MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET46

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010693	CCGC	2	8	125	132	0 %	0 %	25 %	75 %	188535864
2	NC_010693	TCTT	2	8	409	416	0 %	75 %	0 %	25 %	188535864
3	NC_010693	GACC	2	8	831	838	25 %	0 %	25 %	50 %	188535864
4	NC_010693	CGAC	2	8	892	899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010693	CTTT	2	8	1140	1147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010693	AAAG	2	8	1191	1198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010693	GAAA	2	8	1390	1397	75 %	0 %	25 %	0 %	188535865
8	NC_010693	GCAC	2	8	1412	1419	25 %	0 %	25 %	50 %	188535865
9	NC_010693	AGGG	2	8	1665	1672	25 %	0 %	75 %	0 %	188535865
10	NC_010693	TGGC	2	8	1757	1764	0 %	25 %	50 %	25 %	188535865
11	NC_010693	TGTA	2	8	1859	1866	25 %	50 %	25 %	0 %	188535865
12	NC_010693	GAAC	2	8	2443	2450	50 %	0 %	25 %	25 %	188535866
13	NC_010693	GGAT	2	8	2506	2513	25 %	25 %	50 %	0 %	188535866
14	NC_010693	ACCT	2	8	2813	2820	25 %	25 %	0 %	50 %	188535866
15	NC_010693	CAGT	2	8	2879	2886	25 %	25 %	25 %	25 %	188535866
16	NC_010693	GAAG	2	8	2983	2990	50 %	0 %	50 %	0 %	188535866
17	NC_010693	TTAA	2	8	3462	3469	50 %	50 %	0 %	0 %	188535867
18	NC_010693	CGGG	2	8	4160	4167	0 %	0 %	75 %	25 %	188535867
19	NC_010693	CAGG	2	8	4523	4530	25 %	0 %	50 %	25 %	188535867
20	NC_010693	TGGT	2	8	4703	4710	0 %	50 %	50 %	0 %	188535867
21	NC_010693	GCAA	2	8	4846	4853	50 %	0 %	25 %	25 %	188535867
22	NC_010693	ATGA	2	8	5480	5487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010693	GTTC	2	8	5593	5600	0 %	50 %	25 %	25 %	188535869
24	NC_010693	TCAA	2	8	6148	6155	50 %	25 %	0 %	25 %	188535869
25	NC_010693	CGCT	2	8	6631	6638	0 %	25 %	25 %	50 %	188535871
26	NC_010693	GAAA	2	8	6670	6677	75 %	0 %	25 %	0 %	188535871
27	NC_010693	CTTT	2	8	6863	6870	0 %	75 %	0 %	25 %	188535871
28	NC_010693	CGGC	2	8	6940	6947	0 %	0 %	50 %	50 %	188535871
29	NC_010693	GCTG	2	8	7078	7085	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010693	GAAA	2	8	7334	7341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010693	TGAT	2	8	7378	7385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010693	GATG	2	8	7436	7443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010693	CAGC	2	8	7658	7665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010693	TAAT	2	8	8348	8355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010693	TGTT	2	8	9832	9839	0 %	75 %	25 %	0 %	188535873
36	NC_010693	TCAA	2	8	9860	9867	50 %	25 %	0 %	25 %	188535873
37	NC_010693	GTCA	2	8	9887	9894	25 %	25 %	25 %	25 %	188535873
38	NC_010693	AATT	2	8	9985	9992	50 %	50 %	0 %	0 %	188535873
39	NC_010693	TCGC	2	8	10167	10174	0 %	25 %	25 %	50 %	188535873
40	NC_010693	AAGT	2	8	11802	11809	50 %	25 %	25 %	0 %	188535875
41	NC_010693	GTTG	2	8	11852	11859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010693	CTGA	2	8	11889	11896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010693	CGCT	2	8	12213	12220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010693	GCTG	2	8	12338	12345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010693	ACTG	2	8	12738	12745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010693	GTTG	2	8	13097	13104	0 %	50 %	50 %	0 %	188535876
47	NC_010693	CTTC	2	8	13246	13253	0 %	50 %	0 %	50 %	188535876
48	NC_010693	AAGG	2	8	13466	13473	50 %	0 %	50 %	0 %	188535876
49	NC_010693	TATT	2	8	13873	13880	25 %	75 %	0 %	0 %	188535876
50	NC_010693	GAGT	2	8	13945	13952	25 %	25 %	50 %	0 %	188535876
51	NC_010693	ATGT	2	8	14403	14410	25 %	50 %	25 %	0 %	188535876
52	NC_010693	AGTC	2	8	15215	15222	25 %	25 %	25 %	25 %	188535877
53	NC_010693	AGAA	2	8	15968	15975	75 %	0 %	25 %	0 %	188535878
54	NC_010693	ACTG	2	8	16446	16453	25 %	25 %	25 %	25 %	188535878
55	NC_010693	GGCA	2	8	16604	16611	25 %	0 %	50 %	25 %	188535878
56	NC_010693	AAGA	2	8	16881	16888	75 %	0 %	25 %	0 %	188535878
57	NC_010693	CCCG	2	8	17411	17418	0 %	0 %	25 %	75 %	188535878
58	NC_010693	AAAG	2	8	18418	18425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010693	GCTG	2	8	18524	18531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010693	ACAG	2	8	18626	18633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010693	CTCC	2	8	18772	18779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_010693	CAAT	2	8	19132	19139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010693	GCAG	2	8	19853	19860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010693	AATG	2	8	19892	19899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010693	GCCT	2	8	19911	19918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010693	AAAT	2	8	20338	20345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010693	ATTC	2	8	20664	20671	25 %	50 %	0 %	25 %	188535879
68	NC_010693	AATA	2	8	20749	20756	75 %	25 %	0 %	0 %	188535879
69	NC_010693	AGGA	2	8	20812	20819	50 %	0 %	50 %	0 %	188535879
70	NC_010693	TAAC	2	8	20859	20866	50 %	25 %	0 %	25 %	188535879
71	NC_010693	ATAA	2	8	21867	21874	75 %	25 %	0 %	0 %	188535880
72	NC_010693	TAAT	2	8	21891	21898	50 %	50 %	0 %	0 %	188535880
73	NC_010693	ATTT	2	8	22168	22175	25 %	75 %	0 %	0 %	188535880
74	NC_010693	CTAT	2	8	22400	22407	25 %	50 %	0 %	25 %	188535880
75	NC_010693	TAAA	2	8	22510	22517	75 %	25 %	0 %	0 %	188535880
76	NC_010693	TTTC	2	8	22970	22977	0 %	75 %	0 %	25 %	188535880
77	NC_010693	GAGC	2	8	23175	23182	25 %	0 %	50 %	25 %	188535880
78	NC_010693	ATTG	2	8	23190	23197	25 %	50 %	25 %	0 %	188535880
79	NC_010693	ACCG	2	8	23317	23324	25 %	0 %	25 %	50 %	188535881
80	NC_010693	TAAA	2	8	23502	23509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010693	GCCA	2	8	23880	23887	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010693	CTGC	2	8	24227	24234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010693	TTCG	2	8	25540	25547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010693	AGCA	2	8	25633	25640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010693	GCCT	2	8	25703	25710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010693	CAGG	2	8	26527	26534	25 %	0 %	50 %	25 %	188535883
87	NC_010693	CGGT	2	8	27447	27454	0 %	25 %	50 %	25 %	188535883
88	NC_010693	CTGG	2	8	28241	28248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010693	GCTC	2	8	28461	28468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010693	CGAT	2	8	29152	29159	25 %	25 %	25 %	25 %	188535884
91	NC_010693	CTTT	2	8	29452	29459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010693	ATTA	2	8	29919	29926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010693	TCAG	2	8	30657	30664	25 %	25 %	25 %	25 %	188535885
94	NC_010693	TACA	2	8	31187	31194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010693	CTTA	2	8	31256	31263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010693	GACT	2	8	31992	31999	25 %	25 %	25 %	25 %	188535886
97	NC_010693	TACG	2	8	32630	32637	25 %	25 %	25 %	25 %	188535887
98	NC_010693	AACA	2	8	32748	32755	75 %	0 %	0 %	25 %	188535887
99	NC_010693	TGAC	2	8	32830	32837	25 %	25 %	25 %	25 %	188535887
100	NC_010693	AGAA	2	8	32956	32963	75 %	0 %	25 %	0 %	188535887
101	NC_010693	AAAT	2	8	33438	33445	75 %	25 %	0 %	0 %	188535887
102	NC_010693	TTAC	2	8	33916	33923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010693	CTCA	2	8	35073	35080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010693	GAAT	2	8	35336	35343	50 %	25 %	25 %	0 %	188535888
105	NC_010693	TTAG	2	8	35383	35390	25 %	50 %	25 %	0 %	188535888
106	NC_010693	CGGC	2	8	35606	35613	0 %	0 %	50 %	50 %	188535888
107	NC_010693	AAAG	2	8	35682	35689	75 %	0 %	25 %	0 %	188535888
108	NC_010693	TAAA	2	8	35743	35750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010693	CAGG	2	8	35764	35771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010693	AAAT	2	8	35885	35892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010693	TCAA	2	8	35966	35973	50 %	25 %	0 %	25 %	188535889
112	NC_010693	GAAA	2	8	36460	36467	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010693	TATT	2	8	36590	36597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010693	AGTG	2	8	36629	36636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010693	GACG	2	8	37002	37009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010693	GCAC	2	8	37268	37275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010693	CCCG	2	8	38258	38265	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_010693	AGCC	2	8	39223	39230	25 %	0 %	25 %	50 %	188535893
119	NC_010693	TGGC	2	8	39233	39240	0 %	25 %	50 %	25 %	188535893
120	NC_010693	GCTG	2	8	39321	39328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010693	GCAT	2	8	39872	39879	25 %	25 %	25 %	25 %	188535894
122	NC_010693	AAAG	2	8	41635	41642	75 %	0 %	25 %	0 %	188535896
123	NC_010693	GCGA	2	8	42083	42090	25 %	0 %	50 %	25 %	188535896
124	NC_010693	TCAT	2	8	42413	42420	25 %	50 %	0 %	25 %	188535896
125	NC_010693	CGAG	2	8	42455	42462	25 %	0 %	50 %	25 %	188535896
126	NC_010693	CAGT	2	8	42567	42574	25 %	25 %	25 %	25 %	188535896
127	NC_010693	CAGG	2	8	42804	42811	25 %	0 %	50 %	25 %	188535896
128	NC_010693	TGTC	2	8	43064	43071	0 %	50 %	25 %	25 %	188535897
129	NC_010693	AAAT	2	8	43278	43285	75 %	25 %	0 %	0 %	188535897
130	NC_010693	ATAC	2	8	43347	43354	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010693	CCCA	2	8	44049	44056	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_010693	TCCC	2	8	44189	44196	0 %	25 %	0 %	75 %	188535900
133	NC_010693	CGGG	2	8	44236	44243	0 %	0 %	75 %	25 %	188535900
134	NC_010693	ACAA	2	8	45295	45302	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010693	ATTG	2	8	45710	45717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010693	CTGA	2	8	45794	45801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010693	CGGC	2	8	46032	46039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.