MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET45

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010699	TGGTT	2	10	507	516	0 %	60 %	40 %	0 %	188535955
2	NC_010699	CGCTG	2	10	695	704	0 %	20 %	40 %	40 %	188535955
3	NC_010699	GGGGC	2	10	1672	1681	0 %	0 %	80 %	20 %	188535958
4	NC_010699	GAAAA	2	10	3712	3721	80 %	0 %	20 %	0 %	188535961
5	NC_010699	GTCAG	2	10	6075	6084	20 %	20 %	40 %	20 %	188535966
6	NC_010699	CCGGG	2	10	6129	6138	0 %	0 %	60 %	40 %	188535966
7	NC_010699	GCTGC	2	10	9991	10000	0 %	20 %	40 %	40 %	188535969
8	NC_010699	CAAAG	2	10	10993	11002	60 %	0 %	20 %	20 %	188535969
9	NC_010699	TGAGT	2	10	13706	13715	20 %	40 %	40 %	0 %	188535973
10	NC_010699	GTTTT	2	10	15814	15823	0 %	80 %	20 %	0 %	188535975
11	NC_010699	ACGGT	2	10	18638	18647	20 %	20 %	40 %	20 %	188535978
12	NC_010699	TTCAT	2	10	18886	18895	20 %	60 %	0 %	20 %	188535978
13	NC_010699	TACAG	2	10	18965	18974	40 %	20 %	20 %	20 %	188535978
14	NC_010699	CCGTT	2	10	19446	19455	0 %	40 %	20 %	40 %	188535978
15	NC_010699	AAGCC	2	10	22855	22864	40 %	0 %	20 %	40 %	188535980
16	NC_010699	AGAAC	2	10	24482	24491	60 %	0 %	20 %	20 %	188535981
17	NC_010699	CCCGG	2	10	25017	25026	0 %	0 %	40 %	60 %	188535981
18	NC_010699	CCGCA	2	10	26310	26319	20 %	0 %	20 %	60 %	188535982
19	NC_010699	GAAAA	2	10	27446	27455	80 %	0 %	20 %	0 %	188535982
20	NC_010699	GAAAT	2	10	28209	28218	60 %	20 %	20 %	0 %	188535982
21	NC_010699	GCCGT	2	10	28767	28776	0 %	20 %	40 %	40 %	188535982
22	NC_010699	ACAGC	2	10	30244	30253	40 %	0 %	20 %	40 %	188535982
23	NC_010699	CGCAG	2	10	31490	31499	20 %	0 %	40 %	40 %	188535983
24	NC_010699	GCCGG	2	10	31527	31536	0 %	0 %	60 %	40 %	188535983
25	NC_010699	GCGCC	2	10	32707	32716	0 %	0 %	40 %	60 %	188535984
26	NC_010699	GTCTG	2	10	34489	34498	0 %	40 %	40 %	20 %	188535985
27	NC_010699	ACGTG	2	10	34652	34661	20 %	20 %	40 %	20 %	188535986
28	NC_010699	AATGA	2	10	35957	35966	60 %	20 %	20 %	0 %	188535988
29	NC_010699	TGATT	2	10	37805	37814	20 %	60 %	20 %	0 %	188535992
30	NC_010699	CTGTC	2	10	38040	38049	0 %	40 %	20 %	40 %	188535993
31	NC_010699	GCTGG	2	10	39454	39463	0 %	20 %	60 %	20 %	188535994
32	NC_010699	GCATT	2	10	40638	40647	20 %	40 %	20 %	20 %	188535995
33	NC_010699	ATTTT	2	10	41865	41874	20 %	80 %	0 %	0 %	188535997
34	NC_010699	AACAC	2	10	42898	42907	60 %	0 %	0 %	40 %	188535998
35	NC_010699	AAGTG	2	10	43987	43996	40 %	20 %	40 %	0 %	188536000
36	NC_010699	GTCTG	2	10	44029	44038	0 %	40 %	40 %	20 %	188536000

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.