MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 14429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010698	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526813
2	NC_010698	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526813
3	NC_010698	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526813
4	NC_010698	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526813
5	NC_010698	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188526813
6	NC_010698	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526814
7	NC_010698	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526814
8	NC_010698	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526814
9	NC_010698	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526814
10	NC_010698	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526814
11	NC_010698	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526815
12	NC_010698	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526815
13	NC_010698	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188526815
14	NC_010698	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188526815
15	NC_010698	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526815
16	NC_010698	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188526815
17	NC_010698	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526815
18	NC_010698	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526815
19	NC_010698	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526816
20	NC_010698	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526816
21	NC_010698	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526816
22	NC_010698	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526816
23	NC_010698	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526816
24	NC_010698	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526816
25	NC_010698	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526816
26	NC_010698	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526816
27	NC_010698	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188526817
28	NC_010698	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526817
29	NC_010698	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526817
30	NC_010698	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526817
31	NC_010698	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188526817
32	NC_010698	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526818
33	NC_010698	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526818
34	NC_010698	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526818
35	NC_010698	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188526818
36	NC_010698	TGT	2	6	7270	7275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526819
37	NC_010698	CAT	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526820
38	NC_010698	GCC	2	6	7365	7370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188526820
39	NC_010698	TCT	2	6	7426	7431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
40	NC_010698	AAT	2	6	7524	7529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526820
41	NC_010698	CTT	2	6	7532	7537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
42	NC_010698	CAT	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526820
43	NC_010698	ATG	2	6	7675	7680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526820
44	NC_010698	TCA	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526820
45	NC_010698	CCG	2	6	7753	7758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188526820
46	NC_010698	CTT	2	6	7772	7777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
47	NC_010698	TCA	2	6	7807	7812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526820
48	NC_010698	CAT	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526820
49	NC_010698	GTG	2	6	8008	8013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526820
50	NC_010698	TTC	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
51	NC_010698	TAA	2	6	8096	8101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526820
52	NC_010698	CCG	2	6	8107	8112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188526820
53	NC_010698	CAC	2	6	8208	8213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188526820
54	NC_010698	GAT	2	6	8250	8255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526820
55	NC_010698	TAG	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526820
56	NC_010698	CTT	2	6	8462	8467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
57	NC_010698	TCT	2	6	8572	8577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
58	NC_010698	TAA	2	6	8615	8620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526820
59	NC_010698	GCA	2	6	8746	8751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188526820
60	NC_010698	CTT	2	6	8771	8776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526820
61	NC_010698	ACA	2	6	9093	9098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526821
62	NC_010698	TCT	2	6	9127	9132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526821
63	NC_010698	CTT	2	6	9209	9214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526821
64	NC_010698	GAT	3	9	9297	9305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526821
65	NC_010698	TCT	2	6	9325	9330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526821
66	NC_010698	CTA	2	6	9341	9346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526821
67	NC_010698	TTG	2	6	9767	9772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526822
68	NC_010698	GAA	2	6	9783	9788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526822
69	NC_010698	TTA	2	6	9962	9967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526822
70	NC_010698	AGA	2	6	9977	9982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526822
71	NC_010698	ACC	2	6	9985	9990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188526822
72	NC_010698	AAG	2	6	10018	10023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526822
73	NC_010698	ATT	2	6	10051	10056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526822
74	NC_010698	CAT	2	6	10232	10237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526822
75	NC_010698	GTG	2	6	10266	10271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526822
76	NC_010698	ATG	2	6	10546	10551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526822
77	NC_010698	AGG	2	6	10611	10616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188526822
78	NC_010698	AAC	2	6	10638	10643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526822
79	NC_010698	AGA	2	6	11024	11029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526822
80	NC_010698	TTG	2	6	11037	11042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526822
81	NC_010698	GAC	2	6	11124	11129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188526822
82	NC_010698	TTA	3	9	11145	11153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526822
83	NC_010698	TTG	2	6	11202	11207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526822
84	NC_010698	TGT	2	6	11388	11393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526823
85	NC_010698	TGT	2	6	11556	11561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526823
86	NC_010698	AAG	2	6	11715	11720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526823
87	NC_010698	TGG	3	9	12126	12134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526823
88	NC_010698	GAA	3	9	12143	12151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526823
89	NC_010698	TGG	2	6	12225	12230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526823
90	NC_010698	AGA	2	6	12247	12252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526823
91	NC_010698	AGG	2	6	12472	12477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188526824
92	NC_010698	TTA	2	6	12559	12564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526825
93	NC_010698	GAA	2	6	12576	12581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526825
94	NC_010698	GTT	2	6	12643	12648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526825
95	NC_010698	ATT	2	6	12666	12671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526825
96	NC_010698	GAA	2	6	12872	12877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526825
97	NC_010698	AAT	2	6	12948	12953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188526825
98	NC_010698	CAA	2	6	13047	13052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526825
99	NC_010698	CTA	2	6	13105	13110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188526825
100	NC_010698	TTG	2	6	13192	13197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188526825
101	NC_010698	AGA	2	6	13244	13249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526825
102	NC_010698	GTG	2	6	13669	13674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526826
103	NC_010698	GAA	2	6	13760	13765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526827
104	NC_010698	ATT	3	9	13947	13955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526827
105	NC_010698	GAA	2	6	14086	14091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526828
106	NC_010698	AAC	2	6	14092	14097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526828
107	NC_010698	ATG	2	6	14111	14116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526828
108	NC_010698	TCC	2	6	14156	14161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188526828
109	NC_010698	CAA	2	6	14296	14301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526828
110	NC_010698	AAG	2	6	14357	14362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526828
111	NC_010698	TAG	2	6	14624	14629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526828
112	NC_010698	ATT	2	6	14681	14686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526828
113	NC_010698	CAA	2	6	14838	14843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526828
114	NC_010698	GCT	2	6	14904	14909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188526828
115	NC_010698	ACC	2	6	15119	15124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188526828
116	NC_010698	ATT	2	6	15242	15247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526828
117	NC_010698	AAG	2	6	15275	15280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526828
118	NC_010698	CAA	2	6	15288	15293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526828
119	NC_010698	ATG	2	6	15379	15384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188526828
120	NC_010698	CTT	2	6	15549	15554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526828
121	NC_010698	AAG	2	6	15590	15595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526828
122	NC_010698	AGA	2	6	15600	15605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526828
123	NC_010698	TAT	2	6	15853	15858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526828
124	NC_010698	AGA	2	6	15876	15881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526828
125	NC_010698	GTG	3	9	16003	16011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526828
126	NC_010698	TAT	2	6	16713	16718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526829
127	NC_010698	GAA	2	6	16719	16724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188526829
128	NC_010698	CTT	2	6	16837	16842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188526829
129	NC_010698	AAC	2	6	16864	16869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188526829
130	NC_010698	ATT	2	6	16984	16989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188526829
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500	NC_010698	GTG	2	6	60250	60255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188526872

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