MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET46

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010693	GCGTT	2	10	1527	1536	0 %	40 %	40 %	20 %	188535865
2	NC_010693	CTGGC	2	10	1655	1664	0 %	20 %	40 %	40 %	188535865
3	NC_010693	AGTAA	2	10	1872	1881	60 %	20 %	20 %	0 %	188535865
4	NC_010693	GGCGC	2	10	4036	4045	0 %	0 %	60 %	40 %	188535867
5	NC_010693	AAATG	2	10	5046	5055	60 %	20 %	20 %	0 %	188535867
6	NC_010693	ATTTA	2	10	5201	5210	40 %	60 %	0 %	0 %	188535868
7	NC_010693	CCATT	2	10	6719	6728	20 %	40 %	0 %	40 %	188535871
8	NC_010693	TTATT	2	10	7558	7567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010693	TGCCT	2	10	8999	9008	0 %	40 %	20 %	40 %	188535872
10	NC_010693	ACCTC	2	10	9216	9225	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_010693	TAAAT	2	10	9243	9252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010693	TGGAC	2	10	9947	9956	20 %	20 %	40 %	20 %	188535873
13	NC_010693	TACCT	2	10	10917	10926	20 %	40 %	0 %	40 %	188535874
14	NC_010693	TAACT	2	10	11323	11332	40 %	40 %	0 %	20 %	188535874
15	NC_010693	CCGTT	2	10	12085	12094	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_010693	TTTCT	2	10	13254	13263	0 %	80 %	0 %	20 %	188535876
17	NC_010693	GGTTT	2	10	15746	15755	0 %	60 %	40 %	0 %	188535878
18	NC_010693	ACGCA	2	10	16623	16632	40 %	0 %	20 %	40 %	188535878
19	NC_010693	GGTCA	2	10	17686	17695	20 %	20 %	40 %	20 %	188535878
20	NC_010693	GATCA	2	10	18939	18948	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010693	TCTTG	2	10	19340	19349	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010693	GATTT	2	10	20351	20360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010693	ACAGC	2	10	22131	22140	40 %	0 %	20 %	40 %	188535880
24	NC_010693	TGGCT	2	10	22450	22459	0 %	40 %	40 %	20 %	188535880
25	NC_010693	CATTT	2	10	22597	22606	20 %	60 %	0 %	20 %	188535880
26	NC_010693	AAGTT	2	10	23009	23018	40 %	40 %	20 %	0 %	188535880
27	NC_010693	TTTTG	2	10	23259	23268	0 %	80 %	20 %	0 %	188535880
28	NC_010693	CCATG	2	10	24296	24305	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_010693	GCCCA	2	10	24351	24360	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_010693	AGCTG	2	10	24938	24947	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010693	CACTA	2	10	26397	26406	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_010693	CCTGG	2	10	28068	28077	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_010693	TCTCC	2	10	33035	33044	0 %	40 %	0 %	60 %	188535887
34	NC_010693	TACCA	2	10	34303	34312	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_010693	TCCAG	2	10	34590	34599	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010693	AAAAG	2	10	35463	35472	80 %	0 %	20 %	0 %	188535888
37	NC_010693	TTTTA	2	10	36757	36766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010693	CTGAA	2	10	37051	37060	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010693	TGTGC	2	10	38182	38191	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010693	GCCAT	2	10	40329	40338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_010693	CGTGG	2	10	43846	43855	0 %	20 %	60 %	20 %	188535899
42	NC_010693	ACGCC	2	10	44420	44429	20 %	0 %	20 %	60 %	188535900
43	NC_010693	AGTTA	2	10	45747	45756	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.