MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 chromosome

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010694	AATCAA	2	12	40169	40180	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010694	CCCGGC	2	12	86643	86654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010694	GTGAAT	2	12	132247	132258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010694	CAACGC	2	12	189616	189627	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010694	TTCGGT	2	12	190771	190782	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010694	TTACCT	2	12	235077	235088	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010694	AATCAT	2	12	416890	416901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010694	GTTGCA	2	12	427613	427624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010694	GGTCAA	2	12	436384	436395	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010694	TTCAAG	2	12	436420	436431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010694	AGGTCA	2	12	436693	436704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010694	GTTGAT	2	12	457133	457144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010694	ATAAAT	2	12	561893	561904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010694	AAATAT	2	12	572588	572599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010694	ATGAGA	2	12	614724	614735	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010694	CTGGTG	2	12	623877	623888	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010694	TAAAAG	2	12	657041	657052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010694	AGATAA	2	12	661042	661053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010694	TTACAT	2	12	664191	664202	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010694	AATGAT	2	12	666927	666938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010694	ATCATT	2	12	666957	666968	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010694	TGTAAT	2	12	714873	714884	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010694	ATCGTT	2	12	721078	721089	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010694	GGGTGG	2	12	725574	725585	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010694	ATATTT	2	12	831160	831171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010694	AACTGC	2	12	875219	875230	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010694	GGTGAT	2	12	936211	936222	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010694	GATTTT	2	12	941072	941083	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010694	GTTAAC	2	12	942043	942054	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010694	CGCTAA	2	12	945999	946010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010694	CATTTT	2	12	1120893	1120904	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010694	AATATA	2	12	1259788	1259799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010694	TTAAGA	2	12	1293339	1293350	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010694	AATGAT	2	12	1372337	1372348	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010694	GCTGAA	2	12	1383967	1383978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010694	ATAAAA	2	12	1384876	1384887	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010694	GCAACA	2	12	1385084	1385095	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010694	CCAGCA	7	42	1409793	1409834	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010694	CTCGCG	2	12	1431985	1431996	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010694	GCAGAG	2	12	1465848	1465859	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010694	AGATTA	2	12	1508266	1508277	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010694	GTGATG	2	12	1533496	1533507	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010694	AATAGC	2	12	1595363	1595374	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010694	AATAAG	2	12	1608278	1608289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010694	GCTCGC	2	12	1609295	1609306	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010694	GATAAT	2	12	1626819	1626830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010694	AGTAAA	2	12	1644392	1644403	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010694	ATTAAT	2	12	1685829	1685840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010694	GACGTT	2	12	1730934	1730945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010694	GTTACG	2	12	1737652	1737663	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010694	TCTTAA	2	12	1781455	1781466	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010694	ATTTTT	2	12	1781493	1781504	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010694	AGGTAA	2	12	1825266	1825277	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010694	CCCGGT	2	12	1832902	1832913	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010694	CCGGTT	2	12	1838621	1838632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010694	CGATCG	2	12	1923422	1923433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010694	TCAGGT	2	12	1930033	1930044	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010694	TCTTAT	2	12	1939203	1939214	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010694	AAAAAT	2	12	1939254	1939265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010694	TCACTC	2	12	1964221	1964232	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010694	TTTTCC	2	12	1978117	1978128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010694	GGCAAC	2	12	2118258	2118269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010694	GTTAAC	2	12	2142862	2142873	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010694	GTTAAC	2	12	2142926	2142937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010694	AATAAC	2	12	2170157	2170168	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010694	TCTGCC	2	12	2182941	2182952	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010694	GCTGGC	2	12	2208299	2208310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010694	GTGGGC	2	12	2209065	2209076	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010694	CTCACC	2	12	2210628	2210639	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010694	CGCTGA	2	12	2210686	2210697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010694	CACCCT	2	12	2212307	2212318	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010694	CGGCAA	2	12	2213810	2213821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010694	AGCGTC	2	12	2215713	2215724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010694	CAGAGC	2	12	2215947	2215958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010694	CGTCGG	3	18	2216663	2216680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010694	AACGGC	2	12	2216745	2216756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010694	CAACGC	2	12	2246957	2246968	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010694	TGCGCC	2	12	2311048	2311059	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010694	TTTTTC	2	12	2328902	2328913	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010694	TCGTCT	2	12	2341422	2341433	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010694	AAGGAA	2	12	2458224	2458235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010694	GATAAG	2	12	2492363	2492374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010694	GACAAT	2	12	2499512	2499523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010694	ATAAAA	2	12	2576935	2576946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010694	TTAAAT	2	12	2582375	2582386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010694	GGCAGT	2	12	2626756	2626767	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010694	TAACAT	2	12	2647745	2647756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010694	AAAATG	2	12	2677457	2677468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010694	ATATTT	2	12	2695675	2695686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010694	AATTTT	2	12	2716058	2716069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010694	GCTAAA	2	12	2725096	2725107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010694	TGTTTT	2	12	2727638	2727649	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010694	TTCAGA	2	12	2731626	2731637	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010694	GATTTT	2	12	2735492	2735503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010694	TCAGTG	2	12	2869150	2869161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010694	TTTTCG	2	12	2876615	2876626	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010694	AACTGA	2	12	2939888	2939899	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010694	AAAGCC	2	12	2954901	2954912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010694	CATTTT	2	12	2994766	2994777	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010694	ACGCGG	2	12	3049635	3049646	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010694	TTCCCG	2	12	3134484	3134495	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010694	TGAAAC	2	12	3142925	3142936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010694	CCTCAT	2	12	3157148	3157159	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010694	AAAATT	2	12	3174036	3174047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010694	TTCATT	2	12	3188991	3189002	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010694	ATTTGT	2	12	3196159	3196170	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010694	ACTTCA	2	12	3206950	3206961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010694	AAAATA	2	12	3219452	3219463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010694	ACGGCA	2	12	3219800	3219811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010694	GCAGCC	2	12	3229686	3229697	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010694	TTGAGT	2	12	3229903	3229914	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010694	TGATAA	2	12	3301782	3301793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010694	ATAAAA	2	12	3314683	3314694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010694	ATTTTA	2	12	3315688	3315699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010694	CCTTTT	2	12	3323781	3323792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010694	ATTTTG	2	12	3339352	3339363	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010694	TGCGGC	2	12	3341909	3341920	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010694	CAAAAA	2	12	3349702	3349713	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_010694	TTTTCC	2	12	3370398	3370409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010694	CGTCAT	2	12	3397576	3397587	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010694	TAAATT	2	12	3421592	3421603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010694	GGCTGA	3	18	3443824	3443841	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010694	CGGCAG	2	12	3446496	3446507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010694	TGGTTA	2	12	3487627	3487638	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010694	TGCCCT	2	12	3518341	3518352	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010694	AATAGG	2	12	3577481	3577492	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010694	AAAGAT	2	12	3599058	3599069	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010694	TCAGCA	2	12	3629557	3629568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010694	TTTCCC	2	12	3691419	3691430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010694	ACTGGC	2	12	3698342	3698353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010694	TGGAAC	2	12	3708607	3708618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_010694	AATGAG	3	18	3733858	3733875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010694	GGCCAG	2	12	3764846	3764857	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010694	CCCCTT	2	12	3816626	3816637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_010694	GCTCTG	2	12	3818309	3818320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010694	ACACAA	2	12	3825361	3825372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010694	GGATAA	2	12	3827213	3827224	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010694	CGACAG	2	12	3828985	3828996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010694	AAGGGA	2	12	3842644	3842655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.