MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET49

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010697	AAGGG	2	10	839	848	40 %	0 %	60 %	0 %	189017122
2	NC_010697	AGTTA	2	10	1371	1380	40 %	40 %	20 %	0 %	189017123
3	NC_010697	GAACT	2	10	1686	1695	40 %	20 %	20 %	20 %	189017124
4	NC_010697	GAAAA	2	10	3779	3788	80 %	0 %	20 %	0 %	189017128
5	NC_010697	TCTGT	2	10	6083	6092	0 %	60 %	20 %	20 %	189017130
6	NC_010697	TGGGA	2	10	7650	7659	20 %	20 %	60 %	0 %	189017132
7	NC_010697	AAACA	2	10	8701	8710	80 %	0 %	0 %	20 %	189017133
8	NC_010697	AAAAG	2	10	9987	9996	80 %	0 %	20 %	0 %	189017135
9	NC_010697	GGTAA	2	10	13523	13532	40 %	20 %	40 %	0 %	189017137
10	NC_010697	TAAAT	2	10	13719	13728	60 %	40 %	0 %	0 %	189017138
11	NC_010697	TTATG	2	10	13782	13791	20 %	60 %	20 %	0 %	189017138
12	NC_010697	AATAA	2	10	14130	14139	80 %	20 %	0 %	0 %	189017139
13	NC_010697	TCGGT	2	10	14572	14581	0 %	40 %	40 %	20 %	189017139
14	NC_010697	TCAGA	2	10	17016	17025	40 %	20 %	20 %	20 %	189017141
15	NC_010697	ATCGA	2	10	18792	18801	40 %	20 %	20 %	20 %	189017143
16	NC_010697	AGAGC	2	10	18883	18892	40 %	0 %	40 %	20 %	189017143
17	NC_010697	TACGA	2	10	18967	18976	40 %	20 %	20 %	20 %	189017143
18	NC_010697	CTGGA	2	10	19769	19778	20 %	20 %	40 %	20 %	189017143
19	NC_010697	AAACG	2	10	21425	21434	60 %	0 %	20 %	20 %	189017145
20	NC_010697	TGGCG	2	10	22260	22269	0 %	20 %	60 %	20 %	189017146
21	NC_010697	CGTTA	2	10	22513	22522	20 %	40 %	20 %	20 %	189017146
22	NC_010697	TCAAC	2	10	22878	22887	40 %	20 %	0 %	40 %	189017147
23	NC_010697	GAAAA	2	10	28308	28317	80 %	0 %	20 %	0 %	189017154
24	NC_010697	AAAGG	2	10	29420	29429	60 %	0 %	40 %	0 %	189017154
25	NC_010697	TGGTC	2	10	31127	31136	0 %	40 %	40 %	20 %	189017155
26	NC_010697	TGAAG	2	10	31479	31488	40 %	20 %	40 %	0 %	189017156
27	NC_010697	GCTTT	2	10	33314	33323	0 %	60 %	20 %	20 %	189017160
28	NC_010697	CAAAA	2	10	35453	35462	80 %	0 %	0 %	20 %	189017164
29	NC_010697	TACTT	2	10	41134	41143	20 %	60 %	0 %	20 %	189017171
30	NC_010697	TGAAA	2	10	41818	41827	60 %	20 %	20 %	0 %	189017171
31	NC_010697	AGCGA	2	10	44224	44233	40 %	0 %	40 %	20 %	189017176
32	NC_010697	TTCTG	2	10	44283	44292	0 %	60 %	20 %	20 %	189017176
33	NC_010697	AAAAG	2	10	44424	44433	80 %	0 %	20 %	0 %	189017176
34	NC_010697	CAATT	2	10	44710	44719	40 %	40 %	0 %	20 %	189017177

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.