MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF plasmid pNTHE01

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010715	TA	3	6	208	213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010715	AT	3	6	745	750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010715	TA	3	6	829	834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010715	TC	3	6	1377	1382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010715	TA	3	6	1791	1796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010715	TC	3	6	1857	1862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010715	TA	3	6	2124	2129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010715	TC	3	6	2966	2971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010715	AT	3	6	3823	3828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010715	TC	3	6	4566	4571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010715	AT	3	6	4736	4741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010715	CT	3	6	4815	4820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010715	AT	3	6	4972	4977	50 %	50 %	0 %	0 %	188584628
14	NC_010715	TA	3	6	5578	5583	50 %	50 %	0 %	0 %	188584629
15	NC_010715	TA	3	6	5869	5874	50 %	50 %	0 %	0 %	188584629
16	NC_010715	TA	3	6	5986	5991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010715	AT	3	6	6812	6817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010715	AT	3	6	7329	7334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010715	TC	3	6	7361	7366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010715	AT	3	6	8105	8110	50 %	50 %	0 %	0 %	188584632
21	NC_010715	TA	3	6	8213	8218	50 %	50 %	0 %	0 %	188584632
22	NC_010715	AT	3	6	8394	8399	50 %	50 %	0 %	0 %	188584632
23	NC_010715	TA	3	6	8669	8674	50 %	50 %	0 %	0 %	188584632
24	NC_010715	TC	3	6	8676	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	188584632
25	NC_010715	TA	3	6	9552	9557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010715	AG	3	6	9631	9636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010715	CT	3	6	9670	9675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010715	TC	3	6	10062	10067	0 %	50 %	0 %	50 %	188584633
29	NC_010715	TA	3	6	10240	10245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010715	AT	3	6	10776	10781	50 %	50 %	0 %	0 %	188584634
31	NC_010715	TA	3	6	10805	10810	50 %	50 %	0 %	0 %	188584634
32	NC_010715	CT	3	6	11912	11917	0 %	50 %	0 %	50 %	188584636
33	NC_010715	CT	3	6	12421	12426	0 %	50 %	0 %	50 %	188584636
34	NC_010715	AC	3	6	13449	13454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010715	CA	3	6	13474	13479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010715	TA	3	6	14780	14785	50 %	50 %	0 %	0 %	188584639
37	NC_010715	AT	3	6	14976	14981	50 %	50 %	0 %	0 %	188584640
38	NC_010715	TA	3	6	14983	14988	50 %	50 %	0 %	0 %	188584640
39	NC_010715	CT	3	6	15140	15145	0 %	50 %	0 %	50 %	188584640
40	NC_010715	AG	3	6	15188	15193	50 %	0 %	50 %	0 %	188584640
41	NC_010715	AT	3	6	15560	15565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010715	GC	3	6	16265	16270	0 %	0 %	50 %	50 %	188584641
43	NC_010715	CT	3	6	16442	16447	0 %	50 %	0 %	50 %	188584641
44	NC_010715	TA	3	6	16889	16894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010715	TA	3	6	16994	16999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010715	TA	3	6	17192	17197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.