MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 2338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010698	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	188526814
2	NC_010698	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	188526815
3	NC_010698	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	188526815
4	NC_010698	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	188526815
5	NC_010698	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	188526817
6	NC_010698	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	188526817
7	NC_010698	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	188526818
8	NC_010698	TC	3	6	4968	4973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010698	AC	3	6	6296	6301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010698	GA	5	10	7043	7052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010698	GC	3	6	7669	7674	0 %	0 %	50 %	50 %	188526820
12	NC_010698	AG	3	6	7881	7886	50 %	0 %	50 %	0 %	188526820
13	NC_010698	GA	3	6	8398	8403	50 %	0 %	50 %	0 %	188526820
14	NC_010698	AG	3	6	10079	10084	50 %	0 %	50 %	0 %	188526822
15	NC_010698	AG	3	6	10896	10901	50 %	0 %	50 %	0 %	188526822
16	NC_010698	AG	3	6	11474	11479	50 %	0 %	50 %	0 %	188526823
17	NC_010698	AG	3	6	11534	11539	50 %	0 %	50 %	0 %	188526823
18	NC_010698	AG	3	6	12361	12366	50 %	0 %	50 %	0 %	188526823
19	NC_010698	AG	3	6	12371	12376	50 %	0 %	50 %	0 %	188526823
20	NC_010698	GA	3	6	12544	12549	50 %	0 %	50 %	0 %	188526825
21	NC_010698	TG	3	6	13617	13622	0 %	50 %	50 %	0 %	188526826
22	NC_010698	GC	3	6	14260	14265	0 %	0 %	50 %	50 %	188526828
23	NC_010698	GC	3	6	14396	14401	0 %	0 %	50 %	50 %	188526828
24	NC_010698	CT	3	6	14476	14481	0 %	50 %	0 %	50 %	188526828
25	NC_010698	AG	3	6	14694	14699	50 %	0 %	50 %	0 %	188526828
26	NC_010698	AG	3	6	14862	14867	50 %	0 %	50 %	0 %	188526828
27	NC_010698	CA	3	6	16435	16440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010698	GC	3	6	16943	16948	0 %	0 %	50 %	50 %	188526829
29	NC_010698	CG	3	6	17049	17054	0 %	0 %	50 %	50 %	188526829
30	NC_010698	AG	3	6	18325	18330	50 %	0 %	50 %	0 %	188526830
31	NC_010698	CT	3	6	18688	18693	0 %	50 %	0 %	50 %	188526830
32	NC_010698	AG	3	6	19124	19129	50 %	0 %	50 %	0 %	188526831
33	NC_010698	GA	3	6	19315	19320	50 %	0 %	50 %	0 %	188526831
34	NC_010698	CT	3	6	19513	19518	0 %	50 %	0 %	50 %	188526831
35	NC_010698	GC	3	6	20706	20711	0 %	0 %	50 %	50 %	188526832
36	NC_010698	TC	3	6	23673	23678	0 %	50 %	0 %	50 %	188526834
37	NC_010698	AC	3	6	23764	23769	50 %	0 %	0 %	50 %	188526834
38	NC_010698	AT	3	6	24061	24066	50 %	50 %	0 %	0 %	188526834
39	NC_010698	GT	3	6	24432	24437	0 %	50 %	50 %	0 %	188526834
40	NC_010698	AG	3	6	25177	25182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010698	GC	3	6	25689	25694	0 %	0 %	50 %	50 %	188526836
42	NC_010698	CG	3	6	25762	25767	0 %	0 %	50 %	50 %	188526836
43	NC_010698	AT	3	6	25770	25775	50 %	50 %	0 %	0 %	188526836
44	NC_010698	GT	3	6	26022	26027	0 %	50 %	50 %	0 %	188526836
45	NC_010698	AG	3	6	26252	26257	50 %	0 %	50 %	0 %	188526836
46	NC_010698	CA	3	6	26403	26408	50 %	0 %	0 %	50 %	188526836
47	NC_010698	TA	3	6	26802	26807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010698	GA	3	6	26852	26857	50 %	0 %	50 %	0 %	188526837
49	NC_010698	TG	3	6	27261	27266	0 %	50 %	50 %	0 %	188526837
50	NC_010698	AG	3	6	27501	27506	50 %	0 %	50 %	0 %	188526837
51	NC_010698	AG	3	6	28616	28621	50 %	0 %	50 %	0 %	188526838
52	NC_010698	CT	3	6	29521	29526	0 %	50 %	0 %	50 %	188526840
53	NC_010698	AG	3	6	30518	30523	50 %	0 %	50 %	0 %	188526842
54	NC_010698	AT	3	6	31445	31450	50 %	50 %	0 %	0 %	188526843
55	NC_010698	AG	3	6	32413	32418	50 %	0 %	50 %	0 %	188526843
56	NC_010698	AG	3	6	32891	32896	50 %	0 %	50 %	0 %	188526844
57	NC_010698	GC	3	6	33663	33668	0 %	0 %	50 %	50 %	188526846
58	NC_010698	GC	3	6	34628	34633	0 %	0 %	50 %	50 %	188526847
59	NC_010698	CT	3	6	34759	34764	0 %	50 %	0 %	50 %	188526847
60	NC_010698	TG	3	6	34872	34877	0 %	50 %	50 %	0 %	188526847
61	NC_010698	TG	3	6	34956	34961	0 %	50 %	50 %	0 %	188526847
62	NC_010698	AT	3	6	35313	35318	50 %	50 %	0 %	0 %	188526847
63	NC_010698	AG	3	6	35756	35761	50 %	0 %	50 %	0 %	188526849
64	NC_010698	CT	3	6	37088	37093	0 %	50 %	0 %	50 %	188526850
65	NC_010698	CT	3	6	37160	37165	0 %	50 %	0 %	50 %	188526850
66	NC_010698	AG	3	6	38508	38513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010698	TG	3	6	38691	38696	0 %	50 %	50 %	0 %	188526852
68	NC_010698	AG	3	6	38733	38738	50 %	0 %	50 %	0 %	188526852
69	NC_010698	AG	3	6	38772	38777	50 %	0 %	50 %	0 %	188526852
70	NC_010698	GA	4	8	38827	38834	50 %	0 %	50 %	0 %	188526852
71	NC_010698	AG	3	6	39414	39419	50 %	0 %	50 %	0 %	188526852
72	NC_010698	AG	3	6	40489	40494	50 %	0 %	50 %	0 %	188526853
73	NC_010698	AG	3	6	41467	41472	50 %	0 %	50 %	0 %	188526854
74	NC_010698	CT	3	6	41528	41533	0 %	50 %	0 %	50 %	188526854
75	NC_010698	GC	3	6	42165	42170	0 %	0 %	50 %	50 %	188526855
76	NC_010698	AC	3	6	43635	43640	50 %	0 %	0 %	50 %	188526857
77	NC_010698	CT	3	6	43717	43722	0 %	50 %	0 %	50 %	188526857
78	NC_010698	CA	3	6	45263	45268	50 %	0 %	0 %	50 %	188526857
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80	NC_010698	GT	3	6	45952	45957	0 %	50 %	50 %	0 %	188526858
81	NC_010698	TG	3	6	46770	46775	0 %	50 %	50 %	0 %	188526859
82	NC_010698	GT	3	6	47530	47535	0 %	50 %	50 %	0 %	188526860
83	NC_010698	CT	4	8	47892	47899	0 %	50 %	0 %	50 %	188526860
84	NC_010698	TA	3	6	48071	48076	50 %	50 %	0 %	0 %	188526860
85	NC_010698	CT	3	6	48785	48790	0 %	50 %	0 %	50 %	188526862
86	NC_010698	CT	3	6	49400	49405	0 %	50 %	0 %	50 %	188526862
87	NC_010698	GC	3	6	49428	49433	0 %	0 %	50 %	50 %	188526862
88	NC_010698	AC	3	6	49510	49515	50 %	0 %	0 %	50 %	188526862
89	NC_010698	CG	3	6	50054	50059	0 %	0 %	50 %	50 %	188526864
90	NC_010698	GC	3	6	51065	51070	0 %	0 %	50 %	50 %	188526864
91	NC_010698	TG	3	6	51092	51097	0 %	50 %	50 %	0 %	188526864
92	NC_010698	CG	3	6	51914	51919	0 %	0 %	50 %	50 %	188526865
93	NC_010698	GT	3	6	51933	51938	0 %	50 %	50 %	0 %	188526865
94	NC_010698	GC	3	6	56196	56201	0 %	0 %	50 %	50 %	188526869
95	NC_010698	GA	3	6	56583	56588	50 %	0 %	50 %	0 %	188526869
96	NC_010698	TA	3	6	57690	57695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010698	AG	3	6	58326	58331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010698	GT	3	6	58404	58409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010698	AG	4	8	58811	58818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010698	CG	3	6	59702	59707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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102	NC_010698	GC	3	6	60183	60188	0 %	0 %	50 %	50 %	188526872
103	NC_010698	TC	3	6	60341	60346	0 %	50 %	0 %	50 %	188526872
104	NC_010698	TG	3	6	61022	61027	0 %	50 %	50 %	0 %	188526873
105	NC_010698	AG	3	6	61788	61793	50 %	0 %	50 %	0 %	188526874
106	NC_010698	GA	4	8	62367	62374	50 %	0 %	50 %	0 %	188526875
107	NC_010698	AG	3	6	63277	63282	50 %	0 %	50 %	0 %	188526877
108	NC_010698	TG	3	6	64286	64291	0 %	50 %	50 %	0 %	188526878
109	NC_010698	TG	4	8	64624	64631	0 %	50 %	50 %	0 %	188526878
110	NC_010698	CG	3	6	67215	67220	0 %	0 %	50 %	50 %	188526881
111	NC_010698	GC	3	6	69214	69219	0 %	0 %	50 %	50 %	188526883
112	NC_010698	TA	4	8	69605	69612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010698	GT	3	6	69881	69886	0 %	50 %	50 %	0 %	188526884
114	NC_010698	GC	3	6	70624	70629	0 %	0 %	50 %	50 %	188526885
115	NC_010698	GA	3	6	71158	71163	50 %	0 %	50 %	0 %	188526885
116	NC_010698	TC	3	6	71447	71452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010698	AG	4	8	71520	71527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010698	GA	3	6	74290	74295	50 %	0 %	50 %	0 %	188526888
119	NC_010698	GC	3	6	75373	75378	0 %	0 %	50 %	50 %	188526888
120	NC_010698	AG	3	6	75638	75643	50 %	0 %	50 %	0 %	188526888
121	NC_010698	CA	3	6	75865	75870	50 %	0 %	0 %	50 %	188526888
122	NC_010698	AG	3	6	75984	75989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010698	AG	3	6	76011	76016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010698	GA	3	6	76044	76049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010698	AG	3	6	77520	77525	50 %	0 %	50 %	0 %	188526893
126	NC_010698	TG	4	8	78885	78892	0 %	50 %	50 %	0 %	188526894
127	NC_010698	GA	3	6	79599	79604	50 %	0 %	50 %	0 %	188526894
128	NC_010698	CT	3	6	79856	79861	0 %	50 %	0 %	50 %	188526894
129	NC_010698	CT	3	6	81960	81965	0 %	50 %	0 %	50 %	188526895
130	NC_010698	TG	3	6	81981	81986	0 %	50 %	50 %	0 %	188526895
131	NC_010698	CA	3	6	82347	82352	50 %	0 %	0 %	50 %	188526896
132	NC_010698	CA	3	6	82375	82380	50 %	0 %	0 %	50 %	188526896
133	NC_010698	AC	3	6	83037	83042	50 %	0 %	0 %	50 %	188526897
134	NC_010698	CT	3	6	83441	83446	0 %	50 %	0 %	50 %	188526897
135	NC_010698	CT	3	6	83696	83701	0 %	50 %	0 %	50 %	188526897
136	NC_010698	AG	3	6	84208	84213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010698	AT	3	6	84254	84259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010698	CA	3	6	84443	84448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010698	TG	3	6	85655	85660	0 %	50 %	50 %	0 %	188526898
140	NC_010698	CT	3	6	87188	87193	0 %	50 %	0 %	50 %	188526900
141	NC_010698	TA	3	6	87527	87532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010698	CG	3	6	88199	88204	0 %	0 %	50 %	50 %	188526901
143	NC_010698	GT	3	6	89598	89603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010698	AC	3	6	90636	90641	50 %	0 %	0 %	50 %	188526903
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