MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 1303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010698	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	188526815
2	NC_010698	GAAAC	2	10	4653	4662	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010698	TTTTA	2	10	4923	4932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010698	GTCGT	2	10	6501	6510	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010698	TTTCT	2	10	8138	8147	0 %	80 %	0 %	20 %	188526820
6	NC_010698	TTGAA	2	10	11649	11658	40 %	40 %	20 %	0 %	188526823
7	NC_010698	TTTTG	2	10	11665	11674	0 %	80 %	20 %	0 %	188526823
8	NC_010698	TGGTG	2	10	12503	12512	0 %	40 %	60 %	0 %	188526825
9	NC_010698	GCTTT	2	10	13330	13339	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010698	CAAAA	2	10	18379	18388	80 %	0 %	0 %	20 %	188526830
11	NC_010698	CATCA	2	10	19755	19764	40 %	20 %	0 %	40 %	188526831
12	NC_010698	TGAAA	2	10	20723	20732	60 %	20 %	20 %	0 %	188526832
13	NC_010698	AAAAG	2	10	22739	22748	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010698	CCATG	2	10	22914	22923	20 %	20 %	20 %	40 %	188526834
15	NC_010698	CTCTT	2	10	22944	22953	0 %	60 %	0 %	40 %	188526834
16	NC_010698	CAAGC	2	10	27546	27555	40 %	0 %	20 %	40 %	188526837
17	NC_010698	TTTTA	2	10	28476	28485	20 %	80 %	0 %	0 %	188526838
18	NC_010698	GATAA	2	10	30556	30565	60 %	20 %	20 %	0 %	188526842
19	NC_010698	GTGGG	2	10	32015	32024	0 %	20 %	80 %	0 %	188526843
20	NC_010698	TGGGG	2	10	33266	33275	0 %	20 %	80 %	0 %	188526845
21	NC_010698	TGTGT	2	10	35177	35186	0 %	60 %	40 %	0 %	188526847
22	NC_010698	AAGCC	2	10	39028	39037	40 %	0 %	20 %	40 %	188526852
23	NC_010698	AGAAA	2	10	40341	40350	80 %	0 %	20 %	0 %	188526853
24	NC_010698	TAAAA	2	10	43042	43051	80 %	20 %	0 %	0 %	188526856
25	NC_010698	TCCCA	2	10	44054	44063	20 %	20 %	0 %	60 %	188526857
26	NC_010698	GCTCC	2	10	44375	44384	0 %	20 %	20 %	60 %	188526857
27	NC_010698	TCGCA	2	10	44912	44921	20 %	20 %	20 %	40 %	188526857
28	NC_010698	AGGCT	2	10	46799	46808	20 %	20 %	40 %	20 %	188526859
29	NC_010698	TGCCT	2	10	47174	47183	0 %	40 %	20 %	40 %	188526859
30	NC_010698	TAAAA	2	10	49363	49372	80 %	20 %	0 %	0 %	188526862
31	NC_010698	TGAAA	2	10	50166	50175	60 %	20 %	20 %	0 %	188526864
32	NC_010698	TCGCC	2	10	53163	53172	0 %	20 %	20 %	60 %	188526865
33	NC_010698	TAAAA	2	10	53459	53468	80 %	20 %	0 %	0 %	188526865
34	NC_010698	TCAAA	2	10	54175	54184	60 %	20 %	0 %	20 %	188526865
35	NC_010698	TTAAA	2	10	55196	55205	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010698	ACAAA	2	10	55225	55234	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010698	AAAGA	2	10	55823	55832	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010698	CGATC	2	10	57488	57497	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010698	AATGA	2	10	57570	57579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010698	GCGTT	2	10	60645	60654	0 %	40 %	40 %	20 %	188526873
41	NC_010698	TCAAT	2	10	61499	61508	40 %	40 %	0 %	20 %	188526874
42	NC_010698	TGCCT	2	10	62415	62424	0 %	40 %	20 %	40 %	188526875
43	NC_010698	TCCAA	2	10	62827	62836	40 %	20 %	0 %	40 %	188526876
44	NC_010698	TTTTA	2	10	66095	66104	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010698	TTTTG	2	10	66126	66135	0 %	80 %	20 %	0 %	188526880
46	NC_010698	ACGCC	2	10	66432	66441	20 %	0 %	20 %	60 %	188526880
47	NC_010698	AAAGC	2	10	67198	67207	60 %	0 %	20 %	20 %	188526881
48	NC_010698	TTACA	2	10	67980	67989	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010698	ATCTT	2	10	75246	75255	20 %	60 %	0 %	20 %	188526888
50	NC_010698	TGGCT	2	10	75787	75796	0 %	40 %	40 %	20 %	188526888
51	NC_010698	ATGCC	2	10	76203	76212	20 %	20 %	20 %	40 %	188526889
52	NC_010698	TTGAT	2	10	77127	77136	20 %	60 %	20 %	0 %	188526892
53	NC_010698	GGCGT	2	10	78941	78950	0 %	20 %	60 %	20 %	188526894
54	NC_010698	ATTTT	2	10	81969	81978	20 %	80 %	0 %	0 %	188526895
55	NC_010698	AGATA	2	10	82091	82100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010698	TAAAA	2	10	82160	82169	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010698	CTTTC	2	10	82442	82451	0 %	60 %	0 %	40 %	188526896
58	NC_010698	TTTGA	2	10	85233	85242	20 %	60 %	20 %	0 %	188526898
59	NC_010698	TCTTT	2	10	85444	85453	0 %	80 %	0 %	20 %	188526898
60	NC_010698	GGCTT	2	10	86548	86557	0 %	40 %	40 %	20 %	188526899
61	NC_010698	CGGCA	2	10	89191	89200	20 %	0 %	40 %	40 %	188526902
62	NC_010698	AATTT	2	10	91222	91231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010698	ACGAT	2	10	91670	91679	40 %	20 %	20 %	20 %	188526904
64	NC_010698	TTTTC	2	10	91865	91874	0 %	80 %	0 %	20 %	188526904
65	NC_010698	AATTG	2	10	93521	93530	40 %	40 %	20 %	0 %	188526905
66	NC_010698	TCGTT	2	10	95321	95330	0 %	60 %	20 %	20 %	188526906
67	NC_010698	CAAAA	2	10	97913	97922	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010698	TCTTT	2	10	98631	98640	0 %	80 %	0 %	20 %	188526909
69	NC_010698	TTTAT	2	10	100401	100410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010698	AAAGC	2	10	101402	101411	60 %	0 %	20 %	20 %	188526911
71	NC_010698	GAATG	2	10	102623	102632	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010698	TGTCT	2	10	103433	103442	0 %	60 %	20 %	20 %	188526913
73	NC_010698	CAAAT	2	10	103826	103835	60 %	20 %	0 %	20 %	188526913
74	NC_010698	ACCCT	2	10	105255	105264	20 %	20 %	0 %	60 %	188526914
75	NC_010698	ATGCC	2	10	105387	105396	20 %	20 %	20 %	40 %	188526914
76	NC_010698	TTAAT	2	10	106773	106782	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010698	TGATT	2	10	107391	107400	20 %	60 %	20 %	0 %	188526916
78	NC_010698	GAATT	2	10	108026	108035	40 %	40 %	20 %	0 %	188526918
79	NC_010698	GGATC	2	10	111902	111911	20 %	20 %	40 %	20 %	188526920
80	NC_010698	GCAAT	2	10	113772	113781	40 %	20 %	20 %	20 %	188526921
81	NC_010698	AAGCC	2	10	113810	113819	40 %	0 %	20 %	40 %	188526921
82	NC_010698	GTTTG	2	10	115168	115177	0 %	60 %	40 %	0 %	188526922
83	NC_010698	CAATC	2	10	116101	116110	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_010698	GTTTG	2	10	116690	116699	0 %	60 %	40 %	0 %	188526923
85	NC_010698	TGATC	2	10	117169	117178	20 %	40 %	20 %	20 %	188526923
86	NC_010698	TTTGA	2	10	118240	118249	20 %	60 %	20 %	0 %	188526924
87	NC_010698	GACTT	2	10	118774	118783	20 %	40 %	20 %	20 %	188526924
88	NC_010698	ATCTC	2	10	119525	119534	20 %	40 %	0 %	40 %	188526924
89	NC_010698	CGCTT	2	10	119683	119692	0 %	40 %	20 %	40 %	188526924
90	NC_010698	TTTGT	2	10	120040	120049	0 %	80 %	20 %	0 %	188526925
91	NC_010698	TGCGT	2	10	122073	122082	0 %	40 %	40 %	20 %	188526927
92	NC_010698	GAAAA	2	10	122234	122243	80 %	0 %	20 %	0 %	188526927
93	NC_010698	GAAAA	2	10	122552	122561	80 %	0 %	20 %	0 %	188526927
94	NC_010698	ATTTT	2	10	125522	125531	20 %	80 %	0 %	0 %	188526933
95	NC_010698	ATGTT	2	10	125604	125613	20 %	60 %	20 %	0 %	188526933
96	NC_010698	AAAAG	2	10	126016	126025	80 %	0 %	20 %	0 %	188526933
97	NC_010698	TAGGG	2	10	127010	127019	20 %	20 %	60 %	0 %	188526934
98	NC_010698	AAATC	2	10	128276	128285	60 %	20 %	0 %	20 %	188526935
99	NC_010698	AAAAT	2	10	129748	129757	80 %	20 %	0 %	0 %	188526936
100	NC_010698	TTTTC	2	10	132098	132107	0 %	80 %	0 %	20 %	188526940
101	NC_010698	GTAAA	2	10	132650	132659	60 %	20 %	20 %	0 %	188526941
102	NC_010698	TTCTT	2	10	134054	134063	0 %	80 %	0 %	20 %	188526942
103	NC_010698	TCTTT	2	10	134548	134557	0 %	80 %	0 %	20 %	188526943
104	NC_010698	ACTTG	2	10	134761	134770	20 %	40 %	20 %	20 %	188526943
105	NC_010698	TTTTG	2	10	135711	135720	0 %	80 %	20 %	0 %	188526944
106	NC_010698	AATTC	2	10	136345	136354	40 %	40 %	0 %	20 %	188526944
107	NC_010698	GCGAT	2	10	136504	136513	20 %	20 %	40 %	20 %	188526944
108	NC_010698	GCTTG	2	10	136760	136769	0 %	40 %	40 %	20 %	188526944
109	NC_010698	TTTTG	2	10	137412	137421	0 %	80 %	20 %	0 %	188526945
110	NC_010698	CCAAA	2	10	139252	139261	60 %	0 %	0 %	40 %	188526946
111	NC_010698	ACGCC	2	10	142774	142783	20 %	0 %	20 %	60 %	188526948
112	NC_010698	TGATT	2	10	143679	143688	20 %	60 %	20 %	0 %	188526950
113	NC_010698	TTATT	2	10	144670	144679	20 %	80 %	0 %	0 %	188526952
114	NC_010698	GCGTT	2	10	145028	145037	0 %	40 %	40 %	20 %	188526954
115	NC_010698	CCCAG	2	10	145948	145957	20 %	0 %	20 %	60 %	188526955
116	NC_010698	CAAAT	2	10	147903	147912	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010698	AAAAC	2	10	148627	148636	80 %	0 %	0 %	20 %	188526958
118	NC_010698	AAGCC	2	10	151862	151871	40 %	0 %	20 %	40 %	188526963
119	NC_010698	GGGTG	2	10	154263	154272	0 %	20 %	80 %	0 %	188526965
120	NC_010698	CAAAA	2	10	155155	155164	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010698	ATTCA	2	10	155637	155646	40 %	40 %	0 %	20 %	188526967
122	NC_010698	AAAAC	2	10	157974	157983	80 %	0 %	0 %	20 %	188526969
123	NC_010698	ATCTT	2	10	159039	159048	20 %	60 %	0 %	20 %	188526970
124	NC_010698	TATCA	2	10	167404	167413	40 %	40 %	0 %	20 %	188526979
125	NC_010698	AGCAG	2	10	168061	168070	40 %	0 %	40 %	20 %	188526980
126	NC_010698	ATTTG	2	10	168412	168421	20 %	60 %	20 %	0 %	188526980
127	NC_010698	AATTG	2	10	168568	168577	40 %	40 %	20 %	0 %	188526981
128	NC_010698	TTTCT	2	10	169232	169241	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010698	AAATC	2	10	169581	169590	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010698	CAAAA	2	10	169599	169608	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010698	AAATG	2	10	169977	169986	60 %	20 %	20 %	0 %	188526983
132	NC_010698	TGTAA	2	10	170767	170776	40 %	40 %	20 %	0 %	188526984
133	NC_010698	ATAAA	2	10	172263	172272	80 %	20 %	0 %	0 %	188526985
134	NC_010698	GAATA	2	10	172560	172569	60 %	20 %	20 %	0 %	188526985
135	NC_010698	TTTAA	2	10	172626	172635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010698	AAAAG	2	10	173432	173441	80 %	0 %	20 %	0 %	188526987
137	NC_010698	ACCCC	2	10	173497	173506	20 %	0 %	0 %	80 %	188526987
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