MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET45

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010699	GCAA	3	12	413	424	50 %	0 %	25 %	25 %	188535955
2	NC_010699	TGCG	2	8	746	753	0 %	25 %	50 %	25 %	188535955
3	NC_010699	GTTT	2	8	1510	1517	0 %	75 %	25 %	0 %	188535957
4	NC_010699	GAAA	2	8	1623	1630	75 %	0 %	25 %	0 %	188535958
5	NC_010699	ACGA	2	8	1693	1700	50 %	0 %	25 %	25 %	188535958
6	NC_010699	GGCT	2	8	1858	1865	0 %	25 %	50 %	25 %	188535959
7	NC_010699	CCTT	2	8	2141	2148	0 %	50 %	0 %	50 %	188535960
8	NC_010699	TGTA	2	8	3834	3841	25 %	50 %	25 %	0 %	188535962
9	NC_010699	GCGA	2	8	3923	3930	25 %	0 %	50 %	25 %	188535962
10	NC_010699	AGCA	2	8	4879	4886	50 %	0 %	25 %	25 %	188535963
11	NC_010699	GCTG	2	8	5207	5214	0 %	25 %	50 %	25 %	188535964
12	NC_010699	TTTA	2	8	5303	5310	25 %	75 %	0 %	0 %	188535964
13	NC_010699	TTAG	2	8	5595	5602	25 %	50 %	25 %	0 %	188535965
14	NC_010699	TGGC	2	8	5797	5804	0 %	25 %	50 %	25 %	188535965
15	NC_010699	CGGG	2	8	5824	5831	0 %	0 %	75 %	25 %	188535965
16	NC_010699	GTCA	2	8	6354	6361	25 %	25 %	25 %	25 %	188535966
17	NC_010699	CTGA	2	8	6563	6570	25 %	25 %	25 %	25 %	188535966
18	NC_010699	CCCA	2	8	7157	7164	25 %	0 %	0 %	75 %	188535967
19	NC_010699	TTCA	2	8	7265	7272	25 %	50 %	0 %	25 %	188535967
20	NC_010699	AGCG	2	8	7440	7447	25 %	0 %	50 %	25 %	188535967
21	NC_010699	AAGG	2	8	7539	7546	50 %	0 %	50 %	0 %	188535967
22	NC_010699	GGCA	2	8	7702	7709	25 %	0 %	50 %	25 %	188535967
23	NC_010699	AAAT	2	8	8742	8749	75 %	25 %	0 %	0 %	188535969
24	NC_010699	GAAA	2	8	8932	8939	75 %	0 %	25 %	0 %	188535969
25	NC_010699	GCAA	2	8	8965	8972	50 %	0 %	25 %	25 %	188535969
26	NC_010699	AATG	2	8	9739	9746	50 %	25 %	25 %	0 %	188535969
27	NC_010699	GGGC	2	8	10169	10176	0 %	0 %	75 %	25 %	188535969
28	NC_010699	CCGA	2	8	10689	10696	25 %	0 %	25 %	50 %	188535969
29	NC_010699	ATTT	2	8	11352	11359	25 %	75 %	0 %	0 %	188535970
30	NC_010699	ACGG	2	8	12002	12009	25 %	0 %	50 %	25 %	188535971
31	NC_010699	TCAA	2	8	12143	12150	50 %	25 %	0 %	25 %	188535971
32	NC_010699	GGGA	2	8	12657	12664	25 %	0 %	75 %	0 %	188535972
33	NC_010699	TTAA	2	8	12883	12890	50 %	50 %	0 %	0 %	188535972
34	NC_010699	GCAG	2	8	13424	13431	25 %	0 %	50 %	25 %	188535973
35	NC_010699	CCAG	2	8	13525	13532	25 %	0 %	25 %	50 %	188535973
36	NC_010699	ATCA	2	8	14195	14202	50 %	25 %	0 %	25 %	188535974
37	NC_010699	AACG	2	8	14328	14335	50 %	0 %	25 %	25 %	188535974
38	NC_010699	TACC	2	8	15111	15118	25 %	25 %	0 %	50 %	188535974
39	NC_010699	CAGT	2	8	15634	15641	25 %	25 %	25 %	25 %	188535974
40	NC_010699	AATA	2	8	15903	15910	75 %	25 %	0 %	0 %	188535975
41	NC_010699	TATG	2	8	16529	16536	25 %	50 %	25 %	0 %	188535975
42	NC_010699	CTTT	2	8	17000	17007	0 %	75 %	0 %	25 %	188535976
43	NC_010699	CAGA	2	8	17089	17096	50 %	0 %	25 %	25 %	188535976
44	NC_010699	TATG	2	8	18049	18056	25 %	50 %	25 %	0 %	188535977
45	NC_010699	TGAT	2	8	18149	18156	25 %	50 %	25 %	0 %	188535977
46	NC_010699	ATGA	2	8	19348	19355	50 %	25 %	25 %	0 %	188535978
47	NC_010699	CAGA	2	8	19402	19409	50 %	0 %	25 %	25 %	188535978
48	NC_010699	GCGG	2	8	19687	19694	0 %	0 %	75 %	25 %	188535978
49	NC_010699	TTAT	2	8	19854	19861	25 %	75 %	0 %	0 %	188535978
50	NC_010699	ATGA	2	8	20293	20300	50 %	25 %	25 %	0 %	188535978
51	NC_010699	CAGA	2	8	20731	20738	50 %	0 %	25 %	25 %	188535978
52	NC_010699	CCAG	2	8	20804	20811	25 %	0 %	25 %	50 %	188535978
53	NC_010699	AGCC	2	8	21040	21047	25 %	0 %	25 %	50 %	188535978
54	NC_010699	GGTG	2	8	21411	21418	0 %	25 %	75 %	0 %	188535978
55	NC_010699	GCAC	2	8	21752	21759	25 %	0 %	25 %	50 %	188535979
56	NC_010699	TGGT	2	8	21804	21811	0 %	50 %	50 %	0 %	188535979
57	NC_010699	AAAT	2	8	22164	22171	75 %	25 %	0 %	0 %	188535980
58	NC_010699	AGTC	2	8	22299	22306	25 %	25 %	25 %	25 %	188535980
59	NC_010699	TGCT	2	8	23080	23087	0 %	50 %	25 %	25 %	188535981
60	NC_010699	CGCT	2	8	24147	24154	0 %	25 %	25 %	50 %	188535981
61	NC_010699	GAAC	2	8	24446	24453	50 %	0 %	25 %	25 %	188535981
62	NC_010699	GCCT	2	8	24580	24587	0 %	25 %	25 %	50 %	188535981
63	NC_010699	CAGC	2	8	25060	25067	25 %	0 %	25 %	50 %	188535981
64	NC_010699	CAAG	2	8	26098	26105	50 %	0 %	25 %	25 %	188535982
65	NC_010699	CGCC	2	8	26233	26240	0 %	0 %	25 %	75 %	188535982
66	NC_010699	GAGC	2	8	26986	26993	25 %	0 %	50 %	25 %	188535982
67	NC_010699	CACG	2	8	27080	27087	25 %	0 %	25 %	50 %	188535982
68	NC_010699	CGGG	2	8	27739	27746	0 %	0 %	75 %	25 %	188535982
69	NC_010699	GTTC	2	8	28462	28469	0 %	50 %	25 %	25 %	188535982
70	NC_010699	ACTC	2	8	28638	28645	25 %	25 %	0 %	50 %	188535982
71	NC_010699	CGAC	2	8	28786	28793	25 %	0 %	25 %	50 %	188535982
72	NC_010699	GATC	2	8	29569	29576	25 %	25 %	25 %	25 %	188535982
73	NC_010699	GCCA	2	8	29855	29862	25 %	0 %	25 %	50 %	188535982
74	NC_010699	GGCA	2	8	30163	30170	25 %	0 %	50 %	25 %	188535982
75	NC_010699	ACCG	2	8	30580	30587	25 %	0 %	25 %	50 %	188535982
76	NC_010699	GCCT	2	8	31125	31132	0 %	25 %	25 %	50 %	188535982
77	NC_010699	GCAA	2	8	31953	31960	50 %	0 %	25 %	25 %	188535983
78	NC_010699	CACG	2	8	32850	32857	25 %	0 %	25 %	50 %	188535984
79	NC_010699	CGTG	2	8	32970	32977	0 %	25 %	50 %	25 %	188535984
80	NC_010699	GGCG	2	8	33000	33007	0 %	0 %	75 %	25 %	188535984
81	NC_010699	ACGG	2	8	34537	34544	25 %	0 %	50 %	25 %	188535985
82	NC_010699	AGAA	2	8	36239	36246	75 %	0 %	25 %	0 %	188535989
83	NC_010699	ATAA	2	8	36265	36272	75 %	25 %	0 %	0 %	188535989
84	NC_010699	GCCA	2	8	37555	37562	25 %	0 %	25 %	50 %	188535992
85	NC_010699	ACGG	2	8	37711	37718	25 %	0 %	50 %	25 %	188535992
86	NC_010699	TCGC	2	8	38393	38400	0 %	25 %	25 %	50 %	188535993
87	NC_010699	ACCG	2	8	38435	38442	25 %	0 %	25 %	50 %	188535993
88	NC_010699	TATT	2	8	39423	39430	25 %	75 %	0 %	0 %	188535994
89	NC_010699	CACG	2	8	39613	39620	25 %	0 %	25 %	50 %	188535994
90	NC_010699	TTCC	2	8	39622	39629	0 %	50 %	0 %	50 %	188535994
91	NC_010699	GAAG	2	8	39892	39899	50 %	0 %	50 %	0 %	188535994
92	NC_010699	CCTG	2	8	39987	39994	0 %	25 %	25 %	50 %	188535994
93	NC_010699	CTGC	2	8	40143	40150	0 %	25 %	25 %	50 %	188535994
94	NC_010699	CGCA	2	8	40275	40282	25 %	0 %	25 %	50 %	188535994
95	NC_010699	CATC	2	8	40980	40987	25 %	25 %	0 %	50 %	188535996
96	NC_010699	CGCC	2	8	40999	41006	0 %	0 %	25 %	75 %	188535996
97	NC_010699	GGCT	2	8	41036	41043	0 %	25 %	50 %	25 %	188535996
98	NC_010699	GACG	2	8	41791	41798	25 %	0 %	50 %	25 %	188535997
99	NC_010699	CTAA	2	8	42871	42878	50 %	25 %	0 %	25 %	188535998
100	NC_010699	ACTT	2	8	43011	43018	25 %	50 %	0 %	25 %	188535999
101	NC_010699	TGCC	2	8	43123	43130	0 %	25 %	25 %	50 %	188535999
102	NC_010699	ATGG	2	8	43167	43174	25 %	25 %	50 %	0 %	188535999
103	NC_010699	GAAA	2	8	43364	43371	75 %	0 %	25 %	0 %	188535999
104	NC_010699	GAAA	2	8	43532	43539	75 %	0 %	25 %	0 %	188535999
105	NC_010699	CCGC	2	8	43618	43625	0 %	0 %	25 %	75 %	188535999

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.