636
86	NC_010715	TCA	2	6	12390	12395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584636
87	NC_010715	GTT	3	9	12487	12495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584636
88	NC_010715	CTA	2	6	13638	13643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584637
89	NC_010715	TTA	2	6	13737	13742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584637
90	NC_010715	GTA	2	6	13775	13780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584637
91	NC_010715	ATC	2	6	13808	13813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584637
92	NC_010715	GTA	2	6	13867	13872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584637
93	NC_010715	TAT	2	6	13895	13900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584637
94	NC_010715	TAT	2	6	13940	13945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584637
95	NC_010715	CTA	2	6	13957	13962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584637
96	NC_010715	TTC	2	6	14024	14029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584637
97	NC_010715	ATT	2	6	14095	14100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584638
98	NC_010715	TAT	2	6	14120	14125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584638
99	NC_010715	CAT	2	6	14165	14170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584638
100	NC_010715	CAC	2	6	14186	14191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584638
101	NC_010715	TCC	2	6	14208	14213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584638
102	NC_010715	TCT	2	6	14290	14295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584638
103	NC_010715	CTT	2	6	14354	14359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584638
104	NC_010715	GTA	2	6	14368	14373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584638
105	NC_010715	CTA	2	6	14375	14380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584638
106	NC_010715	TCT	2	6	14392	14397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584638
107	NC_010715	GTT	2	6	14407	14412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584638
108	NC_010715	CTT	3	9	14447	14455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584638
109	NC_010715	TTC	2	6	14499	14504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584638
110	NC_010715	ATA	2	6	14539	14544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584638
111	NC_010715	CTA	2	6	14546	14551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584638
112	NC_010715	TTC	2	6	14566	14571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584638
113	NC_010715	ATA	2	6	14575	14580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584638
114	NC_010715	ATA	2	6	14660	14665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584639
115	NC_010715	ACT	2	6	14670	14675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584639
116	NC_010715	TCG	2	6	14989	14994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584640
117	NC_010715	ATT	2	6	15209	15214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584640
118	NC_010715	TAA	2	6	15215	15220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584640
119	NC_010715	TAC	2	6	15272	15277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584640
120	NC_010715	ATA	2	6	15545	15550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584640
121	NC_010715	ATT	2	6	15551	15556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584640
122	NC_010715	TTC	2	6	16061	16066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584641
123	NC_010715	ACC	2	6	16185	16190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584641
124	NC_010715	TCA	2	6	16230	16235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584641
125	NC_010715	TTC	2	6	16253	16258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584641
126	NC_010715	TAA	2	6	16287	16292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584641
127	NC_010715	ATA	2	6	16360	16365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584641
128	NC_010715	ATT	2	6	16379	16384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584641
129	NC_010715	TAC	2	6	16424	16429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584641
130	NC_010715	TAT	2	6	16465	16470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584641
131	NC_010715	TCA	2	6	16503	16508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584641
132	NC_010715	AGT	2	6	16644	16649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584641
133	NC_010715	AGA	2	6	16688	16693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584641
134	NC_010715	CTT	2	6	16711	16716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584641

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.