MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010698	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	188526816
2	NC_010698	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188526818
3	NC_010698	GAAACC	2	12	7474	7485	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	188526820
4	NC_010698	AGAAAA	2	12	18414	18425	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188526830
5	NC_010698	GATAAA	2	12	21976	21987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188526833
6	NC_010698	TTTTAG	2	12	28950	28961	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188526839
7	NC_010698	CATGAA	2	12	30283	30294	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188526842
8	NC_010698	GCGTGG	2	12	30860	30871	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	188526843
9	NC_010698	TTGGAT	2	12	30970	30981	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	188526843
10	NC_010698	TTGAAT	2	12	32053	32064	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188526843
11	NC_010698	TAAGGA	2	12	32352	32363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188526843
12	NC_010698	TAGGGG	2	12	33864	33875	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	188526846
13	NC_010698	AAAGAA	2	12	35374	35385	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188526847
14	NC_010698	GCCTTA	2	12	42316	42327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	188526856
15	NC_010698	CGCAAA	2	12	43107	43118	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	188526856
16	NC_010698	TGAAAT	2	12	49095	49106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188526862
17	NC_010698	TAAAAA	2	12	51247	51258	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188526864
18	NC_010698	GAAAAA	2	12	56290	56301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188526869
19	NC_010698	ACGCCC	2	12	66170	66181	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	188526880
20	NC_010698	TAAGGG	2	12	68889	68900	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	188526883
21	NC_010698	CGCTAA	2	12	69252	69263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188526883
22	NC_010698	CGCCCA	2	12	69426	69437	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	188526883
23	NC_010698	GCGCAT	2	12	71936	71947	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	188526886
24	NC_010698	GGCATG	2	12	72254	72265	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188526886
25	NC_010698	GCAACG	2	12	73302	73313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188526886
26	NC_010698	AAACAT	2	12	85590	85601	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188526898
27	NC_010698	ATTAGA	2	12	85889	85900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188526898
28	NC_010698	GATTTT	2	12	87643	87654	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188526901
29	NC_010698	AAACTC	2	12	87760	87771	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	188526901
30	NC_010698	TCAAAA	2	12	89225	89236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188526902
31	NC_010698	GCGGTG	2	12	89923	89934	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	188526903
32	NC_010698	TTAATT	2	12	90458	90469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526903
33	NC_010698	TTCCAC	2	12	96241	96252	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	188526908
34	NC_010698	AGCGTT	2	12	99741	99752	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	188526909
35	NC_010698	GGAGCG	2	12	103806	103817	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	188526913
36	NC_010698	TTTTCT	2	12	105306	105317	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188526914
37	NC_010698	GCAAGC	2	12	105713	105724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188526914
38	NC_010698	CGCTCG	2	12	110336	110347	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	188526919
39	NC_010698	TAGGCA	2	12	112873	112884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188526920
40	NC_010698	CTTCTA	2	12	115208	115219	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188526922
41	NC_010698	GTTCTA	2	12	115619	115630	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188526922
42	NC_010698	CTTCTA	2	12	116730	116741	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188526923
43	NC_010698	GTTCTA	2	12	116904	116915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188526923
44	NC_010698	CTAAGG	2	12	118221	118232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188526924
45	NC_010698	TGAATT	2	12	118755	118766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188526924
46	NC_010698	AGCAAA	2	12	122262	122273	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188526927
47	NC_010698	TCATGA	2	12	125052	125063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188526932
48	NC_010698	AAAAAT	2	12	131593	131604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188526939
49	NC_010698	ATCCTT	2	12	132286	132297	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188526940
50	NC_010698	ATTCAA	2	12	132678	132689	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188526941
51	NC_010698	TAGCGA	2	12	133734	133745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188526942
52	NC_010698	TTAGCG	2	12	136626	136637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	188526944
53	NC_010698	TATCGC	2	12	136838	136849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	188526944
54	NC_010698	ATCGCT	2	12	138546	138557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	188526945
55	NC_010698	CCTAAA	2	12	140769	140780	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	188526947
56	NC_010698	TTCTAT	2	12	141929	141940	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188526948
57	NC_010698	TTGTTT	2	12	144917	144928	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	188526953
58	NC_010698	CTTGGG	2	12	145578	145589	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	188526955
59	NC_010698	GAATCT	2	12	147077	147088	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188526957
60	NC_010698	TTGGGT	2	12	150357	150368	0 %	50 %	50 %	0 %	188526960
61	NC_010698	GATTTT	2	12	150869	150880	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188526961
62	NC_010698	GATGGC	2	12	154087	154098	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188526965
63	NC_010698	GATGGC	2	12	154195	154206	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188526965
64	NC_010698	CTTTCT	2	12	154339	154350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526965
65	NC_010698	CCGCTC	2	12	156329	156340	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	188526968
66	NC_010698	GCTCTC	2	12	158756	158767	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	188526970
67	NC_010698	TTCTAA	2	12	161078	161089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188526973
68	NC_010698	TCAATA	2	12	162760	162771	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188526975
69	NC_010698	CATTTT	2	12	162869	162880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188526975
70	NC_010698	ATCGTT	2	12	163182	163193	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188526975
71	NC_010698	AATTTC	2	12	163533	163544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188526976
72	NC_010698	TAAAAT	2	12	165057	165068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526977
73	NC_010698	ATTTTG	2	12	166868	166879	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188526979
74	NC_010698	AAAGAG	2	12	166888	166899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526979
75	NC_010698	GTTTAA	2	12	168130	168141	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188526980
76	NC_010698	CCGCTC	2	12	171191	171202	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	188526984
77	NC_010698	GAAAAA	2	12	174834	174845	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188526988
78	NC_010698	AGGCAT	2	12	174923	174934	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188526988
79	NC_010698	GCATTT	2	12	176636	176647	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188526990
80	NC_010698	TCAAAC	2	12	177203	177214	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	188526991
81	NC_010698	ATAAAG	2	12	177370	177381	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188526991
82	NC_010698	GGTATT	2	12	181147	181158	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	188526995
83	NC_010698	TCTAAA	2	12	181377	181388	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188526995
84	NC_010698	TGGGCA	2	12	182446	182457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188526996
85	NC_010698	TTCTAA	2	12	182925	182936	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188526997
86	NC_010698	ATTTTC	2	12	184870	184881	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188526997
87	NC_010698	TGGGGC	2	12	192270	192281	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	188527007
88	NC_010698	AAATCC	2	12	193701	193712	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	188527009
89	NC_010698	ATTCTA	2	12	204322	204333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	188527016
90	NC_010698	CATAGC	2	12	206063	206074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188527017
91	NC_010698	GTTTTG	2	12	206568	206579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188527017
92	NC_010698	TTATTT	2	12	208200	208211	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	188527018
93	NC_010698	TAAAGA	2	12	211742	211753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188527022
94	NC_010698	AGGCTA	2	12	214577	214588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188527026
95	NC_010698	AATGCC	2	12	219048	219059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188527031
96	NC_010698	GCTGTA	2	12	221611	221622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	188527033
97	NC_010698	GTGCTA	2	12	223235	223246	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	188527034
98	NC_010698	GGTGAT	2	12	223294	223305	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	188527034
99	NC_010698	TCAATA	2	12	223720	223731	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188527035
100	NC_010698	CACGCC	2	12	224200	224211	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	188527035
101	NC_010698	GCTTTG	2	12	225438	225449	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	188527036
102	NC_010698	GCTAGG	2	12	226819	226830	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188527037
103	NC_010698	TGGAGG	2	12	227367	227378	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	188527038
104	NC_010698	TCTTTA	2	12	233173	233184	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188527045
105	NC_010698	GTTTTT	2	12	238809	238820	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	188527052
106	NC_010698	ATTGTC	2	12	241969	241980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188527055
107	NC_010698	TCCCGC	2	12	244152	244163	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	188527057
108	NC_010698	TCCCGC	2	12	244965	244976	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	188527057
109	NC_010698	CAAAGC	2	12	246454	246465	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	188527059
110	NC_010698	TTGGGG	2	12	247187	247198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188527060
111	NC_010698	TTTAGC	2	12	248188	248199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188527061
112	NC_010698	TGAGCG	2	12	252817	252828	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188527066
113	NC_010698	GGGGCT	2	12	258421	258432	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	188527070
114	NC_010698	TGGAAA	2	12	258833	258844	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188527070
115	NC_010698	TGAGCG	2	12	262974	262985	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188527073
116	NC_010698	GATTTT	2	12	267657	267668	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188527080
117	NC_010698	ATTAGA	2	12	267779	267790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188527080
118	NC_010698	TAAAGA	2	12	269096	269107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188527081
119	NC_010698	CCGAAC	2	12	269326	269337	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	188527081
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122	NC_010698	AAATCA	2	12	270560	270571	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188527084
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345	NC_010698	AATTAA	2	12	740062	740073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188527541
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457	NC_010698	AAAGAG	2	12	1041898	1041909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188527813
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459	NC_010698	CGGATG	2	12	1043927	1043938	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188527815
460	NC_010698	CTTTTT	2	12	1048265	1048276	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188527820
461	NC_010698	CTTTTT	2	12	1055835	1055846	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	188527826
462	NC_010698	CAAATC	2	12	1056382	1056393	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	188527826
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465	NC_010698	AAATGC	2	12	1061732	1061743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188527831
466	NC_010698	CTTTAG	2	12	1061916	1061927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188527831
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