MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100 chromosome

Total Repeats: 4632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010688	GCCTG	2	10	779	788	0 %	20 %	40 %	40 %	188989397
2	NC_010688	ACCAC	2	10	1223	1232	40 %	0 %	0 %	60 %	188989397
3	NC_010688	CCGCG	2	10	7219	7228	0 %	0 %	40 %	60 %	188989400
4	NC_010688	TGCGG	2	10	9444	9453	0 %	20 %	60 %	20 %	188989403
5	NC_010688	CAACA	2	10	12954	12963	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010688	GCGAT	2	10	13112	13121	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010688	ATCGC	2	10	13314	13323	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010688	GCCCC	2	10	14050	14059	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_010688	GCCGC	2	10	14297	14306	0 %	0 %	40 %	60 %	188989409
10	NC_010688	CCATG	2	10	19937	19946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_010688	ACGCG	2	10	20751	20760	20 %	0 %	40 %	40 %	188989415
12	NC_010688	CCGCG	2	10	21618	21627	0 %	0 %	40 %	60 %	188989416
13	NC_010688	CGGTG	2	10	21997	22006	0 %	20 %	60 %	20 %	188989416
14	NC_010688	CGGCC	2	10	22156	22165	0 %	0 %	40 %	60 %	188989416
15	NC_010688	GCCCT	2	10	22281	22290	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_010688	CCTGC	2	10	22672	22681	0 %	20 %	20 %	60 %	188989418
17	NC_010688	TGGCG	2	10	22900	22909	0 %	20 %	60 %	20 %	188989418
18	NC_010688	GTTGC	2	10	23631	23640	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010688	TCGGC	2	10	24632	24641	0 %	20 %	40 %	40 %	188989420
20	NC_010688	TGCGC	2	10	27237	27246	0 %	20 %	40 %	40 %	188989421
21	NC_010688	CGGGT	2	10	27710	27719	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010688	CGGGC	2	10	28775	28784	0 %	0 %	60 %	40 %	188989423
23	NC_010688	CCAGC	2	10	31714	31723	20 %	0 %	20 %	60 %	188989425
24	NC_010688	CTTGC	2	10	33280	33289	0 %	40 %	20 %	40 %	188989426
25	NC_010688	CGCAG	2	10	34056	34065	20 %	0 %	40 %	40 %	188989426
26	NC_010688	CCAGC	2	10	34855	34864	20 %	0 %	20 %	60 %	188989427
27	NC_010688	TGCGC	2	10	36748	36757	0 %	20 %	40 %	40 %	188989428
28	NC_010688	GCCGC	2	10	36845	36854	0 %	0 %	40 %	60 %	188989428
29	NC_010688	CGCGA	2	10	37595	37604	20 %	0 %	40 %	40 %	188989429
30	NC_010688	GGTTA	2	10	38479	38488	20 %	40 %	40 %	0 %	188989431
31	NC_010688	CTGGT	2	10	38842	38851	0 %	40 %	40 %	20 %	188989432
32	NC_010688	GCCGG	2	10	39706	39715	0 %	0 %	60 %	40 %	188989432
33	NC_010688	AGGCC	2	10	40560	40569	20 %	0 %	40 %	40 %	188989433
34	NC_010688	CGCAG	2	10	42810	42819	20 %	0 %	40 %	40 %	188989433
35	NC_010688	CGCTG	2	10	44118	44127	0 %	20 %	40 %	40 %	188989433
36	NC_010688	CGGCG	2	10	44241	44250	0 %	0 %	60 %	40 %	188989433
37	NC_010688	CAGCG	2	10	44626	44635	20 %	0 %	40 %	40 %	188989433
38	NC_010688	CAGGC	2	10	45321	45330	20 %	0 %	40 %	40 %	188989434
39	NC_010688	CCGGC	2	10	45457	45466	0 %	0 %	40 %	60 %	188989435
40	NC_010688	CAGCC	2	10	48083	48092	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_010688	GGTGA	2	10	48434	48443	20 %	20 %	60 %	0 %	188989437
42	NC_010688	AGTGG	2	10	49596	49605	20 %	20 %	60 %	0 %	188989438
43	NC_010688	GCTCG	2	10	50019	50028	0 %	20 %	40 %	40 %	188989438
44	NC_010688	GCCAC	2	10	50255	50264	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_010688	TGCAG	2	10	50282	50291	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010688	ACCGC	2	10	54536	54545	20 %	0 %	20 %	60 %	188989443
47	NC_010688	GCGCA	2	10	55008	55017	20 %	0 %	40 %	40 %	188989444
48	NC_010688	TAGCG	2	10	55474	55483	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010688	CGGTG	2	10	55741	55750	0 %	20 %	60 %	20 %	188989445
50	NC_010688	CGTGG	2	10	55795	55804	0 %	20 %	60 %	20 %	188989445
51	NC_010688	GTGGC	2	10	56757	56766	0 %	20 %	60 %	20 %	188989446
52	NC_010688	ACGAC	2	10	57611	57620	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_010688	GCATC	2	10	58242	58251	20 %	20 %	20 %	40 %	188989447
54	NC_010688	TGGTC	2	10	58952	58961	0 %	40 %	40 %	20 %	188989447
55	NC_010688	GGCAA	2	10	59583	59592	40 %	0 %	40 %	20 %	188989448
56	NC_010688	TGGCC	2	10	59723	59732	0 %	20 %	40 %	40 %	188989449
57	NC_010688	CCCAG	2	10	61714	61723	20 %	0 %	20 %	60 %	188989451
58	NC_010688	GCGCG	2	10	63070	63079	0 %	0 %	60 %	40 %	188989451
59	NC_010688	GCGCA	2	10	63917	63926	20 %	0 %	40 %	40 %	188989451
60	NC_010688	GGCCG	2	10	64175	64184	0 %	0 %	60 %	40 %	188989451
61	NC_010688	ATTAA	2	10	64277	64286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010688	CGGCG	2	10	65384	65393	0 %	0 %	60 %	40 %	188989452
63	NC_010688	CCGCG	2	10	67570	67579	0 %	0 %	40 %	60 %	188989453
64	NC_010688	GCGCG	2	10	68923	68932	0 %	0 %	60 %	40 %	188989454
65	NC_010688	GCTGG	2	10	68946	68955	0 %	20 %	60 %	20 %	188989454
66	NC_010688	CGCAA	2	10	73194	73203	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_010688	GCGGG	2	10	75978	75987	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010688	CGGCG	2	10	76194	76203	0 %	0 %	60 %	40 %	188989460
69	NC_010688	CGCCA	2	10	77424	77433	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_010688	GTTGA	2	10	78267	78276	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010688	AGATG	2	10	78950	78959	40 %	20 %	40 %	0 %	188989463
72	NC_010688	CCCAA	2	10	80888	80897	40 %	0 %	0 %	60 %	188989465
73	NC_010688	TCTTG	2	10	82467	82476	0 %	60 %	20 %	20 %	188989468
74	NC_010688	AAGAA	2	10	84309	84318	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010688	GCGCG	2	10	84364	84373	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_010688	TGGCT	2	10	85098	85107	0 %	40 %	40 %	20 %	188989471
77	NC_010688	ACCAA	2	10	86565	86574	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_010688	GTCGC	2	10	86645	86654	0 %	20 %	40 %	40 %	188989474
79	NC_010688	GCTGG	2	10	86917	86926	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010688	ACGGT	2	10	90330	90339	20 %	20 %	40 %	20 %	188989478
81	NC_010688	AGCGC	2	10	90464	90473	20 %	0 %	40 %	40 %	188989478
82	NC_010688	CGCTG	2	10	90555	90564	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_010688	GCGGG	2	10	91491	91500	0 %	0 %	80 %	20 %	188989479
84	NC_010688	GCCAC	2	10	91610	91619	20 %	0 %	20 %	60 %	188989479
85	NC_010688	CGGCG	2	10	92708	92717	0 %	0 %	60 %	40 %	188989480
86	NC_010688	CCGGC	2	10	93039	93048	0 %	0 %	40 %	60 %	188989481
87	NC_010688	GTCCA	2	10	93058	93067	20 %	20 %	20 %	40 %	188989481
88	NC_010688	CGGTG	2	10	94772	94781	0 %	20 %	60 %	20 %	188989483
89	NC_010688	GGCCG	2	10	94991	95000	0 %	0 %	60 %	40 %	188989483
90	NC_010688	GGTGG	2	10	95094	95103	0 %	20 %	80 %	0 %	188989483
91	NC_010688	TGCAA	2	10	95730	95739	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010688	TGCGC	2	10	95772	95781	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010688	CTGCG	2	10	96613	96622	0 %	20 %	40 %	40 %	188989484
94	NC_010688	CCGCA	2	10	97307	97316	20 %	0 %	20 %	60 %	188989485
95	NC_010688	CCGAC	2	10	97414	97423	20 %	0 %	20 %	60 %	188989485
96	NC_010688	GCAAT	2	10	98835	98844	40 %	20 %	20 %	20 %	188989487
97	NC_010688	TGCCC	2	10	100261	100270	0 %	20 %	20 %	60 %	188989488
98	NC_010688	TCCAG	2	10	100531	100540	20 %	20 %	20 %	40 %	188989488
99	NC_010688	CGCAG	2	10	100852	100861	20 %	0 %	40 %	40 %	188989489
100	NC_010688	CGATG	2	10	102326	102335	20 %	20 %	40 %	20 %	188989490
101	NC_010688	CTGTC	2	10	102544	102553	0 %	40 %	20 %	40 %	188989491
102	NC_010688	CAGGG	2	10	104305	104314	20 %	0 %	60 %	20 %	188989491
103	NC_010688	GCGCG	2	10	105006	105015	0 %	0 %	60 %	40 %	188989492
104	NC_010688	GCGGG	2	10	105615	105624	0 %	0 %	80 %	20 %	188989492
105	NC_010688	GGCCG	2	10	105724	105733	0 %	0 %	60 %	40 %	188989492
106	NC_010688	ACCAC	2	10	107174	107183	40 %	0 %	0 %	60 %	188989493
107	NC_010688	CGGCA	2	10	107781	107790	20 %	0 %	40 %	40 %	188989493
108	NC_010688	CAGCG	3	15	107797	107811	20 %	0 %	40 %	40 %	188989493
109	NC_010688	GCGCC	2	10	107835	107844	0 %	0 %	40 %	60 %	188989493
110	NC_010688	GCGCA	2	10	108790	108799	20 %	0 %	40 %	40 %	188989494
111	NC_010688	ACGGC	2	10	108994	109003	20 %	0 %	40 %	40 %	188989495
112	NC_010688	CGGCG	2	10	112182	112191	0 %	0 %	60 %	40 %	188989497
113	NC_010688	AGCCC	2	10	113366	113375	20 %	0 %	20 %	60 %	188989498
114	NC_010688	CACTG	2	10	118637	118646	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_010688	GCACG	2	10	119767	119776	20 %	0 %	40 %	40 %	188989502
116	NC_010688	GGTGC	2	10	120660	120669	0 %	20 %	60 %	20 %	188989503
117	NC_010688	CAGCG	2	10	120990	120999	20 %	0 %	40 %	40 %	188989503
118	NC_010688	CACCG	2	10	121176	121185	20 %	0 %	20 %	60 %	188989503
119	NC_010688	TGCGC	2	10	121226	121235	0 %	20 %	40 %	40 %	188989503
120	NC_010688	GAGCT	2	10	121728	121737	20 %	20 %	40 %	20 %	188989503
121	NC_010688	CACCG	2	10	121847	121856	20 %	0 %	20 %	60 %	188989503
122	NC_010688	CCCGG	2	10	122151	122160	0 %	0 %	40 %	60 %	188989503
123	NC_010688	CACAA	2	10	125533	125542	60 %	0 %	0 %	40 %	188989507
124	NC_010688	CGGCG	2	10	126691	126700	0 %	0 %	60 %	40 %	188989509
125	NC_010688	TCCGC	2	10	127168	127177	0 %	20 %	20 %	60 %	188989510
126	NC_010688	ATCGA	2	10	127527	127536	40 %	20 %	20 %	20 %	188989510
127	NC_010688	CGGGG	2	10	128162	128171	0 %	0 %	80 %	20 %	188989511
128	NC_010688	CGCTG	2	10	130747	130756	0 %	20 %	40 %	40 %	188989511
129	NC_010688	TCGGC	2	10	131311	131320	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_010688	CAGAC	2	10	131471	131480	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_010688	CGCGT	2	10	133372	133381	0 %	20 %	40 %	40 %	188989513
132	NC_010688	GGTCG	2	10	135374	135383	0 %	20 %	60 %	20 %	188989515
133	NC_010688	GCCGC	2	10	135995	136004	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_010688	TGAAC	2	10	136771	136780	40 %	20 %	20 %	20 %	188989516
135	NC_010688	CGCTG	2	10	137002	137011	0 %	20 %	40 %	40 %	188989517
136	NC_010688	TGTCC	2	10	137885	137894	0 %	40 %	20 %	40 %	188989519
137	NC_010688	GCCAA	2	10	138978	138987	40 %	0 %	20 %	40 %	188989519
138	NC_010688	CCAGC	2	10	139347	139356	20 %	0 %	20 %	60 %	188989519
139	NC_010688	GCGCC	2	10	139485	139494	0 %	0 %	40 %	60 %	188989519
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152	NC_010688	TGCCC	2	10	155908	155917	0 %	20 %	20 %	60 %	188989529
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255	NC_010688	AGCGC	2	10	262877	262886	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
256	NC_010688	TGCGG	2	10	263956	263965	0 %	20 %	60 %	20 %	188989629
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